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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G107190
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 28708268-28712727 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2821 bp · TkA05G107190|TK1151|cDNA

ATTTGACAAGAGAGTAGTGATAAAGGTTATCCACTTATTCACTAGCATCAGAAATCTGTTGCTTCTTTGGTATGTTTAACATGGACGCCACTAGACGGCGGCGTTTAGACCGTCTCGTTCTAGCCGTTGTTAACGGGTCTTACAGACTCCACTCTACATTTTCCCCGCTCCCTATCTCTCGCTCTCAAACCCTAACAAAGGAAAATTTCGTCCATCTGATATACTCTCTTTTTTCGTCAATTTCAATCCGGCTGCTATGA...

CDS

下载 CDS FASTA

2304 bp · TkA05G107190|TK1151|CDS

ATGATGGAGGAATCAGGGGATATGATGATTGATGCGGATTATGAATACTCAGCCCCCAAATTCTTTGATTTCATCCTAGGAGAAACGGAAGATGAGATGCGTGTAGCACAGCTTTGGTTTGATACGGCACTTACCTATGCTCCTTCACCTTTTATGCACAAGGTCAAGAGTAGTAGAGCTGTTCAGTTAGAGAGCCTATGTGATTTTAGGGAAGCCGACATTTCTCTAAAGGAATCTGTACCATCTGACTCAACAACAAG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

767 aa · TkA05G107190|TK1151|PROTEIN

MMEESGDMMIDADYEYSAPKFFDFILGETEDEMRVAQLWFDTALTYAPSPFMHKVKSSRAVQLESLCDFREADISLKESVPSDSTTSSFHIIKKINLEPEKQSEKAETDPVETKEDASSKDALNTINRITLEKQSEKTESDRVDSKEDLTSKDATNGDKENLPNQVNATPKPHVDTQKKKNTNHQTARKIASAFKNPSALKSHSRSSQPKSTKTPSTLRRDMNQINKAAVVNTPNFTQENQAIKRQKLEGGKTRQILNIK...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G107190
TK1151 IDTkA05G107190
OH-1004 IDLXL04_025568
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)59.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 17.601 / OH-1004 52.713
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G107190
位置Chr05:28708268-28712727 (-)
描述Similar to TPX2: Protein TPX2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g03780 在前期晚期和有丝分裂开始时、核膜破裂 之前调节前纺锤体组装。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_025568 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000278 mitotic cell cycle 生物过程
GO:0051225 spindle assembly 生物过程
GO:0051301 cell division 生物过程
GO:0060236 regulation of mitotic spindle organization 生物过程
GO:0090307 mitotic spindle assembly 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005654 nucleoplasm 细胞组分
GO:0005819 spindle 细胞组分
GO:0005874 microtubule 细胞组分
GO:0005880 nuclear microtubule 细胞组分
GO:0009524 phragmoplast 细胞组分
GO:0009941 chloroplast envelope 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G03780
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.757
排名 1 · TkA05G107190 · TK1151
细胞核0.261
排名 2 · TkA05G107190 · TK1151
细胞膜0.105
排名 3 · TkA05G107190 · TK1151
线粒体0.038
排名 4 · TkA05G107190 · TK1151
内质网0.028
排名 5 · TkA05G107190 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF12214TPX2_importin94-146 aa
PF06886TPX2239-240 aa
PF06886TPX2281-293 aa
PF12214TPX2_importin330-426 aa
PF06886TPX2349-373 aa
PF06886TPX2398-407 aa
PF12214TPX2_importin431-508 aa
PF06886TPX2454-473 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G107190PF12214TPX2_importin941461e-49169.0
TkA05G107190PF06886TPX22392402.5e-2279.3
TkA05G107190PF06886TPX22812932.5e-2279.3
TkA05G107190PF12214TPX2_importin3304261e-49169.0
TkA05G107190PF06886TPX23493732.5e-2279.3
TkA05G107190PF06886TPX23984072.5e-2279.3
TkA05G107190PF12214TPX2_importin4315081e-49169.0
TkA05G107190PF06886TPX24544732.5e-2279.3
TkA05G107190PF22587DNApolII_insertion4594940.005517.4
TkA05G107190PF12214TPX2_importin5295611e-49169.0
TkA05G107190PF06886TPX25435692.5e-2279.3
TkA05G107190PF12214TPX2_importin5886411e-49169.0
TkA05G107190PF06886TPX26116522.5e-2279.3
TkA05G107190PF22587DNApolII_insertion6116420.005517.4
TkA05G107190PF12214TPX2_importin6417031e-49169.0
TkA05G107190PF06886TPX26637382.5e-2279.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
F4I2H7拟南芥sp|F4I2H7|TPX2_ARATH Protein TPX256.200%Swiss-Prot高置信

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