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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G058760
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 15559432-15564210 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2562 bp · TkA07G058760|TK1151|cDNA

CAGAACGATGAATCTATAACCAGCAGTAGCTTTCATCTATGACTGTTATAAAGAAATTCAAAAAAAGCATTTTATATCTGATTACTTTAATTTGCTCATTTGACTTATCTTGTCTGCGGATCTTCAAGAACTGCAGCTGATTGATCTCTAATAATTTCACACCATAACCCCTTTCATCTCTATCTTCTCCTCTTCCCCACCAAACTCTTTACCTCTGCAACAATGGCGGCAAGGAAACCTCCATCCGTACTGTTTCTAAC...

CDS

下载 CDS FASTA

1152 bp · TkA07G058760|TK1151|CDS

ATGGCAAAACTTCCTCACCTTCGATCCTTTGATGTTGCTTATAATCTCTTACAAGGCACAATACCGCCTGAATGGGGTTTAACACAGTTGCATGACATCTCGCTTCTTGGAAACCGGATAACAGGAGAAATTCCACCCGAAATAGGCAATATCACCACTCTCACTAGGCTGGACCTTGAAGCAAACCATCTTTCCGGAACTATTCCGCCTGATTTAGGAAAATTAATCAATTTGCAATCTTTGATATTGTCATCAAACCA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

383 aa · TkA07G058760|TK1151|PROTEIN

MAKLPHLRSFDVAYNLLQGTIPPEWGLTQLHDISLLGNRITGEIPPEIGNITTLTRLDLEANHLSGTIPPDLGKLINLQSLILSSNQFTGRLPIALGQLGNLTNFRINENNFSGPIPDFIQNWKLLSRLELMASGLTGPIPPSISLLENLLDLRISDISGPSQQFPPINNATGLIRLILRNCNISGEIPDYIWRVRELEMFDASFNNLVGRISNNILGRSIRYVFLTSNMLSGDIPENLLVNGASVDLSYNNFTWQEPDE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G058760
TK1151 IDTkA07G058760
OH-1004 IDLXL04_027433
关系 / 置信度序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)99.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 38.531
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G058760
位置Chr07:15559432-15564210 (-)
描述Similar to RKF1: Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase RFK1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g29750 可能的LRR受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶RFK1。 暂无已核实直接文献
At1g29720 可能的LRR受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶At1g29720。 暂无已核实直接文献
At1g53420 可能的 LRR 受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At1g53420。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_027433 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009861 jasmonic acid and ethylene-dependent systemic resistance 生物过程
GO:0031667 response to nutrient levels 生物过程
GO:0045088 regulation of innate immune response 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0004672 protein kinase activity 分子功能
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G07650
ath:AT1G29750
ath:AT1G53420
ath:AT1G53430
ath:AT3G14840
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.353
排名 1 · TkA07G058760 · TK1151
细胞外0.228
排名 2 · TkA07G058760 · TK1151
内质网0.114
排名 3 · TkA07G058760 · TK1151
细胞质0.093
排名 4 · TkA07G058760 · TK1151
细胞核0.063
排名 5 · TkA07G058760 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13855LRR_83-40 aa
PF13516LRR_64-15 aa
PF25013LRR_Zer-14-61 aa
PF12799LRR_45-41 aa
PF00560LRR_16-25 aa
PF23598LRR_1427-106 aa
PF00560LRR_130-50 aa
PF12799LRR_435-68 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G058760PF13855LRR_83403.1e-0627.6
TkA07G058760PF13516LRR_64150.03614.8
TkA07G058760PF25013LRR_Zer-14610.0514.5
TkA07G058760PF12799LRR_45415.5e-1246.2
TkA07G058760PF00560LRR_16258.1e-2376.3
TkA07G058760PF23598LRR_14271061.6e-0731.1
TkA07G058760PF00560LRR_130508.1e-2376.3
TkA07G058760PF12799LRR_435685.5e-1246.2
TkA07G058760PF13516LRR_636430.03614.8
TkA07G058760PF25013LRR_Zer-150850.0514.5
TkA07G058760PF12799LRR_452865.5e-1246.2
TkA07G058760PF13516LRR_652660.03614.8
TkA07G058760PF13855LRR_8531123.1e-0627.6
TkA07G058760PF00560LRR_154758.1e-2376.3
TkA07G058760PF13516LRR_676900.03614.8
TkA07G058760PF00560LRR_177998.1e-2376.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FXF2拟南芥sp|Q9FXF2|RKF1_ARATH Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase RFK150.900%Swiss-Prot低置信
Q9ASQ6拟南芥sp|Q9ASQ6|Y1972_ARATH Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g2972037.600%Swiss-Prot中等置信
C0LGG7拟南芥sp|C0LGG7|Y1534_ARATH Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g5342029.700%Swiss-Prot低置信

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