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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G020750
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 5611218-5615611 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2537 bp · TkA07G020750|TK1151|cDNA

TCTCATTTCAATTTTCATACATTATTCGTTGACTAAACCCACCGAAGGTCACATATTCATTCAACTTCTAATATTTATGTGTCACAAAATAGACAAATCAACAAGCTCCAGTTTTTCTGGTCATCATTACATGCATACATATTTCATGAACGCATCATCACCTTGGAGTTTCTTTTGCTTATACGTATGATATTCTAGTGGCCACAATAACTTGTAAAAAGTGACGATAAAGCTGATCAACGCGCGGTTCATATATATTA...

CDS

下载 CDS FASTA

1776 bp · TkA07G020750|TK1151|CDS

ATGACTACATGTTTACGTATATATATTGATATATCTCATGTATCTATGATATATAATGCAGATTTATCAAGATCAAAGATGAAGTTTATGCGACTTGGTACAAGGCCAGACAACTTTTATACGGAAGAAGCCATTAGGACAATATATTCAGACTCACCAAGTGATCTAACCATACATGTCAACAACATCACCTATCTTCTCCATAAGTTTCCACTTGTTCCAAAGTGCGGCCTCTTACAGAGACTTTGCTCTGATAGGAG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

591 aa · TkA07G020750|TK1151|PROTEIN

MTTCLRIYIDISHVSMIYNADLSRSKMKFMRLGTRPDNFYTEEAIRTIYSDSPSDLTIHVNNITYLLHKFPLVPKCGLLQRLCSDRSDCSRLVLELHDIPGGEDAFELCAKFCYGIAIDLSAHNFVRAICAAKFLQMTESIEKGNFVSKLEAFFNSCILEGWKDSVVTLQTTRTLPEWSENLGIIRKCIDSVVEKILTPPTKVKWSYTYTREGYSKKKHHHSAPKDWWTEDIANLDIDLFRCVLNTVKLTNTLPPQLIGE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G020750
TK1151 IDTkA07G020750
OH-1004 IDLXL04_026958
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)99.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 98.646 / OH-1004 99.829
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G020750
位置Chr07:5611218-5615611 (+)
描述Similar to At5g47800: BTB/POZ domain-containing protein At5g47800
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g47800 可能作为 E3 泛素-蛋白连接酶复合物 (CUL3-RBX1-BTB) 的底物特异性适配子，介导靶蛋白的泛素化及随后的蛋白酶体降解。 暂无已核实直接文献
At1g67900 可能作为 E3 泛素-蛋白连接酶复合物 (CUL3-RBX1-BTB) 的底物特异性适配子，介导靶蛋白的泛素化及随后的蛋白酶体降解。 暂无已核实直接文献
At4g31820 可能作为 E3 泛素蛋白连接酶复合体 (CUL3-RBX1-BTB) 的底物特异性适配器，介导目标蛋白的泛素化及随后通过蛋白酶体降解 (通过相似性推测)。
NPY1, a BTB-NPH3-like protein, plays a critical role in auxin-regulated organogenesis in Arabidopsis.2007 · DOI: 10.1073/pnas.0708506104
NPY genes and AGC kinases define two key steps in auxin-mediated organogenesis in Arabidopsis.2008 · DOI: 10.1073/pnas.0809761106
NPY genes play an essential role in root gravitropic responses in Arabidopsis.2011 · DOI: 10.1093/mp/ssq052
Polar-localized NPH3-like proteins regulate polarity and endocytosis of PIN-FORMED auxin efflux carriers.2011 · DOI: 10.1242/dev.057745
MAB4-induced auxin sink generates local auxin gradients in Arabidopsis organ formation.2014 · DOI: 10.1073/pnas.1316109111
AGC kinases and MAB4/MEL proteins maintain PIN polarity by limiting lateral diffusion in plant cells.2021 · DOI: 10.1016/j.cub.2021.02.028
At5g67440 可能作为 E3 泛素蛋白连接酶复合体 (CUL3-RBX1-BTB) 的底物特异性适配器，介导目标蛋白的泛素化及随后通过蛋白酶体降解 (通过相似性推测)。
NPY genes and AGC kinases define two key steps in auxin-mediated organogenesis in Arabidopsis.2008 · DOI: 10.1073/pnas.0809761106
NPY genes play an essential role in root gravitropic responses in Arabidopsis.2011 · DOI: 10.1093/mp/ssq052
At2g23050 可能作为 E3 泛素蛋白连接酶复合体 (CUL3-RBX1-BTB) 的底物特异性适配器，介导目标蛋白的泛素化及随后通过蛋白酶体降解 (通过相似性推测)。
NPY genes play an essential role in root gravitropic responses in Arabidopsis.2011 · DOI: 10.1093/mp/ssq052
Polar-localized NPH3-like proteins regulate polarity and endocytosis of PIN-FORMED auxin efflux carriers.2011 · DOI: 10.1242/dev.057745

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_026958 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009908 flower development 生物过程
GO:0009911 positive regulation of flower development 生物过程
GO:0009958 positive gravitropism 生物过程
GO:0010229 inflorescence development 生物过程
GO:0010540 basipetal auxin transport 生物过程
GO:0016567 protein ubiquitination 生物过程
GO:0045176 apical protein localization 生物过程
GO:0048825 cotyledon development 生物过程
GO:0071365 cellular response to auxin stimulus 生物过程
GO:1901703 protein localization involved in auxin polar transport 生物过程
GO:2000012 regulation of auxin polar transport 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G67900
ath:AT3G26490
ath:AT4G31820
ath:AT5G47800
ath:AT5G67440
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.507
排名 1 · TkA07G020750 · TK1151
细胞质0.356
排名 2 · TkA07G020750 · TK1151
细胞膜0.154
排名 3 · TkA07G020750 · TK1151
内质网0.056
排名 4 · TkA07G020750 · TK1151
溶酶体／液泡0.035
排名 5 · TkA07G020750 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00651BTB52-143 aa
PF03000NPH3226-468 aa
PF00651BTB293-326 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G020750PF00651BTB521430.02515.5
TkA07G020750PF03000NPH32264682.5e-74250.9
TkA07G020750PF00651BTB2933260.02515.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FIK1拟南芥sp|Q9FIK1|Y5780_ARATH BTB/POZ domain-containing protein At5g4780055.800%Swiss-Prot高置信
Q9C9V6拟南芥sp|Q9C9V6|Y1790_ARATH BTB/POZ domain-containing protein At1g6790044.400%Swiss-Prot中等置信
Q8H1D3拟南芥sp|Q8H1D3|NPY1_ARATH Phototropic-responsive NPH3 family protein NPY138.800%Swiss-Prot中等置信
Q9FN09拟南芥sp|Q9FN09|NPY3_ARATH Phototropic-responsive NPH3 family protein NPY339.100%Swiss-Prot中等置信
O64814拟南芥sp|O64814|NPY4_ARATH Phototropic-responsive NPH3 family protein NPY439.400%Swiss-Prot中等置信

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