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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA06G429840
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 106324559-106332328 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2302 bp · TkA06G429840|TK1151|cDNA

TTTTGTGGCACCCACCGACTTTGACAATGAGGTTGAAACTTCAAAGTGCCCCTTCATAAAACCACAACAACATCACCAATCACCAAACAAAAAACAACAAGAAAAATGAGGATCATCACACTCCAAATATTCTTCCTTCTCCACCTTCAAATCTTCTTCCATATTTCATCATCCCAAAGCCTACCTTCAAACACCACCGGCTATGCCTGCAACCTCACCCTAACTTCACCCTCTTGCCAATCCTACGCCTTCTTTACAGC...

CDS

下载 CDS FASTA

1833 bp · TkA06G429840|TK1151|CDS

ATGAGGATCATCACACTCCAAATATTCTTCCTTCTCCACCTTCAAATCTTCTTCCATATTTCATCATCCCAAAGCCTACCTTCAAACACCACCGGCTATGCCTGCAACCTCACCCTAACTTCACCCTCTTGCCAATCCTACGCCTTCTTTACAGCCATGCCTCCAAACCAACTCGACTTATCCTCCATAGCCGATTCCTTCTCCCTGAGCCGTCCGATGATCGCCAAACCGAGCAACATCACATCTCTAACTTCACCTCT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

610 aa · TkA06G429840|TK1151|PROTEIN

MRIITLQIFFLLHLQIFFHISSSQSLPSNTTGYACNLTLTSPSCQSYAFFTAMPPNQLDLSSIADSFSLSRPMIAKPSNITSLTSPLVPNQPLFIPLTCTCNSVNTTTNISYAKINYTIQNGDNFYLVSTAIFHNLTTYQSVEVVNPTLVPTNLSIGQDVIFPIFCKCPTKTQLQNGINYLISYVFQPFDNISAIASRFGSSTESIIEVNGNGTIRPTETIFVPVSKLPELNQPAPSNVTNTQKTERTSDVVGLGVGLGV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G429840
TK1151 IDTkA06G429840
OH-1004 IDLXL04_013481
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)36.300
蛋白覆盖度 (%)TK1151 98.525 / OH-1004 98.858
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G429840
位置Chr06:106324559-106332328 (-)
描述Similar to NFP: Serine/threonine receptor-like kinase NFP
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g23770 赖氨酸基序 受体激酶，在几丁质激发子信号传导中充当细胞表面受体，导致先天免疫。
LYK4, a lysin motif receptor-like kinase, is important for chitin signaling and plant innate immunity in Arabidopsis.2012 · DOI: 10.1104/pp.112.201699
At2g33580 可能识别来源于微生物的含N-乙酰葡萄糖胺（NAG）配体。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os08g0538300 赖氨酸基序 受体激酶需要作为几丁质激发子信号传导的细胞表面受体，从而产生针对生物胁迫的先天免疫。
Two LysM receptor molecules, CEBiP and OsCERK1, cooperatively regulate chitin elicitor signaling in rice.2010 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2010.04324.x
Functional characterization of CEBiP and CERK1 homologs in arabidopsis and rice reveals the presence of different chitin receptor systems in plants.2012 · DOI: 10.1093/pcp/pcs113
A receptor-like cytoplasmic kinase targeted by a plant pathogen effector is directly phosphorylated by the chitin receptor and mediates rice immunity.2013 · DOI: 10.1016/j.chom.2013.02.007
Targeted gene disruption of OsCERK1 reveals its indispensable role in chitin perception and involvement in the peptidoglycan response and immunity in rice.2014 · DOI: 10.1094/mpmi-03-14-0068-r
OsCERK1 and OsRLCK176 play important roles in peptidoglycan and chitin signaling in rice innate immunity.2014 · DOI: 10.1111/tpj.12710
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_013481 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0002237 response to molecule of bacterial origin 生物过程
GO:0002752 cell surface pattern recognition receptor signaling pathway 生物过程
GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0009101 glycoprotein biosynthetic process 生物过程
GO:0009609 response to symbiotic bacterium 生物过程
GO:0009877 nodulation 生物过程
GO:0010200 response to chitin 生物过程
GO:0032491 detection of molecule of fungal origin 生物过程
GO:0032499 detection of peptidoglycan 生物过程
GO:0035556 intracellular signal transduction 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G23770
ath:AT2G33580
ath:AT3G21630
mtr:11410973
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.833
排名 1 · TkA06G429840 · TK1151
内质网0.106
排名 2 · TkA06G429840 · TK1151
细胞质0.073
排名 3 · TkA06G429840 · TK1151
细胞核0.045
排名 4 · TkA06G429840 · TK1151
溶酶体／液泡0.041
排名 5 · TkA06G429840 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF22867YoaL41-72 aa
PF23446LysM1_NFP_LYK43-101 aa
PF23462LysM3_NFP60-96 aa
PF01476LysM60-96 aa
PF23473LysM3_LYK4_560-97 aa
PF26764TEDa_beta95-141 aa
PF23457LysM2_NFP111-165 aa
PF23472LysM2_CERK1_LYK3_4_5113-163 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G429840PF22867YoaL41720.1113.5
TkA06G429840PF23446LysM1_NFP_LYK431016.8e-2072.4
TkA06G429840PF23462LysM3_NFP60963.4e-0834.6
TkA06G429840PF01476LysM60968.6e-0832.7
TkA06G429840PF23473LysM3_LYK4_560975.8e-0730.2
TkA06G429840PF26764TEDa_beta951410.1213.0
TkA06G429840PF23457LysM2_NFP1111651.3e-2486.7
TkA06G429840PF23472LysM2_CERK1_LYK3_4_51131631.6e-0628.6
TkA06G429840PF23462LysM3_NFP1151303.4e-0834.6
TkA06G429840PF23473LysM3_LYK4_51161305.8e-0730.2
TkA06G429840PF01476LysM1171638.6e-0832.7
TkA06G429840PF23446LysM1_NFP_LYK1511686.8e-2072.4
TkA06G429840PF23462LysM3_NFP1802253.4e-0834.6
TkA06G429840PF23473LysM3_LYK4_51802115.8e-0730.2
TkA06G429840PF23472LysM2_CERK1_LYK3_4_51821981.6e-0628.6
TkA06G429840PF23446LysM1_NFP_LYK1842266.8e-2072.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O64825拟南芥sp|O64825|LYK4_ARATH LysM domain receptor-like kinase 431.700%Swiss-Prot中等置信
O22808拟南芥sp|O22808|LYK5_ARATH Protein LYK529.700%Swiss-Prot低置信
A0A0P0XII1水稻sp|A0A0P0XII1|CERK1_ORYSJ Chitin elicitor receptor kinase 141.600%Swiss-Prot低置信

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