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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA06G047290
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 12791953-12792408 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

426 bp · TkA06G047290|TK1151|cDNA

ATGAGGAGACACATCAAAAACGAAGGTCGCAATCGTGGGTACGAATGCAAGACATGTAAGAAGAGATTCGATACTTTTCAAGCTCTTGGTGGCCACCAGGGAAGCCACAGAAAAGTTCGACCCGTTGATAATGCGTCTGATTCTACGTCTGGAGTGTTACAGTTACACAAATGCACGATGTGCACGAAGAAGTTTGATACTGGGCAGGCGTTGGGTGGGCACATGCGGCGGCATAAGCGTGAAAAAGATTTGATTTCGAT...

CDS

下载 CDS FASTA

426 bp · TkA06G047290|TK1151|CDS

ATGAGGAGACACATCAAAAACGAAGGTCGCAATCGTGGGTACGAATGCAAGACATGTAAGAAGAGATTCGATACTTTTCAAGCTCTTGGTGGCCACCAGGGAAGCCACAGAAAAGTTCGACCCGTTGATAATGCGTCTGATTCTACGTCTGGAGTGTTACAGTTACACAAATGCACGATGTGCACGAAGAAGTTTGATACTGGGCAGGCGTTGGGTGGGCACATGCGGCGGCATAAGCGTGAAAAAGATTTGATTTCGAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

141 aa · TkA06G047290|TK1151|PROTEIN

MRRHIKNEGRNRGYECKTCKKRFDTFQALGGHQGSHRKVRPVDNASDSTSGVLQLHKCTMCTKKFDTGQALGGHMRRHKREKDLISMNRKLVRQRLVAEEKVESELVVDDVKVRQQTAEEDERSEAKSELVLAAKTLRLGI

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G047290
TK1151 IDTkA06G047290
OH-1004 IDLXL04_025655
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)78.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 97.163 / OH-1004 92.453
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G047290
位置Chr06:12791953-12792408 (-)
描述Similar to ZAT11: Zinc finger protein ZAT11
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g53600 参与应激响应的转录因子（可能）。
The Arabidopsis Cys2/His2 zinc finger transcription factor ZAT18 is a positive regulator of plant tolerance to drought stress.2017 · DOI: 10.1093/jxb/erx157
At3g46090 可能的转录因子，参与氧化应激反应。
The zinc finger protein Zat12 is required for cytosolic ascorbate peroxidase 1 expression during oxidative stress in Arabidopsis.2004 · DOI: 10.1074/jbc.m313350200
At3g46080 可能参与应激反应的转录因子。 暂无已核实直接文献
At2g37430 可能参与应激反应的转录因子。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_025655 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006950 response to stress 生物过程
GO:0006970 response to osmotic stress 生物过程
GO:0006979 response to oxidative stress 生物过程
GO:0009408 response to heat 生物过程
GO:0009409 response to cold 生物过程
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009416 response to light stimulus 生物过程
GO:0009611 response to wounding 生物过程
GO:0009617 response to bacterium 生物过程
GO:0009631 cold acclimation 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G37430
ath:AT3G46080
ath:AT3G46090
ath:AT3G53600
ath:AT5G59820
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.973
排名 1 · TkA06G047290 · TK1151
细胞质0.079
排名 2 · TkA06G047290 · TK1151
细胞膜0.021
排名 3 · TkA06G047290 · TK1151
内质网0.010
排名 4 · TkA06G047290 · TK1151
线粒体0.008
排名 5 · TkA06G047290 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13894zf-C2H2_41-7 aa
PF13465zf-H2C2_21-25 aa
PF23783Zn_ribbon_TiaS4-22 aa
PF18868zf-C2H2_3rep4-34 aa
PF27966ZNF4286-36 aa
PF23250zf_DPOE_27-25 aa
PF01096Zn_ribbon_TFIIS8-23 aa
PF15909zf-C2H2_810-32 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G047290PF13894zf-C2H2_4171.4e-0732.3
TkA06G047290PF13465zf-H2C2_21258.6e-0523.4
TkA06G047290PF23783Zn_ribbon_TiaS4220.0008419.7
TkA06G047290PF18868zf-C2H2_3rep4340.0216.3
TkA06G047290PF27966ZNF4286360.710.7
TkA06G047290PF23250zf_DPOE_27250.2811.6
TkA06G047290PF01096Zn_ribbon_TFIIS8230.2112.2
TkA06G047290PF15909zf-C2H2_810320.1213.4
TkA06G047290PF29551Terminus11320.2611.3
TkA06G047290PF12756zf-C2H2_212450.0008320.3
TkA06G047290PF23455DUF712913250.06713.7
TkA06G047290PF13912zf-C2H2_614383.1e-1969.1
TkA06G047290PF13894zf-C2H2_414361.4e-0732.3
TkA06G047290PF00096zf-C2H214360.0004321.3
TkA06G047290PF12171zf-C2H2_jaz14250.01116.6
TkA06G047290PF09723Zn_ribbon_814280.01915.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LFG0拟南芥sp|Q9LFG0|ZAT18_ARATH Zinc finger protein ZAT1856.300%Swiss-Prot低置信
Q42453拟南芥sp|Q42453|ZAT7_ARATH Zinc finger protein ZAT755.300%Swiss-Prot低置信
Q9LX85拟南芥sp|Q9LX85|ZAT8_ARATH Zinc finger protein ZAT844.900%Swiss-Prot低置信
Q9SLD4拟南芥sp|Q9SLD4|ZAT11_ARATH Zinc finger protein ZAT1166.700%Swiss-Prot低置信

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