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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA06G062370
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 16837033-16839403 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1874 bp · TkA06G062370|TK1151|cDNA

AAGAAATACAGAGAGAAAGTGTATATTCTAGAGAGAGAGAGGGATCGAGAAACACAGAGTGAGAGACTTGCCGGCTTTCCATCATCGTCCATTCCGTCACCATTTGGCGGAGAAACCCCAGCTATCTTCTTGTGTCGACTGATTGATACTCTTGAAGATTTGCGGCAGTGAAAAGAAATGAGTGAATCCGAGGAAGGCAACCAAAGGCTACAATCTTCATTTGGTGCTTCATCATCATCACTCCCTAAACTGCAATCACA...

CDS

下载 CDS FASTA

1461 bp · TkA06G062370|TK1151|CDS

ATGAGTGAATCCGAGGAAGGCAACCAAAGGCTACAATCTTCATTTGGTGCTTCATCATCATCACTCCCTAAACTGCAATCACATATTCCTTTCAATCATCCTGATATTCGTGCCCAAATTACACAATCTCCCCTAAATATCAACACTGAAAACACCAGTAAAAGAGTCGGAATGCCTCATTCGCATACACAAATCCCTCCGCTTTCACCTTCCTCACAGATCCCCGTCGGCAATTTTCAGCAAACGGAGAGTTCACATAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

486 aa · TkA06G062370|TK1151|PROTEIN

MSESEEGNQRLQSSFGASSSSLPKLQSHIPFNHPDIRAQITQSPLNINTENTSKRVGMPHSHTQIPPLSPSSQIPVGNFQQTESSHNLTLATGPSHSKTLTQPSYFSLDSLPPLSPYRDPTSALTSDQMVTDHDSLPPRKTHRRSNSDIPFGFSTILQSSPPLIPSRGSNAMEVKRESNWDKNAGVTESKIGDRKSEGEVVDDFFSTYINLNNLGRLNSFRSETCEDLNSHTKTNGGDTSDNEATSSTNIHKLGPTLLID...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G062370
TK1151 IDTkA06G062370
OH-1004 IDLXL04_025383
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G062370
位置Chr06:16837033-16839403 (+)
描述Similar to RF2b: Transcription factor RF2b
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g38900 转录因子，作为生殖发育、分生组织大小和植物生长的抑制因子。
Identification of novel transcriptional regulators of Zat12 using comprehensive yeast one-hybrid screens.2016 · DOI: 10.1111/ppl.12439
Functional characterization of the Arabidopsis transcription factor bZIP29 reveals its role in leaf and root development.2016 · DOI: 10.1093/jxb/erw347
At2g21230 转录因子，作为生殖发育、分生组织大小和植物生长的抑制因子。
Altered expression of the bZIP transcription factor DRINK ME affects growth and reproductive development in Arabidopsis thaliana.2016 · DOI: 10.1111/tpj.13264
At2g40620 可能与 bZIP34 一起参与花粉发育的配子体控制的转录因子。
Characterization of pollen-expressed bZIP protein interactions and the role of ATbZIP18 in the male gametophyte.2017 · DOI: 10.1007/s00497-016-0295-5

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os03g0336200 转录因子可能参与维管发育和芽组织组织。
RF2b, a rice bZIP transcription activator, interacts with RF2a and is involved in symptom development of rice tungro disease.2004 · DOI: 10.1073/pnas.0307687100
Os09g0516200 转录因子可能参与维管发育和芽组织组织。
Transcription factor RF2a alters expression of the rice tungro bacilliform virus promoter in transgenic tobacco plants.2001 · DOI: 10.1073/pnas.121186398
Functional analysis of RF2a, a rice transcription factor.2003 · DOI: 10.1074/jbc.m304862200
RF2b, a rice bZIP transcription activator, interacts with RF2a and is involved in symptom development of rice tungro disease.2004 · DOI: 10.1073/pnas.0307687100
RF2a, a bZIP transcriptional activator of the phloem-specific rice tungro bacilliform virus promoter, functions in vascular development.1997 · DOI: 10.1093/emboj/16.17.5247
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_025383 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0010628 positive regulation of gene expression 生物过程
GO:0010629 negative regulation of gene expression 生物过程
GO:0090567 reproductive shoot system development 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005654 nucleoplasm 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0048471 perinuclear region of cytoplasm 细胞组分
GO:0000976 transcription cis-regulatory region binding 分子功能
GO:0003677 DNA binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G21230
ath:AT2G31370
ath:AT2G40620
ath:AT4G38900
dosa:Os03g0336200
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.962
排名 1 · TkA06G062370 · TK1151
细胞质0.129
排名 2 · TkA06G062370 · TK1151
细胞膜0.022
排名 3 · TkA06G062370 · TK1151
内质网0.010
排名 4 · TkA06G062370 · TK1151
质体0.009
排名 5 · TkA06G062370 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF28159CEP89179-475 aa
PF17470Gp45_2331-365 aa
PF03131bZIP_Maf344-415 aa
PF07716bZIP_2351-400 aa
PF00170bZIP_1354-412 aa
PF14662KASH_CCD362-450 aa
PF19579FtsL_2370-400 aa
PF26666DUF8221371-416 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G062370PF28159CEP891794750.003816.5
TkA06G062370PF17470Gp45_23313650.09213.0
TkA06G062370PF03131bZIP_Maf3444150.03215.5
TkA06G062370PF07716bZIP_23514002.5e-0628.2
TkA06G062370PF00170bZIP_13544129.3e-0936.0
TkA06G062370PF14662KASH_CCD3624500.01416.1
TkA06G062370PF19579FtsL_23704000.3711.4
TkA06G062370PF26666DUF82213714161.110.2
TkA06G062370PF04102SlyX3774281.210.6
TkA06G062370PF06005ZapB3784361.89.8
TkA06G062370PF13721SecD-TM13804390.312.3
TkA06G062370PF19579FtsL_24024330.3711.4
TkA06G062370PF00170bZIP_14054299.3e-0936.0
TkA06G062370PF07716bZIP_24064252.5e-0628.2
TkA06G062370PF03131bZIP_Maf4184580.03215.5
TkA06G062370PF00170bZIP_14214449.3e-0936.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8H1F0拟南芥sp|Q8H1F0|BZP29_ARATH bZIP transcription factor 2947.900%Swiss-Prot中等置信
Q9SIG8拟南芥sp|Q9SIG8|BZP30_ARATH bZIP transcription factor 3044.400%Swiss-Prot中等置信
O22873拟南芥sp|O22873|BZP18_ARATH bZIP transcription factor 1859.900%Swiss-Prot低置信
Q6S4P4水稻sp|Q6S4P4|RF2B_ORYSJ Transcription factor RF2b66.200%Swiss-Prot低置信
Q69IL4水稻sp|Q69IL4|RF2A_ORYSJ Transcription factor RF2a53.300%Swiss-Prot低置信

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