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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G258680
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 65392040-65395600 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2664 bp · TkA04G258680|TK1151|cDNA

ATGAAGAAATCGTTTTCGTTTACCTTTCTGGTTCTGCTGACGTGGCTCGCCGCTTTCGTAACGAGTCAAGAAGACGATGCTCGGAGATTACTATCGTTCAAGAAATCGTCGGTGGATTCTGATCCAACCGGAGTTCTATCAGACTGGAAGGCGGCGACGGCAGCGTGTTCATGGCAGGGGGTGGTTTGTTCGAAAGAGAATCGTGTCACGGCGGTGAATCTCACCGGTGGTTACCTCACCGGTACGCTTGACGTATCTGA...

CDS

下载 CDS FASTA

2664 bp · TkA04G258680|TK1151|CDS

ATGAAGAAATCGTTTTCGTTTACCTTTCTGGTTCTGCTGACGTGGCTCGCCGCTTTCGTAACGAGTCAAGAAGACGATGCTCGGAGATTACTATCGTTCAAGAAATCGTCGGTGGATTCTGATCCAACCGGAGTTCTATCAGACTGGAAGGCGGCGACGGCAGCGTGTTCATGGCAGGGGGTGGTTTGTTCGAAAGAGAATCGTGTCACGGCGGTGAATCTCACCGGTGGTTACCTCACCGGTACGCTTGACGTATCTGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

887 aa · TkA04G258680|TK1151|PROTEIN

MKKSFSFTFLVLLTWLAAFVTSQEDDARRLLSFKKSSVDSDPTGVLSDWKAATAACSWQGVVCSKENRVTAVNLTGGYLTGTLDVSELMLITTLTTIDLSANNFSATVDVQSLFHTCTSLRSLSLSKNKLSDSSVLSVSLSNCRNLITLNFSGNKLAIPGVMIGSFKSLKTLSLGYNQFFGEIPSEVGNACGTLQELDLSGNQLTGGLPVTFRSCSSLSTINLAHNYLSGDFLATVVSSMSSLKYLTASFNNITGNLPMA...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G258680
TK1151 IDTkA04G258680
OH-1004 IDLXL04_014147
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)40.300
蛋白覆盖度 (%)TK1151 45.772 / OH-1004 54.435
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G258680
位置Chr04:65392040-65395600 (-)
描述Similar to Systemin receptor SR160
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g13380 受体具有双重特异性激酶活性，作用于含丝氨酸/苏氨酸和含酪氨酸的底物。
BRL1 and BRL3 are novel brassinosteroid receptors that function in vascular differentiation in Arabidopsis.2004 · DOI: 10.1242/dev.01403
At1g55610 具有丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶活性的受体。
BRL1, a leucine-rich repeat receptor-like protein kinase, is functionally redundant with BRI1 in regulating Arabidopsis brassinosteroid signaling.2004 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2004.02214.x
BRL1 and BRL3 are novel brassinosteroid receptors that function in vascular differentiation in Arabidopsis.2004 · DOI: 10.1242/dev.01403

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os09g0293500 可能参与根部的油菜素类固醇 感知。
The role of OsBRI1 and its homologous genes, OsBRL1 and OsBRL3, in rice.2006 · DOI: 10.1104/pp.105.072330
Os08g0342300 可能参与根部的油菜素类固醇 感知。
The role of OsBRI1 and its homologous genes, OsBRL1 and OsBRL3, in rice.2006 · DOI: 10.1104/pp.105.072330
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_014147 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0001578 microtubule bundle formation 生物过程
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009416 response to light stimulus 生物过程
GO:0009647 skotomorphogenesis 生物过程
GO:0009729 detection of brassinosteroid stimulus 生物过程
GO:0009742 brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0009755 hormone-mediated signaling pathway 生物过程
GO:0009791 post-embryonic development 生物过程
GO:0009911 positive regulation of flower development 生物过程
GO:0010224 response to UV-B 生物过程
GO:0010268 brassinosteroid homeostasis 生物过程
GO:0010584 pollen exine formation 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G39400
dosa:Os01g0718300
sly:101261320
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.869
排名 1 · TkA04G258680 · TK1151
内质网0.086
排名 2 · TkA04G258680 · TK1151
细胞质0.064
排名 3 · TkA04G258680 · TK1151
细胞核0.042
排名 4 · TkA04G258680 · TK1151
溶酶体／液泡0.027
排名 5 · TkA04G258680 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF11857DUF337711-36 aa
PF08263LRRNT_224-64 aa
PF14580LRR_972-132 aa
PF24758LRR_At5g5637087-175 aa
PF14580LRR_991-132 aa
PF24048LRR_NXF1-591-136 aa
PF12799LRR_492-136 aa
PF13516LRR_692-105 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G258680PF11857DUF337711360.02115.5
TkA04G258680PF08263LRRNT_224641.7e-0938.5
TkA04G258680PF14580LRR_9721320.1112.7
TkA04G258680PF24758LRR_At5g56370871753.3e-0730.9
TkA04G258680PF14580LRR_9911320.1112.7
TkA04G258680PF24048LRR_NXF1-5911360.311.4
TkA04G258680PF12799LRR_4921364.9e-39132.2
TkA04G258680PF13516LRR_6921050.006817.1
TkA04G258680PF13855LRR_8931569.4e-39131.7
TkA04G258680PF29594LRR_SKP2932475.7e-0626.5
TkA04G258680PF00560LRR_1941051.6e-48152.8
TkA04G258680PF27089PRAME_C981620.09612.4
TkA04G258680PF23952LRR_EndoS1031750.2912.1
TkA04G258680PF13306LRR_51111990.9310.1
TkA04G258680PF27087LRR_TMOD-LMOD1131601.98.8
TkA04G258680PF13516LRR_61161360.006817.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LJF3拟南芥sp|Q9LJF3|BRL3_ARATH Receptor-like protein kinase BRI1-like 348.200%Swiss-Prot中等置信
Q9ZWC8拟南芥sp|Q9ZWC8|BRL1_ARATH Serine/threonine-protein kinase BRI1-like 157.200%Swiss-Prot高置信
Q69JN6水稻sp|Q69JN6|BRL1_ORYSJ Brassinosteroid LRR receptor kinase BRL149.100%Swiss-Prot低置信
Q6ZCZ2水稻sp|Q6ZCZ2|BRL3_ORYSJ Brassinosteroid LRR receptor kinase BRL345.700%Swiss-Prot低置信

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