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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G350780
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 88535697-88540372 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

963 bp · TkA04G350780|TK1151|cDNA

CAGTTAAAAGGAATGAACCTGACAAGGAGTTTTACCTGAAGAATTTGTAAATCTCCCTTTTCTGCAAGAAATTGATTTGACTCGTAACTATATCAGCGGCCGTATTCCGCCACTTTCCGGTCTACCTCGTCTCAGAATTTTGAGTCTTTCGGGAAACCGCATCAATGATTCCATACCTGAATACTTAGGTGATATTTCTACGCTTGAGGAACTGGTGTTAATTGACAATTTGCTTGGAGGACTACTTCCTTCAAGTCTTG...

CDS

下载 CDS FASTA

522 bp · TkA04G350780|TK1151|CDS

ATGAAACGACTTGATTTGCAAGGAACGTCAATGGAAGGACCGATTCCTTCTACAATATCTCAATTGACAAAATTGGAAGAATTGAGGATATCTGATTTGTCTGGATCATCAAGTACCACATTTCTTAATCTGACGAAAATGACAAATTTGAAATATTTGGTTTTGAGAAATTGTTTGCTTAGTGGCTCAATACCTGACTACATTACAGTGGCATATCCGGGGATAAAACTCATAGACCTGAGCTCCAATAGGTTGACTGG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

173 aa · TkA04G350780|TK1151|PROTEIN

MKRLDLQGTSMEGPIPSTISQLTKLEELRISDLSGSSSTTFLNLTKMTNLKYLVLRNCLLSGSIPDYITVAYPGIKLIDLSSNRLTGLIPNSLQLDFDALFLNNNSLSGEIPNFITDDTKNSIDLSYNNFTIVPPEPLRSCRPSMMSLVSALSSVDPSRSAVGKSDVVGFCRR

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G350780
TK1151 IDTkA04G350780
OH-1004 IDLXL04_037782
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)98.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 80.925 / OH-1004 13.703
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G350780
位置Chr04:88535697-88540372 (-)
描述Similar to At1g53430: Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g53430
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g53440 可能的 LRR 受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At1g53440。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_037782 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009861 jasmonic acid and ethylene-dependent systemic resistance 生物过程
GO:0031667 response to nutrient levels 生物过程
GO:0045088 regulation of innate immune response 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0004672 protein kinase activity 分子功能
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G07650
ath:AT1G53420
ath:AT1G53430
ath:AT1G53440
ath:AT3G14840
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.519
排名 1 · TkA04G350780 · TK1151
内质网0.154
排名 2 · TkA04G350780 · TK1151
细胞核0.130
排名 3 · TkA04G350780 · TK1151
细胞质0.108
排名 4 · TkA04G350780 · TK1151
细胞外0.104
排名 5 · TkA04G350780 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00560LRR_12-22 aa
PF13855LRR_82-31 aa
PF12799LRR_42-32 aa
PF23598LRR_149-55 aa
PF24141LRR_ComC10-92 aa
PF25019LRR_R13L1-DRL2121-65 aa
PF25013LRR_Zer-122-68 aa
PF00560LRR_125-34 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G350780PF00560LRR_12222.1e-1348.3
TkA04G350780PF13855LRR_82315.4e-0730.0
TkA04G350780PF12799LRR_42322.7e-0628.1
TkA04G350780PF23598LRR_149550.001518.0
TkA04G350780PF24141LRR_ComC10920.0813.3
TkA04G350780PF25019LRR_R13L1-DRL2121650.02115.5
TkA04G350780PF25013LRR_Zer-122680.008816.9
TkA04G350780PF00560LRR_125342.1e-1348.3
TkA04G350780PF13855LRR_848945.4e-0730.0
TkA04G350780PF12799LRR_448872.7e-0628.1
TkA04G350780PF00560LRR_149682.1e-1348.3
TkA04G350780PF00560LRR_176942.1e-1348.3
TkA04G350780PF00560LRR_11001152.1e-1348.3
TkA04G350780PF12799LRR_41001132.7e-0628.1
TkA04G350780PF24141LRR_ComC1031350.0813.3
TkA04G350780PF13855LRR_81201365.4e-0730.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
C0LGG9拟南芥sp|C0LGG9|Y5344_ARATH Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g5344040.500%Swiss-Prot中等置信

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