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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G251360
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 62698685-62700317 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1541 bp · TkA07G251360|TK1151|cDNA

CGAATCCAAATATTGGTCCTACCTCAATTATGCAAGAAACGGGCAAACGACCCCACCACGCATTTTGGCTAAGACTCTGGTACGTGTCAGTCCCTGATTGGTTCTATACTCCGTTTGGATAGCGTCGCAGGATTGCGGAGAGAGAATGTGTATTCACTCAAGACCCAAAACCCATAACCAATTAAACAAACGCCAACACCAGTCTCCATGGGCAAACCAAGCTGGAACATGGCCGTGACCCTTTGTTATTCCTGCAAAAC...

CDS

下载 CDS FASTA

1122 bp · TkA07G251360|TK1151|CDS

ATGGGCAAACCAAGCTGGAACATGGCCGTGACCCTTTGTTATTCCTGCAAAACGAAGTCCGCCGCTTTGTTCTGTAAAGCAGACTCCGCCTTCCTCTGTATACCTTGCGACGGGAAGGTCCACGCCGCCAACAAACTCGCATCTCGCCACGCGCGTGTATGGATGTGTGAGGTGTGTGAGCAAGCTCCGGCGAGCGTCACCTGTAAGGCGGATGCTGCCACCCTCTGCGTTACCTGTGACCGCGATATCCATGCGGCCAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

373 aa · TkA07G251360|TK1151|PROTEIN

MGKPSWNMAVTLCYSCKTKSAALFCKADSAFLCIPCDGKVHAANKLASRHARVWMCEVCEQAPASVTCKADAATLCVTCDRDIHAANPLSRRHERFPVVPFYDPASSVSKMGGGGDNDHSDQHYLLDFDVNVGGTEAEEAEAASWLLPNPNLNKIPDGSENDNLKVKESESEYLFNEIDPYLDIDLKTPDQKPHQILRRYNSPTDGVVPVQNNNHQYQMPTHAHASPEVVEGLPAYDVDYTGSKPFMYNFTSQSVSQSVS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G251360
TK1151 IDTkA07G251360
OH-1004 IDLXL04_028931
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)99.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G251360
位置Chr07:62698685-62700317 (-)
描述Similar to COL4: Zinc finger protein CONSTANS-LIKE 4
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g24930 锌指蛋白 CONSTANS-LIKE 4。 暂无已核实直接文献
At5g57660 锌指蛋白 CONSTANS-LIKE 5。 暂无已核实直接文献
At2g24790 锌指蛋白CONSTANS-LIKE 3。 暂无已核实直接文献
At5g15850 假定转录因子，可能参与昼夜节律钟的光输入，但不影响开花时间。 暂无已核实直接文献
At3g02380 推测的转录因子。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_028931 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0007623 circadian rhythm 生物过程
GO:0009658 chloroplast organization 生物过程
GO:0009909 regulation of flower development 生物过程
GO:0010099 regulation of photomorphogenesis 生物过程
GO:0010161 red light signaling pathway 生物过程
GO:0032922 circadian regulation of gene expression 生物过程
GO:2000028 regulation of photoperiodism, flowering 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0016607 nuclear speck 细胞组分
GO:0000976 transcription cis-regulatory region binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G24790
ath:AT3G02380
ath:AT5G15850
ath:AT5G24930
ath:AT5G57660
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.829
排名 1 · TkA07G251360 · TK1151
细胞质0.227
排名 2 · TkA07G251360 · TK1151
细胞膜0.066
排名 3 · TkA07G251360 · TK1151
内质网0.051
排名 4 · TkA07G251360 · TK1151
溶酶体／液泡0.017
排名 5 · TkA07G251360 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00643zf-B_box11-49 aa
PF16366CEBP_ZZ11-50 aa
PF22586ANCHR-like_BBOX12-50 aa
PF23663Znf_SCAND312-19 aa
PF23663Znf_SCAND331-43 aa
PF00643zf-B_box53-97 aa
PF16366CEBP_ZZ55-93 aa
PF22586ANCHR-like_BBOX56-94 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G251360PF00643zf-B_box11499.4e-0832.8
TkA07G251360PF16366CEBP_ZZ11500.511.3
TkA07G251360PF22586ANCHR-like_BBOX12500.0003521.3
TkA07G251360PF23663Znf_SCAND312195.47.8
TkA07G251360PF23663Znf_SCAND331435.47.8
TkA07G251360PF00643zf-B_box53979.4e-0832.8
TkA07G251360PF16366CEBP_ZZ55930.511.3
TkA07G251360PF22586ANCHR-like_BBOX56940.0003521.3
TkA07G251360PF23663Znf_SCAND373855.47.8
TkA07G251360PF16366CEBP_ZZ1771830.511.3
TkA07G251360PF00643zf-B_box2862899.4e-0832.8
TkA07G251360PF06203CCT3073491.4e-1764.2
TkA07G251360PF09425Jas_motif3133290.1812.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q940T9拟南芥sp|Q940T9|COL4_ARATH Zinc finger protein CONSTANS-LIKE 449.600%Swiss-Prot中等置信
Q9FHH8拟南芥sp|Q9FHH8|COL5_ARATH Zinc finger protein CONSTANS-LIKE 544.000%Swiss-Prot中等置信
Q9SK53拟南芥sp|Q9SK53|COL3_ARATH Zinc finger protein CONSTANS-LIKE 345.100%Swiss-Prot中等置信
O50055拟南芥sp|O50055|COL1_ARATH Zinc finger protein CONSTANS-LIKE 144.500%Swiss-Prot中等置信
Q96502拟南芥sp|Q96502|COL2_ARATH Zinc finger protein CONSTANS-LIKE 243.500%Swiss-Prot中等置信

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