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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID,查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度,最大 10000 bp

基因概览

TkA06G444010
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 109698388-109707400 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

3160 bp · TkA06G444010|TK1151|cDNA

TTGAAGATTACCAATTAAACAACTCAATGCTTTAGTCAGGAGTTCCATGTCAAGAAACTTCATCTTCTAGTCTTCTACACCTTCATTTCTTAAGCTTCTCAGATTCATTTGGGAAAGCATTTTATTGTCACTGGTAAATTATCGCAGTTGAAAACATGGATGATAAGTCGATCGCTCTTAGTGCAGTAATCCGAGAAGCCATTGATTTGGAGAATGCACCATTAGAAGAAGTATTTCAACATCTGAAATGCACAAGAGAA...

2895 bp · TkA06G444010|TK1151|CDS

ATGGATGATAAGTCGATCGCTCTTAGTGCAGTAATCCGAGAAGCCATTGATTTGGAGAATGCACCATTAGAAGAAGTATTTCAACATCTGAAATGCACAAGAGAAGGTTTAAACTCGAATGAAGTTCAAGACCGTCTAGACCTTTTTGGATACAATAAACTCGAAGAAAAGAAGGAAAGTAAAATCTTGAAGTTTTTGGGATTTATGTGGAATCCACTATCATGGGTGATGGAAGCCGCAGCTATTATGTCTATCGCGCT...

964 aa · TkA06G444010|TK1151|PROTEIN

MDDKSIALSAVIREAIDLENAPLEEVFQHLKCTREGLNSNEVQDRLDLFGYNKLEEKKESKILKFLGFMWNPLSWVMEAAAIMSIALARGGGKPADYHDFVGIIVLLIINSTISFIEENNAGNAAAALMARLAPKAKVLRDGKWSEEDACVLVPGDIISIKLGDIVPGDARLLEGDPLKIDQSALTGESLPVTKNPGDGVYSGSTCKQGEIEGVVIATGVHTFFGKAAHLVENTTHVGHFQRVLTSIGNFCICSIAVGMV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G444010
TK1151 IDTkA06G444010
OH-1004 IDLXL04_022800
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G444010
位置Chr06:109698388-109707400 (+)
描述Similar to AHA7: ATPase 7, plasma membrane-type
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g62670 植物和真菌的质膜 H⁺ ATP 酶产生质子梯度,通过 H⁺ 共转运驱动营养物质的主动运输。 暂无已核实直接文献
At3g60330 植物和真菌的质膜 H⁺ ATP 酶产生质子梯度,通过 H⁺ 共转运驱动营养物质的主动运输。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源:OH1004 · LXL04_022800 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释(OH1004 来源)
GO:0051453 regulation of intracellular pH 生物过程
GO:0120029 proton export across plasma membrane 生物过程
GO:1902600 proton transmembrane transport 生物过程
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0003729 mRNA binding 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0008553 P-type proton-exporting transporter activity 分子功能
GO:0016887 ATP hydrolysis activity 分子功能
GO:0046872 metal ion binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G60330
ath:AT5G62670
sly:543982
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号,不代表本基因已获得通路功能验证。

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究;参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时,不自动选择表达记录;缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释,不能替代定位实验。

细胞膜0.663
排名 1 · TkA06G444010 · TK1151
内质网0.145
排名 2 · TkA06G444010 · TK1151
细胞质0.100
排名 3 · TkA06G444010 · TK1151
高尔基体0.082
排名 4 · TkA06G444010 · TK1151
溶酶体/液泡0.078
排名 5 · TkA06G444010 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测,非定位实验结果

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00690Cation_ATPase_N20-84 aa
PF00122E1-E2_ATPase132-232 aa
PF00702Hydrolase327-603 aa
PF08282Hydrolase_3341-375 aa
PF13246Cation_ATPase377-494 aa
PF00122E1-E2_ATPase509-536 aa
PF08282Hydrolase_3579-623 aa
PF07415Herpes_LMP2607-686 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G444010PF00690Cation_ATPase_N20841.7e-1453.9
TkA06G444010PF00122E1-E2_ATPase1322327.8e-32109.8
TkA06G444010PF00702Hydrolase3276033.7e-1351.0
TkA06G444010PF08282Hydrolase_33413750.0009519.7
TkA06G444010PF13246Cation_ATPase3774940.0001322.5
TkA06G444010PF00122E1-E2_ATPase5095367.8e-32109.8
TkA06G444010PF08282Hydrolase_35796230.0009519.7
TkA06G444010PF07415Herpes_LMP26076860.02514.1
TkA06G444010PF27864Mollicut_2TM6416853.88.5
TkA06G444010PF27864Mollicut_2TM7137343.88.5
TkA06G444010PF00690Cation_ATPase_N8068181.7e-1453.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻;Swiss-Prot 为人工审校条目,TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LV11拟南芥sp|Q9LV11|PMA11_ARATH ATPase 11, plasma membrane-type79.300%Swiss-Prot高置信
Q9LY32拟南芥sp|Q9LY32|PMA7_ARATH ATPase 7, plasma membrane-type79.200%Swiss-Prot高置信

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