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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G170640
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 43807734-43810493 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1656 bp · TkA07G170640|TK1151|cDNA

ATGAAGGCCGACGACATGGCCACTTTGGAGATCAACTGTGTCATTCCCCCTGATGTGTTCGATCTGGTGGAAGACTGCGCGTCTTCCCACGAGACCTGGACAACCCTGCACCAACTTTTTGCAGGAACGGAGGCAGCCAAAGACAAGAAGATGACGTCTGCCTTGAACGCATTCTCAAACTTTAAAGCCCTTCCGAGTGAGAGCCTCCAGGACACCTTCAAGAGGTTCAAAGTTTGTATTTCCCGGTTAAAGAACTCCGG...

CDS

下载 CDS FASTA

1656 bp · TkA07G170640|TK1151|CDS

ATGAAGGCCGACGACATGGCCACTTTGGAGATCAACTGTGTCATTCCCCCTGATGTGTTCGATCTGGTGGAAGACTGCGCGTCTTCCCACGAGACCTGGACAACCCTGCACCAACTTTTTGCAGGAACGGAGGCAGCCAAAGACAAGAAGATGACGTCTGCCTTGAACGCATTCTCAAACTTTAAAGCCCTTCCGAGTGAGAGCCTCCAGGACACCTTCAAGAGGTTCAAAGTTTGTATTTCCCGGTTAAAGAACTCCGG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

551 aa · TkA07G170640|TK1151|PROTEIN

MKADDMATLEINCVIPPDVFDLVEDCASSHETWTTLHQLFAGTEAAKDKKMTSALNAFSNFKALPSESLQDTFKRFKVCISRLKNSGNEKSNLEVNLKFINSLGETWITVWMIIQGSGNLRKLSLSVCNDGKGFADDEEVRCHNCQGLNHFARDCKEKKKEEVTGSKAYYLAKLKELEDSEKAFMVMKQEPLDYQVWSDGDDDEEEEKVNCLMAVNVEKEVLKEITGVRGVVKKNYCFMVDSSKLSGVTVVEQVRIMISD...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G170640
TK1151 IDTkA07G170640
OH-1004 IDLXL04_029455
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)55.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 65.336 / OH-1004 16.569
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G170640
位置Chr07:43807734-43810493 (-)
描述Similar to RE1: Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon RE1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

当前来源表未检出该物种的同源命中。

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_029455 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006310 DNA recombination 生物过程
GO:0006508 proteolysis 生物过程
GO:0015074 DNA integration 生物过程
GO:0003676 nucleic acid binding 分子功能
GO:0003964 RNA-directed DNA polymerase activity 分子功能
GO:0004190 aspartic-type endopeptidase activity 分子功能
GO:0004519 endonuclease activity 分子功能
GO:0008270 zinc ion binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用暂无功能描述
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.695
排名 1 · TkA07G170640 · TK1151
细胞核0.293
排名 2 · TkA07G170640 · TK1151
细胞膜0.055
排名 3 · TkA07G170640 · TK1151
内质网0.054
排名 4 · TkA07G170640 · TK1151
线粒体0.052
排名 5 · TkA07G170640 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF14223Retrotran_gag_23-117 aa
PF29327VERU3_N44-73 aa
PF00727IL4137-178 aa
PF00098zf-CCHC141-157 aa
PF30379SLU7_N141-158 aa
PF21890Lin-28A-like_zf-CCHC_2141-155 aa
PF07335Glyco_hydro_75144-225 aa
PF14223Retrotran_gag_2203-226 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G170640PF14223Retrotran_gag_231179.4e-30104.3
TkA07G170640PF29327VERU3_N44730.06714.5
TkA07G170640PF00727IL41371780.8610.4
TkA07G170640PF00098zf-CCHC1411575.6e-0523.8
TkA07G170640PF30379SLU7_N1411580.4210.8
TkA07G170640PF21890Lin-28A-like_zf-CCHC_21411550.7610.7
TkA07G170640PF07335Glyco_hydro_751442250.1812.7
TkA07G170640PF14223Retrotran_gag_22032269.4e-30104.3
TkA07G170640PF00727IL42072550.8610.4
TkA07G170640PF00727IL42763230.8610.4
TkA07G170640PF14223Retrotran_gag_23975429.4e-30104.3
TkA07G170640PF21890Lin-28A-like_zf-CCHC_24344410.7610.7
TkA07G170640PF07335Glyco_hydro_754424870.1812.7
TkA07G170640PF29327VERU3_N4845350.06714.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

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