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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G029740
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 7956303-7960062 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1608 bp · TkA07G029740|TK1151|cDNA

AAGAAAGTTAGAACTAAAGATGAAAACTTCATTTATAATTGTAAACGGTTGGTCTGGAGATATTTTTATCTAACCGCGGTTGGAAACCAATGTAACTCATCTTCCATCGACCACTCCCACAATGTCACATTGTATCTTCCTTCGCCCAAATCCACATTAATCTGAACAGAGCTCAACTCTCCTACCATGTCCGCCGTCACACTATCTCCGGCGACTCATCAGTGCTGTTTTAGCAAGAATGGAGTGTTGTTCTCGCCGAC...

CDS

下载 CDS FASTA

1167 bp · TkA07G029740|TK1151|CDS

ATGTCCGCCGTCACACTATCTCCGGCGACTCATCAGTGCTGTTTTAGCAAGAATGGAGTGTTGTTCTCGCCGACCAAACGACTAACGGCGAAATCGGCTCGATTTGAAACGGCGGTACATGGGAAGGGGATGAAGGTCACATGTCAGGCAGCAAGCAATGGCGCCGACGGTGTTTCTGATGTACAGAGGAGGAAGGTTATGGAATTGTTGACGTTCGGCACCGTTGGTCTACCCGCCGCCGGCATCTTGGCCCCTTATAC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

388 aa · TkA07G029740|TK1151|PROTEIN

MSAVTLSPATHQCCFSKNGVLFSPTKRLTAKSARFETAVHGKGMKVTCQAASNGADGVSDVQRRKVMELLTFGTVGLPAAGILAPYTARASQSISSMAESASNVPSAELLEFPKKDKRRLLHAVYRVGNLERSIKFYTEAFGMKLLRQRDIPEEKYSNAFLGFGPEESNFAVELTYNYGVDKYDIGTGFGHFAIATSDVYKLVEDIKAKGGTITREAGPVKGGTSVIAFAKDPDGYLFELIERKGTPEPLCQVMLRVGDL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G029740
TK1151 IDTkA07G029740
OH-1004 IDLXL04_027070
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)91.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G029740
位置Chr07:7956303-7960062 (+)
描述Similar to GLX1: Lactoylglutathione lyase GLX1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g11840 催化由甲基乙二醛和谷胱甘肽生成的半硫醇醛转化为S-乳酰谷胱甘肽。 暂无已核实直接文献
At1g67280 催化由甲基乙二醛和谷胱甘肽生成的半硫醇醛转化为S-乳酰谷胱甘肽。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os08g0191700 催化甲基乙二醛和谷胱甘肽生成的半缩醛转化为S-乳酰谷胱甘肽（通过相似性）。
A unique Ni2+ -dependent and methylglyoxal-inducible rice glyoxalase I possesses a single active site and functions in abiotic stress response.2014 · DOI: 10.1111/tpj.12521
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_027070 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006970 response to osmotic stress 生物过程
GO:0006979 response to oxidative stress 生物过程
GO:0009409 response to cold 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0019243 methylglyoxal catabolic process to D-lactate via S-lactoyl-glutathione 生物过程
GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005777 peroxisome 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G11840
ath:AT1G67280
dosa:Os08g0191700
osa:4344858
sfl:SF1678
sfx:S1810
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

质体0.974
排名 1 · TkA07G029740 · TK1151
线粒体0.040
排名 2 · TkA07G029740 · TK1151
细胞质0.018
排名 3 · TkA07G029740 · TK1151
细胞膜0.012
排名 4 · TkA07G029740 · TK1151
过氧化物酶体0.011
排名 5 · TkA07G029740 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF18998Flg_new_242-52 aa
PF25471TM_PetC56-87 aa
PF00903Glyoxalase119-240 aa
PF13669Glyoxalase_4122-223 aa
PF14506CppA_N122-148 aa
PF13468Glyoxalase_3122-211 aa
PF12681Glyoxalase_2124-146 aa
PF07719TPR_2125-140 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G029740PF18998Flg_new_242520.05814.1
TkA07G029740PF25471TM_PetC56878.4e-0935.8
TkA07G029740PF00903Glyoxalase1192401.1e-42146.0
TkA07G029740PF13669Glyoxalase_41222231.5e-1248.5
TkA07G029740PF14506CppA_N1221480.0003821.2
TkA07G029740PF13468Glyoxalase_31222110.01416.2
TkA07G029740PF12681Glyoxalase_21241460.113.2
TkA07G029740PF07719TPR_21251400.05214.4
TkA07G029740PF00515TPR_11251400.1812.4
TkA07G029740PF18029Glyoxalase_61272416.1e-0627.6
TkA07G029740PF13181TPR_81281430.0215.8
TkA07G029740PF21701GLOD4_C1292361.4e-1248.5
TkA07G029740PF22658YycE-like_N1291470.005117.4
TkA07G029740PF22677Ble-like_N1301471.1e-0629.0
TkA07G029740PF18998Flg_new_22082390.05814.1
TkA07G029740PF22659YycE-like_C2312360.1812.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O65398拟南芥sp|O65398|GLX1_ARATH Lactoylglutathione lyase GLX178.900%Swiss-Prot高置信
Q8W593拟南芥sp|Q8W593|LGUC_ARATH Probable lactoylglutathione lyase, chloroplastic71.200%Swiss-Prot高置信
Q948T6水稻sp|Q948T6|LGUL_ORYSJ Lactoylglutathione lyase77.700%Swiss-Prot高置信

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