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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID,查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度,最大 10000 bp

基因概览

TkA07G170760
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 43840980-43854754 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

2911 bp · TkA07G170760|TK1151|cDNA

GTAAAGATTCTTCGTCTCTTCTCGTTCTCTCATTTCCATTATTAGTTTTCCTTTATTTTCTTAGAGTTGCGAAAATATACATACATACGCGTATCAGTCTCTAGATATTCTAAATCCCTTATCTGTCTCTAGATCCAAAATCCATCTTCATTTCCATCTCATCTCTACTTGAGCAAAAAACCCAATAAGGGTTCCTTTGATCTTTACATATATACAGTCAAATCTTTCGCCTCTACATAGTTATTCTAGAATAGTCATCA...

2730 bp · TkA07G170760|TK1151|CDS

GTCAATCAACAGTTGACTATTAGCGTTCAATATCATCCATATGGTGGAAGAAGTATTGCAAATTATACATCTGCTTCAAATTCTTCTTCATCAATAGTTATGTTCCCTGCTACGGGCGATGTCAAGGAATCTCAACCCTCCACGTCCTCCTCCATAGATATCTCACAGTCATGCCGTCACTTCCAATTTCCTGATATTCTCATAGCAACCAATAACTTTGACGAATCATTAGTAGTTGGGCACGGGGGATTTGGAAAAGT...

909 aa · TkA07G170760|TK1151|PROTEIN

VNQQLTISVQYHPYGGRSIANYTSASNSSSSIVMFPATGDVKESQPSTSSSIDISQSCRHFQFPDILIATNNFDESLVVGHGGFGKVYKGNIINGSSVTVAAIKRLDSMSNQGATEFWAEVEMLSKLRHSHLVSLLGYCKHENEMILVYEYMPNGTLEDHLHKLGTHLSWIQRLTICIGAARGLDYLHTGTGIGVGVIHRDVKSSNILLHESWAAKISDFGLSKIGPTNQPSTYVNTLVKGTFGYFDPHYYATGRLTRKS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G170760
TK1151 IDTkA07G170760
OH-1004 IDLXL04_032797
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)66.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 93.729 / OH-1004 49.341
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G170760
位置Chr07:43840980-43854754 (+)
描述Similar to MPK14: Mitogen-activated protein kinase 14
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g19010 丝裂原活化蛋白激酶16。 暂无已核实直接文献
At3g18040 丝裂原活化蛋白激酶9。 暂无已核实直接文献
At2g42880 丝裂原活化蛋白激酶 20。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os05g0143500 线粒体活化蛋白激酶14。 暂无已核实直接文献
Os11g0271100 丝裂原活化蛋白激酶 15。 暂无已核实直接文献
Os01g0629900 丝裂原活化蛋白激酶10。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源:OH1004 · LXL04_032797 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释(OH1004 来源)
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0035556 intracellular signal transduction 生物过程
GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0004707 MAP kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0106310 protein serine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT5G19010
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号,不代表本基因已获得通路功能验证。

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究;参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时,不自动选择表达记录;缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释,不能替代定位实验。

细胞质0.445
排名 1 · TkA07G170760 · TK1151
细胞膜0.410
排名 2 · TkA07G170760 · TK1151
细胞核0.267
排名 3 · TkA07G170760 · TK1151
高尔基体0.053
排名 4 · TkA07G170760 · TK1151
内质网0.049
排名 5 · TkA07G170760 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测,非定位实验结果

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069Pkinase78-342 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr78-343 aa
PF03109ABC182-100 aa
PF03109ABC1193-239 aa
PF14531Kinase-like195-293 aa
PF06293Kdo196-213 aa
PF01636APH196-227 aa
PF12330Haspin_kinase199-229 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G170760PF00069Pkinase783427.4e-107357.3
TkA07G170760PF07714PK_Tyr_Ser-Thr783431.3e-83281.0
TkA07G170760PF03109ABC1821003.6e-0523.8
TkA07G170760PF03109ABC11932393.6e-0523.8
TkA07G170760PF14531Kinase-like1952930.0003420.7
TkA07G170760PF06293Kdo1962138.1e-0522.9
TkA07G170760PF01636APH1962270.003517.9
TkA07G170760PF12330Haspin_kinase1992290.0003420.5
TkA07G170760PF00069Pkinase4687597.4e-107357.3
TkA07G170760PF07714PK_Tyr_Ser-Thr4696981.3e-83281.0
TkA07G170760PF06293Kdo4866068.1e-0522.9
TkA07G170760PF01636APH5075870.003517.9
TkA07G170760PF14531Kinase-like5736610.0003420.7
TkA07G170760PF03109ABC15836173.6e-0523.8
TkA07G170760PF01636APH5906180.003517.9
TkA07G170760PF12330Haspin_kinase5916310.0003420.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻;Swiss-Prot 为人工审校条目,TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8W4J2拟南芥sp|Q8W4J2|MPK16_ARATH Mitogen-activated protein kinase 1684.600%Swiss-Prot高置信
Q9LV37拟南芥sp|Q9LV37|MPK9_ARATH Mitogen-activated protein kinase 982.900%Swiss-Prot高置信
Q9SJG9拟南芥sp|Q9SJG9|MPK20_ARATH Mitogen-activated protein kinase 2080.600%Swiss-Prot低置信
Q75KK8水稻sp|Q75KK8|MPK14_ORYSJ Mitogen-activated protein kinase 1482.400%Swiss-Prot高置信
Q53N72水稻sp|Q53N72|MPK15_ORYSJ Mitogen-activated protein kinase 1583.100%Swiss-Prot高置信
Q5ZCI1水稻sp|Q5ZCI1|MPK10_ORYSJ Mitogen-activated protein kinase 1081.900%Swiss-Prot高置信

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