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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G347660
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 86886517-86888262 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1288 bp · TkA07G347660|TK1151|cDNA

CCCTCTCTTTCTATATAATCCCATTCATCACCCTCCCTCTGAATTATTGTCAAACGCTTTTCAATCTCCATATCCCAGATTCAAAGAGAGTGATTAGAGCTGTCTTTTTTATCGTCAAGTTTCAGTTGAATATACATACATAAACCCAGAAGAAGAAAGATAAATTTCTACTGTGAAATGATGGTTGAGAAGGAAGATTTGGGTTTGAGTCTTGGCTTGAACTTTCCGGCGACCTCGGAGAGGAATCCGTCGTCACTTCA...

CDS

下载 CDS FASTA

906 bp · TkA07G347660|TK1151|CDS

ATGATGGTTGAGAAGGAAGATTTGGGTTTGAGTCTTGGCTTGAACTTTCCGGCGACCTCGGAGAGGAATCCGTCGTCACTTCAGTTGAATCTGATGCCTTCTTTTGTTTCGTCGTCTCCGTCGTTCAATCTTCTTCATAGAACGCCTAACTGGTCCGATCCGTGCCCGTCTTCATCAGATCGGAACATCGCCGATGCATTTAAAGTGGAGACTAGGTCGTTCCTGAAAGGGATCGATGTGAACAGAATACCGCCGACAGC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

301 aa · TkA07G347660|TK1151|PROTEIN

MMVEKEDLGLSLGLNFPATSERNPSSLQLNLMPSFVSSSPSFNLLHRTPNWSDPCPSSSDRNIADAFKVETRSFLKGIDVNRIPPTAAEVEEEAGVSSPNSTISSISGKRSERDLPVNEQDGERASSRGMSDDEDGDNSRKKLRLSKDQSAVLEESFKEHNTLNPKQKLALAKRLGLRPRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKRCCENLTEENRRLQKELQELRALKLSPQFYMQMAPPTTLTMCPSCERVAAPPSS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G347660
TK1151 IDTkA07G347660
OH-1004 IDLXL04_029794
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G347660
位置Chr07:86886517-86888262 (+)
描述Similar to HAT4: Homeobox-leucine zipper protein HAT4
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g16780 可能负向调控细胞伸长及特定细胞增殖过程（如侧根形成和维管系统次生生长）的转录因子。
Negative autoregulation of the Arabidopsis homeobox gene ATHB-2.2001 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2001.00966.x
The HAT4 gene of Arabidopsis encodes a developmental regulator.1993 · DOI: 10.1101/gad.7.3.367
At4g17460 可能的转录因子。 暂无已核实直接文献
At5g47370 可能参与生长素介导形态建成的转录因子。
The HAT2 gene, a member of the HD-Zip gene family, isolated as an auxin inducible gene by DNA microarray screening, affects auxin response in Arabidopsis.2002 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2002.01488.x
At3g60390 可能的转录因子。 暂无已核实直接文献
At2g44910 可能的转录因子。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_029794 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0003006 developmental process involved in reproduction 生物过程
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0009585 red, far-red light phototransduction 生物过程
GO:0009641 shade avoidance 生物过程
GO:0009725 response to hormone 生物过程
GO:0009733 response to auxin 生物过程
GO:0009734 auxin-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009735 response to cytokinin 生物过程
GO:0009826 unidimensional cell growth 生物过程
GO:0010016 shoot system morphogenesis 生物过程
GO:0010017 red or far-red light signaling pathway 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G44910
ath:AT3G60390
ath:AT4G16780
ath:AT4G17460
ath:AT5G47370
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.982
排名 1 · TkA07G347660 · TK1151
细胞质0.072
排名 2 · TkA07G347660 · TK1151
细胞膜0.022
排名 3 · TkA07G347660 · TK1151
内质网0.014
排名 4 · TkA07G347660 · TK1151
质体0.010
排名 5 · TkA07G347660 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF04618HD-ZIP_N2-114 aa
PF05920Homeobox_KN50-61 aa
PF08961NRBF2124-229 aa
PF00046Homeodomain140-194 aa
PF24627PUMA_CC140-159 aa
PF27636CCPG1_N147-225 aa
PF05920Homeobox_KN165-192 aa
PF24627PUMA_CC191-227 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G347660PF04618HD-ZIP_N21142.7e-31109.0
TkA07G347660PF05920Homeobox_KN50610.000520.6
TkA07G347660PF08961NRBF21242290.311.3
TkA07G347660PF00046Homeodomain1401943.2e-1659.6
TkA07G347660PF24627PUMA_CC1401590.03714.8
TkA07G347660PF27636CCPG1_N1472250.6111.4
TkA07G347660PF05920Homeobox_KN1651920.000520.6
TkA07G347660PF24627PUMA_CC1912270.03714.8
TkA07G347660PF06156YabA1922300.04315.1
TkA07G347660PF02183HALZ1962305.6e-1143.1
TkA07G347660PF04618HD-ZIP_N2622692.7e-31109.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q05466拟南芥sp|Q05466|HAT4_ARATH Homeobox-leucine zipper protein HAT461.000%Swiss-Prot高置信
P46600拟南芥sp|P46600|HAT1_ARATH Homeobox-leucine zipper protein HAT155.600%Swiss-Prot高置信
P46601拟南芥sp|P46601|HAT2_ARATH Homeobox-leucine zipper protein HAT255.600%Swiss-Prot高置信
P46602拟南芥sp|P46602|HAT3_ARATH Homeobox-leucine zipper protein HAT356.000%Swiss-Prot高置信
P92953拟南芥sp|P92953|ATHB4_ARATH Homeobox-leucine zipper protein ATHB-460.800%Swiss-Prot高置信

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