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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA06G255370
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 65152382-65154670 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1571 bp · TkA06G255370|TK1151|cDNA

TCGATCTGTAAAGATCTTCCGCTTCTTATAAGCCCTAGATTGAAGACTCCGATTTCGAGTGAGAGGGTGGGTTCCGATTTCGAGTGGGTTCCTTCATCTCCTCGCAGCCTCTTCAATTGCAACCTCCGCGAACCCCTTCCCTCAGCCTCCTCTGCTGCCGCCTCCGCCTGCCCTTTCCGCCCTTCGCCCAAAACCCTACTCGACAGACTCAATATCGTTGATCCTGTCAACAGGAGCAAGTAGACTCCCAGATTTGAAGA...

CDS

下载 CDS FASTA

987 bp · TkA06G255370|TK1151|CDS

ATGCGATTGCGTCTCAAAATCTCGATCACGCACCTGCTCGCCGGAGAGTTCGATTGGCTTTCACTCAAGTTCAGGAACAGCTTGATCACGTTTTGTTTTAGTTTTCTGGTTGCTCTGATTAATCGACAGATGGCTCCTACAGGAATCAGGACTGAAGAGTGGTTTGAAATGAACTCAAAGGGTGAGGAAATATTTTGTAAAAGCTGGTTACCAAGGCCTGGAGTCCGAATAAAAGCGGCTGTGTGTTTTGTCCATGGCTA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

328 aa · TkA06G255370|TK1151|PROTEIN

MRLRLKISITHLLAGEFDWLSLKFRNSLITFCFSFLVALINRQMAPTGIRTEEWFEMNSKGEEIFCKSWLPRPGVRIKAAVCFVHGYGDTCTFFFEGIAKRIAAAGYGVYAIDHPGFGLSEGLHGYIPNFSDLVGNVIEQYTKIKGRPEVRGMPRFLLGQSMGGAVALKVHLKEQREWDGVVLVATMCKISEEMKPPEPLQKVLNILSRLMPKAKLVPQKDLAELVFRDPQKRKLADYNVISYSDQTRLKTAVELLNATN...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G255370
TK1151 IDTkA06G255370
OH-1004 IDLXL04_023547
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G255370
位置Chr06:65152382-65154670 (+)
描述Similar to CSE: Caffeoylshikimate esterase
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g52760 酯酶参与木质素的生物合成。
Acyl-CoA-binding protein 2 binds lysophospholipase 2 and lysoPC to promote tolerance to cadmium-induced oxidative stress in transgenic Arabidopsis.2010 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2010.04209.x
A bifunctional enzyme that has both monoacylglycerol acyltransferase and acyl hydrolase activities.2012 · DOI: 10.1104/pp.112.202135

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_023547 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006629 lipid metabolic process 生物过程
GO:0006633 fatty acid biosynthetic process 生物过程
GO:0006979 response to oxidative stress 生物过程
GO:0009809 lignin biosynthetic process 生物过程
GO:0009966 regulation of signal transduction 生物过程
GO:0010043 response to zinc ion 生物过程
GO:0016042 lipid catabolic process 生物过程
GO:0019369 arachidonate metabolic process 生物过程
GO:0019433 triglyceride catabolic process 生物过程
GO:0042542 response to hydrogen peroxide 生物过程
GO:0045471 response to ethanol 生物过程
GO:0045907 positive regulation of vasoconstriction 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G52760
hsa:11343
mmu:23945
msg:MSMEI_0213
msm:MSMEG_0220
rno:29254
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

内质网0.381
排名 1 · TkA06G255370 · TK1151
细胞质0.264
排名 2 · TkA06G255370 · TK1151
细胞膜0.138
排名 3 · TkA06G255370 · TK1151
线粒体0.138
排名 4 · TkA06G255370 · TK1151
细胞核0.128
排名 5 · TkA06G255370 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF02230Abhydrolase_238-57 aa
PF00326Peptidase_S951-96 aa
PF02230Abhydrolase_275-95 aa
PF12146Hydrolase_477-317 aa
PF20408Abhydrolase_1178-183 aa
PF00561Abhydrolase_180-315 aa
PF01738DLH81-110 aa
PF12697Abhydrolase_683-318 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G255370PF02230Abhydrolase_238571.3e-0525.9
TkA06G255370PF00326Peptidase_S951960.1112.8
TkA06G255370PF02230Abhydrolase_275951.3e-0525.9
TkA06G255370PF12146Hydrolase_4773178.7e-65219.1
TkA06G255370PF20408Abhydrolase_11781830.001419.1
TkA06G255370PF00561Abhydrolase_1803151.1e-1558.8
TkA06G255370PF01738DLH811100.006316.9
TkA06G255370PF12697Abhydrolase_6833183.4e-1144.9
TkA06G255370PF02230Abhydrolase_21411951.3e-0525.9
TkA06G255370PF00756Esterase1521940.009316.5
TkA06G255370PF12695Abhydrolase_51551940.09313.2
TkA06G255370PF01738DLH1571820.006316.9
TkA06G255370PF00326Peptidase_S91581890.1112.8
TkA06G255370PF01738DLH2633170.006316.9
TkA06G255370PF12695Abhydrolase_52633110.09313.2
TkA06G255370PF00326Peptidase_S92653120.1112.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9C942拟南芥sp|Q9C942|CSE_ARATH Caffeoylshikimate esterase31.900%Swiss-Prot中等置信

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