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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G396210
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 99518942-99520542 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1368 bp · TkA07G396210|TK1151|cDNA

ATGGCAAATCGAGACATGCCAGTAAATGGAAAGCACTCCAAACTTTCCCTCCATGAAGATGGTAATCTTGTTTTACAGGATGCAGATAAGTCTATTGTTTGGGAAACAGAGACAAAAGCTAGTACTAATGGTTCAAGATTCAGTTTAGTACTTAAAGATGATGGAAATCTTGTTCTTCGTGACCTAAATGGAGATCAAGACCTGCTTTGGCAAAGCTTTGATCATCCGACGGACACGCTTTTACCTGATCAACTGTTCAC...

CDS

下载 CDS FASTA

1368 bp · TkA07G396210|TK1151|CDS

ATGGCAAATCGAGACATGCCAGTAAATGGAAAGCACTCCAAACTTTCCCTCCATGAAGATGGTAATCTTGTTTTACAGGATGCAGATAAGTCTATTGTTTGGGAAACAGAGACAAAAGCTAGTACTAATGGTTCAAGATTCAGTTTAGTACTTAAAGATGATGGAAATCTTGTTCTTCGTGACCTAAATGGAGATCAAGACCTGCTTTGGCAAAGCTTTGATCATCCGACGGACACGCTTTTACCTGATCAACTGTTCAC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

455 aa · TkA07G396210|TK1151|PROTEIN

MANRDMPVNGKHSKLSLHEDGNLVLQDADKSIVWETETKASTNGSRFSLVLKDDGNLVLRDLNGDQDLLWQSFDHPTDTLLPDQLFTKNSQLISSRSNVNFSSGFYRLYFENDNVLSLLYNNPEITSVYWPPPYLRPWEADRSTYDNSRIAKLDSKGQFESSDDLRFNVSDFGMKRQRIMKLDFDGNIRVYSHVDSKEGKKWEVKWQAISSPCKIHGVCGPNSLCTYSQQAGRKCTCLHGYKKKNSKTDWADGCEPIFKS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G396210
TK1151 IDTkA07G396210
OH-1004 IDLXL04_030307
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)62.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.780 / OH-1004 43.600
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G396210
位置Chr07:99518942-99520542 (-)
描述Similar to PK1: Putative receptor protein kinase ZmPK1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g19130 G型凝集素S受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At2g19130。 暂无已核实直接文献
At4g00340 丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶。 暂无已核实直接文献
At1g61440 G型凝集素S受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At1g61440。 暂无已核实直接文献
At4g32300 G型凝集素S受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶SD2-5。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_030307 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0048544 recognition of pollen 生物过程
GO:0051707 response to other organism 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0004672 protein kinase activity 分子功能
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005516 calmodulin binding 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G34300
ath:AT4G00340
ath:AT5G24080
zma:542378
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞外0.466
排名 1 · TkA07G396210 · TK1151
细胞膜0.278
排名 2 · TkA07G396210 · TK1151
内质网0.103
排名 3 · TkA07G396210 · TK1151
细胞质0.079
排名 4 · TkA07G396210 · TK1151
溶酶体／液泡0.049
排名 5 · TkA07G396210 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01453B_lectin1-91 aa
PF00954S_locus_glycop12-40 aa
PF25857DUF795719-65 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr166-208 aa
PF25857DUF7957173-210 aa
PF01453B_lectin174-213 aa
PF00954S_locus_glycop176-244 aa
PF12947EGF_3216-242 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G396210PF01453B_lectin1914.4e-2588.9
TkA07G396210PF00954S_locus_glycop12406.3e-0937.1
TkA07G396210PF25857DUF795719650.2412.3
TkA07G396210PF07714PK_Tyr_Ser-Thr1662081.2e-1558.3
TkA07G396210PF25857DUF79571732100.2412.3
TkA07G396210PF01453B_lectin1742134.4e-2588.9
TkA07G396210PF00954S_locus_glycop1762446.3e-0937.1
TkA07G396210PF12947EGF_32162420.04214.8
TkA07G396210PF29991RIPR_EGF-like_10th2162466.87.6
TkA07G396210PF08276PAN_22182377.6e-0523.5
TkA07G396210PF08276PAN_22653087.6e-0523.5
TkA07G396210PF00024PAN_12683080.000321.3
TkA07G396210PF00954S_locus_glycop2913086.3e-0937.1
TkA07G396210PF29991RIPR_EGF-like_10th2983076.87.6
TkA07G396210PF12947EGF_32993060.04214.8
TkA07G396210PF07714PK_Tyr_Ser-Thr3614491.2e-1558.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O64477拟南芥sp|O64477|Y2913_ARATH G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At2g1913026.000%Swiss-Prot低置信
Q39203拟南芥sp|Q39203|SD22_ARATH G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase SD2-226.500%Swiss-Prot低置信
O64776拟南芥sp|O64776|Y1144_ARATH G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g6144026.700%Swiss-Prot低置信
Q8RWZ5拟南芥sp|Q8RWZ5|SD25_ARATH G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase SD2-524.900%Swiss-Prot低置信

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