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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G171970
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 44496718-44498423 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1322 bp · TkA04G171970|TK1151|cDNA

AAGGAATGAAGTATGTTTCAACAACATTGTAATTCAATCACATTCACTTTTAATTCTCTTCTCTTTTCAAGAGTCTGATAGCTTCTTTCTTAAACAACCAAGGCACCATGAAAGCAGTTATTCTTGTTGGAGGTTTTGGAACTCGTTTGAGGCCTTTGACTCTTAGTTTCCCAAAACCCCTTGTTGACTTTGCCAACAAACCCATGATCCTTTACCAGATTGAAGCTCTAAAGACTATAGGTGTCAGTGAAGTGGTTTTA...

CDS

下载 CDS FASTA

1086 bp · TkA04G171970|TK1151|CDS

ATGAAAGCAGTTATTCTTGTTGGAGGTTTTGGAACTCGTTTGAGGCCTTTGACTCTTAGTTTCCCAAAACCCCTTGTTGACTTTGCCAACAAACCCATGATCCTTTACCAGATTGAAGCTCTAAAGACTATAGGTGTCAGTGAAGTGGTTTTAGCTATCAATTACCAACCAGAGGTTATGCTAAACTTTTTGAAGGATTTTGAAACAAAACTTGGGATAAAGATCACGTGCTCACAAGAGACTGAGCCGCTTGGAACTGC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

361 aa · TkA04G171970|TK1151|PROTEIN

MKAVILVGGFGTRLRPLTLSFPKPLVDFANKPMILYQIEALKTIGVSEVVLAINYQPEVMLNFLKDFETKLGIKITCSQETEPLGTAGPLALARDILEDGSGEPFFVLNSDVISEYPLKEMIAFHKTHGGEASIMVTKVDEPSKYGVVVVEESSGRVERFVEKPKIFVGNKINAGIYLLNPSILNRIEPKPTSIEKEIFPKMTLTSQLYAMVLPGFWMDIGQPKDYITGLRLYLDSLRKKSSPKLANGPHIIGNVLVHES...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G171970
TK1151 IDTkA04G171970
OH-1004 IDLXL04_009597
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)32.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 97.507 / OH-1004 95.923
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G171970
位置Chr04:44496718-44498423 (-)
描述Similar to gmppA: Mannose-1-phosphate guanyltransferase alpha
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g39770 胚胎发生过程中必需的蛋白质。
Genetic evidence for the role of GDP-mannose in plant ascorbic acid (vitamin C) biosynthesis.1999 · DOI: 10.1073/pnas.96.7.4198
Identification of ascorbic acid-deficient Arabidopsis thaliana mutants.2000 · DOI: 10.1093/genetics/154.2.847
Arabidopsis cyt1 mutants are deficient in a mannose-1-phosphate guanylyltransferase and point to a requirement of N-linked glycosylation for cellulose biosynthesis.2001 · DOI: 10.1073/pnas.051625798
Leaf vitamin C contents modulate plant defense transcripts and regulate genes that control development through hormone signaling.2003 · DOI: 10.1105/tpc.010538
The timing of senescence and response to pathogens is altered in the ascorbate-deficient Arabidopsis mutant vitamin c-1.2004 · DOI: 10.1104/pp.103.032185
Ascorbic acid deficiency activates cell death and disease resistance responses in Arabidopsis.2005 · DOI: 10.1104/pp.105.067686
Modulation of plant morphology, root architecture, and cell structure by low vitamin C in Arabidopsis thaliana.2006 · DOI: 10.1093/jxb/erl010
Antioxidant status, peroxidase activity, and PR protein transcript levels in ascorbate-deficient Arabidopsis thaliana vtc mutants.2008 · DOI: 10.1093/jxb/ern229
Environmental stress sensitivity of an ascorbic acid-deficient Arabidopsis mutant.1996 · DOI: 10.1073/pnas.93.18.9970
L-ascorbic acid metabolism in the ascorbate-deficient arabidopsis mutant vtc1.1997 · DOI: 10.1104/pp.115.3.1277
At3g55590 催化 Smirnoff-Wheeler 途径的反应，这是植物中抗坏血酸生物合成的主要途径。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os08g0237200 催化 Smirnoff-Wheeler 途径的反应，这是植物中抗坏血酸生物合成的主要途径。 暂无已核实直接文献
Os03g0268400 催化 Smirnoff-Wheeler 途径的反应，这是植物中抗坏血酸生物合成的主要途径。 暂无已核实直接文献
Os01g0847200 催化 Smirnoff-Wheeler 途径的反应，这是植物中抗坏血酸生物合成的主要途径。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_009597 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009298 GDP-mannose biosynthetic process 生物过程
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0004475 mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GTP) activity 分子功能
GO:0005525 GTP binding 分子功能
GO:0016740 transferase activity 分子功能
GO:0016779 nucleotidyltransferase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ddi:DDB_G0271858
dre:393469
xla:444472
xtr:779654
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.654
排名 1 · TkA04G171970 · TK1151
细胞核0.278
排名 2 · TkA04G171970 · TK1151
质体0.119
排名 3 · TkA04G171970 · TK1151
线粒体0.093
排名 4 · TkA04G171970 · TK1151
过氧化物酶体0.062
排名 5 · TkA04G171970 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00483NTP_transferase2-233 aa
PF12804NTP_transf_33-137 aa
PF02348CTP_transf_323-52 aa
PF07959Fucose_pyrophosphorylase104-165 aa
PF14602Hexapep_2172-178 aa
PF25084LbH_EIF2B241-336 aa
PF25087GMPPB_C251-360 aa
PF25247LbH_GLGC251-270 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G171970PF00483NTP_transferase22336.4e-60203.5
TkA04G171970PF12804NTP_transf_331371.5e-0938.9
TkA04G171970PF02348CTP_transf_323520.113.1
TkA04G171970PF07959Fucose_pyrophosphorylase1041650.09712.3
TkA04G171970PF14602Hexapep_21721789.06.8
TkA04G171970PF25084LbH_EIF2B2413366.9e-1142.8
TkA04G171970PF25087GMPPB_C2513604.7e-43146.2
TkA04G171970PF25247LbH_GLGC2512700.002118.7
TkA04G171970PF24894Hexapep_GlmU2522720.0002122.1
TkA04G171970PF00132Hexapep2612934.7e-0936.3
TkA04G171970PF07959Fucose_pyrophosphorylase2613070.09712.3
TkA04G171970PF14602Hexapep_22622859.06.8
TkA04G171970PF24894Hexapep_GlmU2733360.0002122.1
TkA04G171970PF25247LbH_GLGC2853320.002118.7
TkA04G171970PF00132Hexapep2903224.7e-0936.3
TkA04G171970PF00132Hexapep3253374.7e-0936.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O22287拟南芥sp|O22287|GMPP1_ARATH Mannose-1-phosphate guanylyltransferase 184.800%Swiss-Prot高置信
Q9M2S0拟南芥sp|Q9M2S0|GMPP2_ARATH Probable mannose-1-phosphate guanylyltransferase 279.700%Swiss-Prot高置信
Q6Z9A3水稻sp|Q6Z9A3|GMPP3_ORYSJ Probable mannose-1-phosphate guanylyltransferase 383.700%Swiss-Prot高置信
Q84JH5水稻sp|Q84JH5|GMPP1_ORYSJ Probable mannose-1-phosphate guanylyltransferase 183.700%Swiss-Prot高置信
Q941T9水稻sp|Q941T9|GMPP2_ORYSJ Probable mannose-1-phosphate guanylyltransferase 283.700%Swiss-Prot高置信

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