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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G122520
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 31824573-31825890 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

591 bp · TkA04G122520|TK1151|cDNA

TTTATTCCTAGTGTTTATGGTTTAGATAGCTTTACGGGGTCGATCATACACTCAAGTGAATACCAAAATGGAAAGATATTTGGGAACAAAAATGTTTTTGTTGTTGGTGCTGGCAATTCTGGAATGGAAATTGCTTATGATTTGTCCAACTGGGGTGCCCAAACATTCATCCTTGTTCGTAGCCCTGTAAGTTTTTTTATCAGTGGAGCTCTTTGTAAATATGGAATACAAAGACCAAGAAAAGGGCCATTTTGTCTTAA...

CDS

下载 CDS FASTA

591 bp · TkA04G122520|TK1151|CDS

TTTATTCCTAGTGTTTATGGTTTAGATAGCTTTACGGGGTCGATCATACACTCAAGTGAATACCAAAATGGAAAGATATTTGGGAACAAAAATGTTTTTGTTGTTGGTGCTGGCAATTCTGGAATGGAAATTGCTTATGATTTGTCCAACTGGGGTGCCCAAACATTCATCCTTGTTCGTAGCCCTGTAAGTTTTTTTATCAGTGGAGCTCTTTGTAAATATGGAATACAAAGACCAAGAAAAGGGCCATTTTGTCTTAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

196 aa · TkA04G122520|TK1151|PROTEIN

FIPSVYGLDSFTGSIIHSSEYQNGKIFGNKNVFVVGAGNSGMEIAYDLSNWGAQTFILVRSPVSFFISGALCKYGIQRPRKGPFCLKRETGPVIDVGTVARIKTGDIVVMSTIEEVKGDQIKFTDGQEKRYDGIVFATGFTSTVRKWLKDDRGLFNEKGMPYLKSPNHWKGEHGLILCWICKCWIVRNFEGCKEHC

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G122520
TK1151 IDTkA04G122520
OH-1004 IDLXL04_035576
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)73.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 89.286 / OH-1004 54.331
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G122520
位置Chr04:31824573-31825890 (+)
描述Similar to YUC11: Probable indole-3-pyruvate monooxygenase YUCCA11
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g21430 参与生长素生物合成。
Auxin synthesized by the YUCCA flavin monooxygenases is essential for embryogenesis and leaf formation in Arabidopsis.2007 · DOI: 10.1105/tpc.107.053009
At1g48910 参与生长素生物合成。
Auxin synthesized by the YUCCA flavin monooxygenases is essential for embryogenesis and leaf formation in Arabidopsis.2007 · DOI: 10.1105/tpc.107.053009
At5g25620 通过吲哚-3-丙酮酸 途径参与生长素生物合成。
Auxin biosynthesis by the YUCCA flavin monooxygenases controls the formation of floral organs and vascular tissues in Arabidopsis.2006 · DOI: 10.1101/gad.1415106
yucca6, a dominant mutation in Arabidopsis, affects auxin accumulation and auxin-related phenotypes.2007 · DOI: 10.1104/pp.107.104935
Overexpression of Arabidopsis YUCCA6 in potato results in high-auxin developmental phenotypes and enhanced resistance to water deficit.2013 · DOI: 10.1093/mp/sss100
The biochemical mechanism of auxin biosynthesis by an arabidopsis YUCCA flavin-containing monooxygenase.2013 · DOI: 10.1074/jbc.m112.424077
At5g11320 参与生长素生物合成。
Auxin biosynthesis by the YUCCA flavin monooxygenases controls the formation of floral organs and vascular tissues in Arabidopsis.2006 · DOI: 10.1101/gad.1415106
Auxin synthesized by the YUCCA flavin monooxygenases is essential for embryogenesis and leaf formation in Arabidopsis.2007 · DOI: 10.1105/tpc.107.053009

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os01g0224700 参与花药中的生长素生物合成。
OsFTIP7 determines auxin-mediated anther dehiscence in rice.2018 · DOI: 10.1038/s41477-018-0175-0
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_035576 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006979 response to oxidative stress 生物过程
GO:0009635 response to herbicide 生物过程
GO:0009723 response to ethylene 生物过程
GO:0009819 drought recovery 生物过程
GO:0009851 auxin biosynthetic process 生物过程
GO:0010038 response to metal ion 生物过程
GO:0010262 somatic embryogenesis 生物过程
GO:0000139 Golgi membrane 细胞组分
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005654 nucleoplasm 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G04180
ath:AT1G21430
ath:AT1G48910
ath:AT5G11320
ath:AT5G25620
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.328
排名 1 · TkA04G122520 · TK1151
过氧化物酶体0.249
排名 2 · TkA04G122520 · TK1151
线粒体0.120
排名 3 · TkA04G122520 · TK1151
细胞核0.113
排名 4 · TkA04G122520 · TK1151
细胞外0.101
排名 5 · TkA04G122520 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00743FMO-like4-61 aa
PF13434Lys_Orn_oxgnase12-51 aa
PF13738Pyr_redox_315-163 aa
PF07992Pyr_redox_227-61 aa
PF01946Thi427-60 aa
PF01488Shikimate_DH28-58 aa
PF00899ThiF29-59 aa
PF00070Pyr_redox31-62 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G122520PF00743FMO-like4611.8e-1453.8
TkA04G122520PF13434Lys_Orn_oxgnase12511.4e-0525.2
TkA04G122520PF13738Pyr_redox_3151636.3e-1039.5
TkA04G122520PF07992Pyr_redox_227617.2e-0729.6
TkA04G122520PF01946Thi427600.1112.5
TkA04G122520PF01488Shikimate_DH28580.1812.6
TkA04G122520PF00899ThiF29590.1212.3
TkA04G122520PF00070Pyr_redox31626.1e-0524.2
TkA04G122520PF01134GIDA32600.008715.9
TkA04G122520PF01266DAO32600.1112.7
TkA04G122520PF00743FMO-like921421.8e-1453.8
TkA04G122520PF01488Shikimate_DH1011130.1812.6
TkA04G122520PF07992Pyr_redox_21071447.2e-0729.6
TkA04G122520PF01266DAO1131430.1112.7
TkA04G122520PF13434Lys_Orn_oxgnase1251411.4e-0525.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LPL3拟南芥sp|Q9LPL3|YUC11_ARATH Probable indole-3-pyruvate monooxygenase YUCCA1146.200%Swiss-Prot中等置信
Q9FVQ0拟南芥sp|Q9FVQ0|YUC10_ARATH Probable indole-3-pyruvate monooxygenase YUCCA1042.500%Swiss-Prot中等置信
Q8VZ59拟南芥sp|Q8VZ59|YUC6_ARATH Indole-3-pyruvate monooxygenase YUCCA645.100%Swiss-Prot中等置信
Q9LFM5拟南芥sp|Q9LFM5|YUC4_ARATH Probable indole-3-pyruvate monooxygenase YUCCA443.700%Swiss-Prot中等置信
Q9LG41水稻sp|Q9LG41|YUC4_ORYSJ Indole-3-pyruvate monooxygenase YUCCA438.000%Swiss-Prot中等置信

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