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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G158100
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 40893344-40902558 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

7383 bp · TkA04G158100|TK1151|cDNA

GTGGGCCCTACGCCCAACAATGGCACCTTGTTGTAAAGATGAGCTGGTACCCCTGCCATCCTCTATAAAATCAACTTACCACCCACCTCGTCGAGACCGAGAAAAACCCCACCCACCACAACTCTCTCTCTCTTTCTCTCTCTCTCGTGTGTCTGTGCATATCCGCAGCCGTGGGCTGCTAAGTCGGTTGTTCAGTTTTGTTCGTTTTATCTTAAGATTCCCCTTTAATCATATAACCAGCATATTCAATCCATATTCAA...

CDS

下载 CDS FASTA

6660 bp · TkA04G158100|TK1151|CDS

ATGTCGGTGGCTTTGAATCATGTTGTTCAGGCTCGGCCCGACCCGGACGTAACAAAATCCTTCGGTTCCCGTCCGTTAAACGGCTTAGCTCGGGTTGGGGTTAGCCGGAGCCGGACATGGGCAAGCCGTGGCTCGGTTGTTAAACAGTCTAGTCTCTTAGGGAAAAGTTTCTACGGGACTAGGCTGCTTCGTGGGTCCGTTTCCGAGACGCTCCATCAATGGAAATCCGATGGTCCTGGCCGTGATCCGAAGCTTAAGGT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

2219 aa · TkA04G158100|TK1151|PROTEIN

MSVALNHVVQARPDPDVTKSFGSRPLNGLARVGVSRSRTWASRGSVVKQSSLLGKSFYGTRLLRGSVSETLHQWKSDGPGRDPKLKVVVRSSLSLVPEKPLGLYDPSFDKDACGVGFVAELSGKSNRNTVTDAIEMLVRMSHRGACGCETNTGDGAGILVGLPHDFYKEVAKDEGFELPEPGKYAVGMFFLPTSETRREQSKIVFTKVAESLGHTVLGWRTVPTDNSGLGKSAIQTEPVIEQVFLTPTSRSKADFEQQMY...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G158100
TK1151 IDTkA04G158100
OH-1004 IDLXL04_035178
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G158100
位置Chr04:40893344-40902558 (-)
描述Similar to GLT1: Glutamate synthase 1 [NADH], chloroplastic
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g53460 参与谷氨酸生物合成。
Arabidopsis glt1-T mutant defines a role for NADH-GOGAT in the non-photorespiratory ammonium assimilatory pathway.2002 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2002.01218.x

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os01g0681900 参与谷氨酸生物合成，并在幼苗根中初级铵离子同化中发挥主要作用。 暂无已核实直接文献
Os05g0555600 参与谷氨酸生物合成。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_035178 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006537 glutamate biosynthetic process 生物过程
GO:0019676 ammonia assimilation cycle 生物过程
GO:0048589 developmental growth 生物过程
GO:0060359 response to ammonium ion 生物过程
GO:0097054 L-glutamate biosynthetic process 生物过程
GO:0005759 mitochondrial matrix 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0009501 amyloplast 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009536 plastid 细胞组分
GO:0009570 chloroplast stroma 细胞组分
GO:0005506 iron ion binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT5G53460
dosa:Os01g0681900
dosa:Os05g0555600
osa:4324398
spo:2543509
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.370
排名 1 · TkA04G158100 · TK1151
线粒体0.243
排名 2 · TkA04G158100 · TK1151
质体0.177
排名 3 · TkA04G158100 · TK1151
细胞核0.151
排名 4 · TkA04G158100 · TK1151
细胞膜0.071
排名 5 · TkA04G158100 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00310GATase_2113-540 aa
PF04898Glu_syn_central590-878 aa
PF00890FAD_binding_2715-739 aa
PF01266DAO855-967 aa
PF01645Glu_synthase945-1313 aa
PF00743FMO-like1166-1220 aa
PF04898Glu_syn_central1201-1316 aa
PF01493GXGXG1375-1623 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G158100PF00310GATase_21135406.2e-184612.3
TkA04G158100PF04898Glu_syn_central5908784.1e-111371.6
TkA04G158100PF00890FAD_binding_27157390.0001521.8
TkA04G158100PF01266DAO8559677.5e-0729.7
TkA04G158100PF01645Glu_synthase94513132.2e-147491.8
TkA04G158100PF00743FMO-like116612200.003916.4
TkA04G158100PF04898Glu_syn_central120113164.1e-111371.6
TkA04G158100PF01493GXGXG137516231.1e-108363.1
TkA04G158100PF00890FAD_binding_2153916960.0001521.8
TkA04G158100PF028262-Hacid_dh_C153915970.3311.0
TkA04G158100PF26508DUF8170161916970.3111.1
TkA04G158100PF00582Usp162516530.2312.7
TkA04G158100PF14691Fer4_20172918403.5e-2279.0
TkA04G158100PF028262-Hacid_dh_C184518850.3311.0
TkA04G158100PF13241NAD_binding_7185118850.001220.1
TkA04G158100PF00670AdoHcyase_NAD185118900.2512.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LV03拟南芥sp|Q9LV03|GLUT1_ARATH Glutamate synthase 1 [NADH], chloroplastic83.600%Swiss-Prot高置信
Q0JKD0水稻sp|Q0JKD0|GLT1_ORYSJ Glutamate synthase 1 [NADH], chloroplastic78.500%Swiss-Prot高置信
Q0DG35水稻sp|Q0DG35|GLT2_ORYSJ Glutamate synthase 2 [NADH], chloroplastic77.000%Swiss-Prot高置信

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