RubberDandelionOmics 橡胶草多组学网站
更多
转录组数据查询 注释 橡胶合成 转录因子预测 靶基因 蛋白关联网络 重测序 工具 下载
ZH EN

本页使用教程

基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G374010
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 93824105-93828302 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

478 bp · TkA07G374010|TK1151|cDNA

AAAATATAAAACATAGACCATAGATCAAAATCATGTATGCATTTCATGTTATTAAATGGCTATAAATACGTACGATGATCCAAGAGCCTAAACCACAATAATCCCCTGGAACCAAATATAAAGTGCTAGCCCTCTATAACCATATATAGGCATGGCCTTCTTCAAAGCTTCATGCTTAGCAACACTGTTTTTTGCATTATTATCATGCAATTTGAGAGCTTCAGAAGCTCAAACACCAGCAGTGACAGACGGACTGTCTT...

CDS

下载 CDS FASTA

1056 bp · TkA07G374010|TK1151|CDS

ATGGCCTTCTTCAAAGCTTCATGCTTAGCAACACTGTTTTTTGCATTATTATCATGCAATTTGAGAGCTTCAGAAGCTCAAACACCAGCAGTGACAGACGGACTGTCTTTTACATTTCATGAAAATACTTGTCCACAGCTAGAATCCATTGTGCGGCAACAACTTCTGGCCGATTTTGCTTCTGATATAGGCCAAGCTGCTGGTTTGCTTCGACTTCATTTCCACGATTGCTTTGTTCAAGGTTGTGATGGCTCGGTGTT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

351 aa · TkA07G374010|TK1151|PROTEIN

MAFFKASCLATLFFALLSCNLRASEAQTPAVTDGLSFTFHENTCPQLESIVRQQLLADFASDIGQAAGLLRLHFHDCFVQGCDGSVLLINSTSGPDEQDAPPNLTLRSQAFAIIENLRALVHSACNQTVSCSDITALAARDAVFLSGGPNYSIPLGRRDGLNFATINETLANLPAPTADTTALLTSLATKGFDTTDVVALSGGHTIGIANCGSFVGRIIPTQDPTLNETLAIDLRNTCPTNVTSNTTFMDVLSPNAFDNS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G374010
TK1151 IDTkA07G374010
OH-1004 IDLXL04_030061
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G374010
位置Chr07:93824105-93828302 (+)
描述Similar to PER12: Peroxidase 12
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g71695 去除 H(2)O(2)，氧化有毒还原剂，木质素的生物合成与降解，角质化，生长素分解，对如创伤、病原体侵染和氧化应激等环境胁迫的响应。 暂无已核实直接文献
At5g06730 去除 H(2)O(2)，氧化有毒还原剂，木质素的生物合成与降解，角质化，生长素分解，对如创伤、病原体侵染和氧化应激等环境胁迫的响应。 暂无已核实直接文献
At3g21770 去除 H(2)O(2)，氧化有毒还原剂，木质素的生物合成与降解，角质化，生长素分解，对如创伤、病原体侵染和氧化应激等环境胁迫的响应。 暂无已核实直接文献
At3g32980 去除 H(2)O(2)，氧化有毒还原剂，木质素的生物合成与降解，角质化，生长素分解，对如创伤、病原体侵染和氧化应激等环境胁迫的响应。 暂无已核实直接文献
At5g64120 去除 H(2)O(2)，氧化有毒还原剂，木质素的生物合成与降解，角质化，生长素分解，对如创伤、病原体侵染和氧化应激等环境胁迫的响应。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os07g0677200 去除 H(2)O(2)，氧化有毒还原剂，木质素的生物合成与降解，角质化，生长素分解，对如创伤、病原体侵染和氧化应激等环境胁迫的响应。 暂无已核实直接文献
Os05g0499300 去除 H(2)O(2)，氧化有毒还原剂，木质素的生物合成与降解，角质化，生长素分解，对如创伤、病原体侵染和氧化应激等环境胁迫的响应。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_030061 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006950 response to stress 生物过程
GO:0006979 response to oxidative stress 生物过程
GO:0042744 hydrogen peroxide catabolic process 生物过程
GO:0051707 response to other organism 生物过程
GO:0080001 mucilage extrusion from seed coat 生物过程
GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0009505 plant-type cell wall 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
GO:0004601 peroxidase activity 分子功能
GO:0005509 calcium ion binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G71695
ath:AT2G18150
ath:AT4G36430
dosa:Os05g0499300
sbi:8074114
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞外0.346
排名 1 · TkA07G374010 · TK1151
细胞膜0.161
排名 2 · TkA07G374010 · TK1151
溶酶体／液泡0.146
排名 3 · TkA07G374010 · TK1151
内质网0.108
排名 4 · TkA07G374010 · TK1151
细胞质0.102
排名 5 · TkA07G374010 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00141peroxidase51-294 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G374010PF00141peroxidase512942e-77260.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q96520拟南芥sp|Q96520|PER12_ARATH Peroxidase 1260.300%Swiss-Prot高置信
Q9FG34拟南芥sp|Q9FG34|PER54_ARATH Peroxidase 5444.300%Swiss-Prot中等置信
Q9LSY7拟南芥sp|Q9LSY7|PER30_ARATH Peroxidase 3050.400%Swiss-Prot高置信
Q9LHB9拟南芥sp|Q9LHB9|PER32_ARATH Peroxidase 3245.300%Swiss-Prot中等置信
Q43387拟南芥sp|Q43387|PER71_ARATH Peroxidase 7140.200%Swiss-Prot中等置信
Q7F1U0水稻sp|Q7F1U0|PER22_ORYSJ Peroxidase 22.344.900%Swiss-Prot中等置信
P37834水稻sp|P37834|PER1_ORYSJ Peroxidase 144.900%Swiss-Prot中等置信

JBrowse

在基因组浏览器中查看