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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA06G066620
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 17874438-17877534 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

435 bp · TkA06G066620|TK1151|cDNA

ATGAGTCGCAAGGTGGGAAATCCAAGATATTATTCAACCTCAACAACCATCGATGTACCAAAAGGTTGTATAGTTGTATATGTTGGTGAAGGAACAAACAAGAGATTTGTAGTTCCATTAACATATCTAAAACATCATTCATTTCAGACCTTGCTTAAATTGTCCGAAGATGAGTTTGGCTATGTGCATCCCATGGGAGGTCTAACGCTCCCATGCAAAGAAGAAACATTTATCAAAATCACACATGATATAGTATATGT...

CDS

下载 CDS FASTA

435 bp · TkA06G066620|TK1151|CDS

ATGAGTCGCAAGGTGGGAAATCCAAGATATTATTCAACCTCAACAACCATCGATGTACCAAAAGGTTGTATAGTTGTATATGTTGGTGAAGGAACAAACAAGAGATTTGTAGTTCCATTAACATATCTAAAACATCATTCATTTCAGACCTTGCTTAAATTGTCCGAAGATGAGTTTGGCTATGTGCATCCCATGGGAGGTCTAACGCTCCCATGCAAAGAAGAAACATTTATCAAAATCACACATGATATAGTATATGT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

144 aa · TkA06G066620|TK1151|PROTEIN

MSRKVGNPRYYSTSTTIDVPKGCIVVYVGEGTNKRFVVPLTYLKHHSFQTLLKLSEDEFGYVHPMGGLTLPCKEETFIKITHDIVYVGEGIKKRFIVPLAYLRHSSFQTLLKMSEEEFGYDHPMGGLTLPCKEETFLELTHAIL

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G066620
TK1151 IDTkA06G066620
OH-1004 IDLXL04_025376
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)74.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 59.722 / OH-1004 98.851
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G066620
位置Chr06:17874438-17877534 (-)
描述Similar to SAUR21: Auxin-responsive protein SAUR21
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g18030 通过调节生长素运输，作为细胞扩张的正效应因子。 暂无已核实直接文献
At5g18050 通过调节生长素运输，作为细胞扩张的正效应因子。 暂无已核实直接文献
At5g18010 介导生长素信号与质膜H⁺-ATP酶（AHA1、AHA2）之间的联系；通过抑制PP2C-D类磷酸酶，促进H⁺-ATP酶C端自抑制结构域的磷酸化及酶的活化，从而使质外体酸化，促进溶质和水吸收以及细胞扩张。
The SAUR19 subfamily of SMALL AUXIN UP RNA genes promote cell expansion.2012 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2012.04946.x
SAUR Inhibition of PP2C-D Phosphatases Activates Plasma Membrane H+-ATPases to Promote Cell Expansion in Arabidopsis.2014 · DOI: 10.1105/tpc.114.126037
Constitutive Expression of Arabidopsis SMALL AUXIN UP RNA19 (SAUR19) in Tomato Confers Auxin-Independent Hypocotyl Elongation.2017 · DOI: 10.1104/pp.16.01514
At5g18020 通过调节生长素运输，作为细胞扩张的正效应因子。 暂无已核实直接文献
At5g18060 通过调节生长素运输，作为细胞扩张的正效应因子。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_025376 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009733 response to auxin 生物过程
GO:0009734 auxin-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009741 response to brassinosteroid 生物过程
GO:0030307 positive regulation of cell growth 生物过程
GO:2000012 regulation of auxin polar transport 生物过程
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT5G18010
ath:AT5G18020
ath:AT5G18030
ath:AT5G18050
ath:AT5G18080
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.766
排名 1 · TkA06G066620 · TK1151
细胞核0.268
排名 2 · TkA06G066620 · TK1151
细胞膜0.078
排名 3 · TkA06G066620 · TK1151
内质网0.066
排名 4 · TkA06G066620 · TK1151
细胞外0.054
排名 5 · TkA06G066620 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF19910DUF63839-35 aa
PF06003SMN_Tudor10-32 aa
PF02519Auxin_inducible12-80 aa
PF22945LEM-3_GIY-YIG25-40 aa
PF29811YosV28-46 aa
PF02209VHP42-59 aa
PF03057DUF23649-60 aa
PF04279IspA59-87 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G066620PF19910DUF63839350.2812.1
TkA06G066620PF06003SMN_Tudor10320.1712.7
TkA06G066620PF02519Auxin_inducible12801.1e-38132.0
TkA06G066620PF22945LEM-3_GIY-YIG25400.03714.8
TkA06G066620PF29811YosV28460.2212.2
TkA06G066620PF02209VHP42590.0002221.8
TkA06G066620PF03057DUF23649600.08713.4
TkA06G066620PF04279IspA59870.05814.3
TkA06G066620PF12518DUF372162750.001518.9
TkA06G066620PF22945LEM-3_GIY-YIG73990.03714.8
TkA06G066620PF29811YosV751060.2212.2
TkA06G066620PF02519Auxin_inducible821411.1e-38132.0
TkA06G066620PF06003SMN_Tudor83900.1712.7
TkA06G066620PF02209VHP1011180.0002221.8
TkA06G066620PF03057DUF2361081190.08713.4
TkA06G066620PF12518DUF37211221340.001518.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FJF9拟南芥sp|Q9FJF9|SAU21_ARATH Auxin-responsive protein SAUR2155.800%Swiss-Prot中等置信
Q9FJF7拟南芥sp|Q9FJF7|SAU22_ARATH Auxin-responsive protein SAUR2260.000%Swiss-Prot低置信
Q9FJG1拟南芥sp|Q9FJG1|SAU19_ARATH Auxin-responsive protein SAUR1958.600%Swiss-Prot低置信
Q9FJG0拟南芥sp|Q9FJG0|SAU20_ARATH Auxin-responsive protein SAUR2057.100%Swiss-Prot低置信
Q9FJF6拟南芥sp|Q9FJF6|SAU23_ARATH Auxin-responsive protein SAUR2362.900%Swiss-Prot低置信

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