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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID,查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度,最大 10000 bp

基因概览

TkA05G141810
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 36864661-36868240 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

3279 bp · TkA05G141810|TK1151|cDNA

ATGAATATCCCTGTATCTCTCTATTCGGTGTCCATATCTCTACATCATTCATTCATATAAAAACTACACTTTATTAATGAACAAACCCCTCCATGTCAAACCCCCATCATCCAACAGCTCAAACGCGCACACCCTGATGTTCAGACCCCCAATTCGTGTTTAAAGATCTAAGTTCAAAGTTCCTGAAAGATCCTGAACTACCACACGTCAGTCTCACCATTCAATTCTAGTATTCACTGAAATTTCGCCATTTTGTGAGC...

1536 bp · TkA05G141810|TK1151|CDS

ATGCAGTCGAGGTCGTATACGAATCTTTTGGAGTTGGCTTCAGGTAATTTCCCGGTAATGGGGCGAGAAAGGGAGAAAAGAAAGCTGCCAAGAGTAATGACTGTTCCCGGTAGTATCACCGAGCTTGAAGATGATCAAGCTAGCAGTGTTGCATCTGATAATCCTTCTTCCATTTCCATGGACAGAATGATTATAGCAGCGAATCTGTTACCTCTAAAGGCTAAAAGAAGACCTGATAATAAAGGTTGGAGCTTCACTTG...

511 aa · TkA05G141810|TK1151|PROTEIN

MQSRSYTNLLELASGNFPVMGREREKRKLPRVMTVPGSITELEDDQASSVASDNPSSISMDRMIIAANLLPLKAKRRPDNKGWSFTWDDDSLLFQLKDGFPDDMEVLYVGSLNVDVDPIEQDDVAQLLLDRFGCVPTFLPPNLIEKFYDGFCKKQLWSLFHYMLPFSADHGGRFDQSDWESYVAANKLFSQKVIEVINPEDDFVWIHDYHLMVLPTFLRRRFNRLRMGFFLHSPFPSSEIYRTLPVREEILKALLNSDLI...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G141810
TK1151 IDTkA05G141810
OH-1004 IDLXL04_020132
关系 / 置信度序列支持,注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)99.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 91.977 / OH-1004 53.047
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G141810
位置Chr05:36864661-36868240 (-)
描述Similar to TPS7: Probable alpha,alpha-trehalose-phosphate synthase [UDP-forming] 7
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g06410 可能的α,α-海藻糖-磷酸合酶 [UDP 形成] 7。 暂无已核实直接文献
At4g17770 α,α-海藻糖-磷酸合酶 [UDP-形成] 5。 暂无已核实直接文献
At1g68020 调节植物结构、表皮铺装细胞的形状和毛状体的分支。
At1g23870 可能的 α,α-海藻糖-磷酸合酶 [UDP 形成型] 9。 暂无已核实直接文献
At1g70290 可能的α,α-海藻糖磷酸合酶8[形成UDP]。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源:OH1004 · LXL04_020132 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释(OH1004 来源)
GO:0005992 trehalose biosynthetic process 生物过程
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0003825 alpha,alpha-trehalose-phosphate synthase (UDP-forming) activity 分子功能
GO:0004805 trehalose-phosphatase activity 分子功能
GO:0016757 glycosyltransferase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G06410
ath:AT1G23870
ath:AT1G68020
ath:AT1G70290
ath:AT4G17770
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号,不代表本基因已获得通路功能验证。

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究;参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时,不自动选择表达记录;缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释,不能替代定位实验。

细胞质0.319
排名 1 · TkA05G141810 · TK1151
细胞膜0.253
排名 2 · TkA05G141810 · TK1151
细胞核0.201
排名 3 · TkA05G141810 · TK1151
溶酶体/液泡0.110
排名 4 · TkA05G141810 · TK1151
高尔基体0.110
排名 5 · TkA05G141810 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测,非定位实验结果

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00982Glyco_transf_2062-509 aa
PF17703C19orf84235-277 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G141810PF00982Glyco_transf_20625094.7e-164547.3
TkA05G141810PF17703C19orf842352770.3711.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻;Swiss-Prot 为人工审校条目,TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LMI0拟南芥sp|Q9LMI0|TPS7_ARATH Probable alpha,alpha-trehalose-phosphate synthase [UDP-forming] 777.900%Swiss-Prot高置信
O23617拟南芥sp|O23617|TPS5_ARATH Alpha,alpha-trehalose-phosphate synthase [UDP-forming] 563.500%Swiss-Prot高置信
Q94AH8拟南芥sp|Q94AH8|TPS6_ARATH Alpha,alpha-trehalose-phosphate synthase [UDP-forming] 660.300%Swiss-Prot高置信
Q9LRA7拟南芥sp|Q9LRA7|TPS9_ARATH Probable alpha,alpha-trehalose-phosphate synthase [UDP-forming] 958.500%Swiss-Prot高置信
Q0WUI9拟南芥sp|Q0WUI9|TPS8_ARATH Probable alpha,alpha-trehalose-phosphate synthase [UDP-forming] 858.400%Swiss-Prot高置信

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