基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
TkA07G387830
当前版本: TK1151
染色体: Chr07
坐标: 97272402-97275533
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA2026 bp · TkA07G387830|TK1151|cDNA
AAGTAACTTTTTAAATCCGATTAAACGCATTCCTTTCGACAACGATTCACCCCCATTGCTATTAGCAAATAGCAATGAACGCGCTTACAACCTGGTGTCGCTTGTTGTTTTCCAATCAATTCTAGAATTTCAGTTCATTCCACTTCAACTTCCAGATCCAAAAACAAACCCTAGATTCGATTCAATCGTTTATCGCCTCAATTTGCTCCACTTGCTTATTCCAGTTATCACCAAATCAAGTAAGAATTCAATTGCTCTTT...
CDS
下载 CDS FASTA654 bp · TkA07G387830|TK1151|CDS
ATGAATGTAGCTTCTACAGAAACTGCAGATATTCTTAGGGGAATGGGGATTATGTATCGACATCTGGTATGCATCAAGAATCTTACCAATGTAAAGGACAGAGGCGTTCACCAGAGGAATACAGCACTTGAACACATTGAGCACCATAAGCTTGATGGAATTGTCTATTTTGCAGATGATGATAACATCTACTCGCTTGAATTGTTTGAAACTTTGAGAGACATCAGTCGTTTTGGCACATGGCCAGTTGCAATGCTAGC...
217 aa · TkA07G387830|TK1151|PROTEIN
MNVASTETADILRGMGIMYRHLVCIKNLTNVKDRGVHQRNTALEHIEHHKLDGIVYFADDDNIYSLELFETLRDISRFGTWPVAMLAQSKNKAVLEGPVCNGSQVIGWHTNEKSKRLRRFHVDMSGFAFNSTILWDPKRWQKPISPSIRQLDTIKETTFIEQLVEDESQMEGTPFGCSKIMNWHLHLEAGEGGYPRGWLLQNNLDADSDVDAVLPIE
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | TkA07G387830 |
|---|---|
| TK1151 ID | TkA07G387830 |
| OH-1004 ID | LXL04_030242 |
| 关系 / 置信度 | 序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核 |
| 蛋白一致性 (%) | 97.700 |
| 蛋白覆盖度 (%) | TK1151 100.000 / OH-1004 55.808覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。 |
| 版本 | TK1151 / GWHBCHF00000000 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | TkA07G387830 | |||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr07:97272402-97275533 (+) | |||||||||||||||||||||
| 描述 | Similar to IRX9H: Probable beta-1,4-xylosyltransferase IRX9H | |||||||||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻
| |||||||||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | |||||||||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0009834 plant-type secondary cell wall biogenesis 生物过程 GO:0010417 glucuronoxylan biosynthetic process 生物过程 GO:0010584 pollen exine formation 生物过程 GO:0045492 xylan biosynthetic process 生物过程 GO:0071555 cell wall organization 生物过程 GO:0000139 Golgi membrane 细胞组分 GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分 GO:0015018 galactosylgalactosylxylosylprotein 3-beta-glucuronosyltransferase activity 分子功能 GO:0042285 xylosyltransferase activity 分子功能 | |||||||||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G27600 dosa:Os01g0675500 dosa:Os04g0103100 dosa:Os05g0559600 dosa:Os10g0205300 osa:4325514 osa:4348270 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
高尔基体0.766
内质网0.101
细胞外0.091
细胞质0.066
细胞膜0.055
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF03360Glyco_transf_435-188 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| TkA07G387830 | PF03360 | Glyco_transf_43 | 5 | 188 | 2.5e-63 | 214.4 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q9SXC4 | 拟南芥 | sp|Q9SXC4|IRX9H_ARATH Probable beta-1,4-xylosyltransferase IRX9H | 78.000% | Swiss-Prot | 高置信 |
Q8S626 | 水稻 | sp|Q8S626|GT102_ORYSJ Probable glucuronosyltransferase Os10g0205300 | 58.200% | Swiss-Prot | 高置信 |
Q5QM25 | 水稻 | sp|Q5QM25|IRX9L_ORYSJ Probable beta-1,4-xylosyltransferase IRX9L | 55.800% | Swiss-Prot | 高置信 |
Q7XTB2 | 水稻 | sp|Q7XTB2|GT43H_ORYSJ Probable glucuronosyltransferase Os04g0103100 | 46.800% | Swiss-Prot | 中等置信 |
Q6AT32 | 水稻 | sp|Q6AT32|GT43E_ORYSJ Probable beta-1,4-xylosyltransferase GT43E | 48.800% | Swiss-Prot | 中等置信 |