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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G419890
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 104588770-104595005 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3910 bp · TkA05G419890|TK1151|cDNA

AAATATACATTCCTTTCATTGAGTGCTCAAACCACATAAATTCTATCTTAACCAAAATAAACACACAGATGGCAAGTTCATTTTCATCTCCTTCCAATCCGGCCAATTATTCTCGGTCGTGGTCTTACCATGTTTTTCTTAGCTTTAGAGGAGACGATACTCGTTTGAAATTTGTGGGTCATCTCTACGAAGCTCTTATTGGTAGGGGAATCCACACGTACAAAGACAACAAAGAAATTTCTTATGGAGAATTGATCGAT...

CDS

下载 CDS FASTA

3240 bp · TkA05G419890|TK1151|CDS

ATGGCAAGTTCATTTTCATCTCCTTCCAATCCGGCCAATTATTCTCGGTCGTGGTCTTACCATGTTTTTCTTAGCTTTAGAGGAGACGATACTCGTTTGAAATTTGTGGGTCATCTCTACGAAGCTCTTATTGGTAGGGGAATCCACACGTACAAAGACAACAAAGAAATTTCTTATGGAGAATTGATCGATACATCCGTTACAGAGGCTATCGAGGGATCACAAATTGCGATCATTGTATTCTCTGAAAACTTTGCAGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1079 aa · TkA05G419890|TK1151|PROTEIN

MASSFSSPSNPANYSRSWSYHVFLSFRGDDTRLKFVGHLYEALIGRGIHTYKDNKEISYGELIDTSVTEAIEGSQIAIIVFSENFAESSWCLRELAYIIDCEKRRGLTVVPIFYDVEPTVVRKQKRKHEEAFSQHELKNESDVVASWRKTLREVSGHSGDEFKSASMDESEFIKKIVNGISKMILPLTPWKNDKLVGMEDRMHNLISQMQIGLDVVLMIGIWGVGGSGKTTLANSVYNEISWKFDCCCRIENVREKSSKH...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G419890
TK1151 IDTkA05G419890
OH-1004 IDLXL04_021772
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)88.300
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.907 / OH-1004 96.942
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G419890
位置Chr05:104588770-104595005 (-)
描述Similar to N: TMV resistance protein N
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g44510 TIR-NB-LRR受体样蛋白，有助于铜绿假单胞菌三型分泌效应子AvrB诱导的抗病性。
Arabidopsis TAO1 is a TIR-NB-LRR protein that contributes to disease resistance induced by the Pseudomonas syringae effector AvrB.2008 · DOI: 10.1073/pnas.0802157105

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_021772 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0009626 plant-type hypersensitive response 生物过程
GO:0019677 NAD+ catabolic process 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0043068 positive regulation of programmed cell death 生物过程
GO:0050832 defense response to fungus 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0003953 NAD+ nucleosidase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT5G44510
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.377
排名 1 · TkA05G419890 · TK1151
细胞膜0.359
排名 2 · TkA05G419890 · TK1151
细胞核0.325
排名 3 · TkA05G419890 · TK1151
内质网0.077
排名 4 · TkA05G419890 · TK1151
质体0.044
排名 5 · TkA05G419890 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01582TIR20-191 aa
PF13676TIR_222-119 aa
PF23282WHD_ROQ1201-209 aa
PF00931NB-ARC207-364 aa
PF13238AAA_18219-279 aa
PF13401AAA_22220-316 aa
PF00004AAA221-338 aa
PF20720nSTAND3221-257 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G419890PF01582TIR201919.2e-44150.1
TkA05G419890PF13676TIR_2221191.8e-1455.0
TkA05G419890PF23282WHD_ROQ12012092.6e-1660.3
TkA05G419890PF00931NB-ARC2073641.3e-2177.6
TkA05G419890PF13238AAA_182192790.1413.4
TkA05G419890PF13401AAA_222203160.1313.3
TkA05G419890PF00004AAA2213380.01816.2
TkA05G419890PF20720nSTAND32212570.03114.7
TkA05G419890PF05729NACHT2213440.04414.3
TkA05G419890PF23286LRR_133073530.00517.3
TkA05G419890PF20720nSTAND34034490.03114.7
TkA05G419890PF23282WHD_ROQ14395052.6e-1660.3
TkA05G419890PF01582TIR5325789.2e-44150.1
TkA05G419890PF25019LRR_R13L1-DRL216056430.001818.9
TkA05G419890PF23286LRR_136106770.00517.3
TkA05G419890PF12799LRR_46126523.6e-0834.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FI14拟南芥sp|Q9FI14|TAO1_ARATH Disease resistance protein TAO131.700%Swiss-Prot中等置信

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