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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G486670
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 122973592-122975383 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

756 bp · TkA04G486670|TK1151|cDNA

AGGGTTCAATTTCCGATTTTGCTGTTCTTGTTTGAAATCCTAAACCCCCTGATTTCGCTGTGATACATATTTAGAAGTTGTAGTTTTCATTATATGTGAAATCTGATTTCTGATTTCGTTTTATATGTGAAATTTGATTTCTGAATTATATGTGAAAATTTGAACTTGTATGAAATCTGATGAACTTGTATCAATGCAGCAATCGAGAGTGGTCAAAACGTGTTACAGAAACACGTTGCATTCTTTGATCGTAACAACGA...

CDS

下载 CDS FASTA

405 bp · TkA04G486670|TK1151|CDS

ATGGGACTTAGTGGCAAAACTCGTCCAGGAAAGAAGTTTCCTAATTTACTTTTCCCAATCGAAATAAAAAACATAAATATGGCCAAACATGGTAGTGATTCCGGAGTTTACGACACTCATGGAAGGTTTGTTAGTTCCAAGTTTGAGGAGATATTTCACAAGTACGCACACACGAATTCGGATGCATTGACTTCAGACGAATTGGACAATTTTATCAAAGGAAATCGGGAACCCAAGGATTATGGAGGATGGAATGGGGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

134 aa · TkA04G486670|TK1151|PROTEIN

MGLSGKTRPGKKFPNLLFPIEIKNINMAKHGSDSGVYDTHGRFVSSKFEEIFHKYAHTNSDALTSDELDNFIKGNREPKDYGGWNGDYTSIIHGKYSHEETVTTAFFVGKYIIVKIWLRQHMCVITFLVANLQL

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G486670
TK1151 IDTkA04G486670
OH-1004 IDLXL04_038942
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)97.300
蛋白覆盖度 (%)TK1151 82.090 / OH-1004 43.137
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G486670
位置Chr04:122973592-122975383 (+)
描述Similar to ISPH: 4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase, chloroplastic
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g70670 钙结合过氧酶参与油体中储存脂质的降解。 暂无已核实直接文献
At1g23240 可能的钙结合过氧化酶。 暂无已核实直接文献
At1g70680 钙结合过氧酶参与油体中储存脂质的降解。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_038942 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0009819 drought recovery 生物过程
GO:0019288 isopentenyl diphosphate biosynthetic process, methylerythritol 4-phosphate pathway 生物过程
GO:0050992 dimethylallyl diphosphate biosynthetic process 生物过程
GO:0005811 lipid droplet 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009570 chloroplast stroma 细胞组分
GO:0004497 monooxygenase activity 分子功能
GO:0005509 calcium ion binding 分子功能
GO:0046429 4-hydroxy-3-methylbut-2-en-1-yl diphosphate synthase activity (ferredoxin) 分子功能
GO:0046872 metal ion binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G70670
ath:AT1G70680
ath:AT4G34350
dosa:Os03g0731900
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞外0.298
排名 1 · TkA04G486670 · TK1151
细胞质0.280
排名 2 · TkA04G486670 · TK1151
内质网0.166
排名 3 · TkA04G486670 · TK1151
线粒体0.147
排名 4 · TkA04G486670 · TK1151
细胞核0.127
排名 5 · TkA04G486670 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF05042Caleosin2-88 aa
PF10384Scm345-61 aa
PF01023S_10050-73 aa
PF10384Scm393-99 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G486670PF05042Caleosin2881.1e-2797.8
TkA04G486670PF10384Scm345610.2511.8
TkA04G486670PF01023S_10050730.0215.2
TkA04G486670PF10384Scm393990.2511.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9CAB7拟南芥sp|Q9CAB7|PXG4_ARATH Probable peroxygenase 455.300%Swiss-Prot高置信
B3H7A9拟南芥sp|B3H7A9|PXG7_ARATH Probable peroxygenase 756.800%Swiss-Prot中等置信
Q9CAB8拟南芥sp|Q9CAB8|PXG5_ARATH Probable peroxygenase 562.700%Swiss-Prot中等置信

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