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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G011380
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 2773600-2785260 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

6511 bp · TkA04G011380|TK1151|cDNA

AGCGCTCACGTTAGCCAAAGACACGAGCTCTTCTAATCCTCAAACCCACGCACCCTCTGCGCACAATAGCGTAACCCCCTTCTTTAAACCAAATTCATATCTGTTTCTTTCCGTATGTGAATCCCCCTCTTCCACAGAACCCACACAAAGCCCCTCTTCCCCTTCGGAATTCTAGGGTTTCATCATTCGTCACTCACAGTGATAGTTGAAATAGGGTTTTTCGTGGTCTTAGCGACTTATCGTCTCTGATAGTCATAATT...

CDS

下载 CDS FASTA

3906 bp · TkA04G011380|TK1151|CDS

ATGGCGCCGAATCGGAGAAAAGGTGCCAGTAAAGCCGCTGCAGCCGCCGCCGCTTGTCGGCAGTGGAAGGTCGGCGATCTTGTTCTTGCCAAGGTGAAAGGATTCCCTGCTTGGCCTGCTACGGTTAGTGAACCTGAGAAGTGGGGGTACTCTACTGATTGGAAGAAAGTTCTAGTCTTCTTCTTTGGAACCCAACAAATAGCATTCTGCAATCCAGGTGATGTTGAGGCATTTACAGAAGAAAAAAAAGACTCCCTTTT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1301 aa · TkA04G011380|TK1151|PROTEIN

MAPNRRKGASKAAAAAAACRQWKVGDLVLAKVKGFPAWPATVSEPEKWGYSTDWKKVLVFFFGTQQIAFCNPGDVEAFTEEKKDSLLSKRHGKGADFVRAVREIIDSYEELKKQVQVDTTDNTTANQTPSTNPKSEEDEQQHVVLNEKPLTVTPSIDPCPQISDSSKPNGDVKVPEVSETILETTTKAPPVPTTYSRKKHSAIHARVPSARRSARTESSKSQNPTEDSAAGGMSNGNLSRRAKRARTSPHSSDKDIVSKS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G011380
TK1151 IDTkA04G011380
OH-1004 IDLXL04_036996
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G011380
位置Chr04:2773600-2785260 (-)
描述Similar to HULK3: Protein HUA2-LIKE 3
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g63070 可能的转录因子，与 HULK1 和 HULK2 具有部分冗余作用。
A plant-specific HUA2-LIKE (HULK) gene family in Arabidopsis thaliana is essential for development.2014 · DOI: 10.1111/tpj.12629
At2g48160 可能的转录因子，与 HULK1 和 HULK3 具有部分冗余作用。
A plant-specific HUA2-LIKE (HULK) gene family in Arabidopsis thaliana is essential for development.2014 · DOI: 10.1111/tpj.12629
At5g23150 通过提高FLC、FLM/MAF1、MAF2和SVP等延迟开花基因的表达，抑制开花的转录因子。
HUA1 and HUA2 are two members of the floral homeotic AGAMOUS pathway.1999 · DOI: 10.1016/s1097-2765(00)80462-1
Two RNA binding proteins, HEN4 and HUA1, act in the processing of AGAMOUS pre-mRNA in Arabidopsis thaliana.2003 · DOI: 10.1016/s1534-5807(02)00399-4
HUA2 is required for the expression of floral repressors in Arabidopsis thaliana.2005 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2004.02300.x
Natural variation for anthocyanin accumulation under high-light and low-temperature stress is attributable to the ENHANCER OF AG-4 2 (HUA2) locus in combination with PRODUCTION OF ANTHOCYANIN PIGMENT1 (PAP1) and PAP2.2015 · DOI: 10.1111/nph.13177
At5g08230 可能的转录因子，与 HULK2 和 HULK3 具有部分冗余作用。
A plant-specific HUA2-LIKE (HULK) gene family in Arabidopsis thaliana is essential for development.2014 · DOI: 10.1111/tpj.12629

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_036996 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006338 chromatin remodeling 生物过程
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006397 mRNA processing 生物过程
GO:0009908 flower development 生物过程
GO:0009910 negative regulation of flower development 生物过程
GO:0030154 cell differentiation 生物过程
GO:0043481 anthocyanin accumulation in tissues in response to UV light 生物过程
GO:0048497 maintenance of floral organ identity 生物过程
GO:0048510 regulation of timing of transition from vegetative to reproductive phase 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0003700 DNA-binding transcription factor activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G48160
ath:AT3G63070
ath:AT5G23150
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.956
排名 1 · TkA04G011380 · TK1151
细胞质0.108
排名 2 · TkA04G011380 · TK1151
细胞膜0.035
排名 3 · TkA04G011380 · TK1151
内质网0.018
排名 4 · TkA04G011380 · TK1151
质体0.010
排名 5 · TkA04G011380 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00855PWWP25-108 aa
PF12243CTK3794-912 aa
PF04818CID795-917 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G011380PF00855PWWP251081e-1868.3
TkA04G011380PF12243CTK37949122.3e-0628.4
TkA04G011380PF04818CID7959171.7e-1041.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
F4IZM8拟南芥sp|F4IZM8|HUAL3_ARATH Protein HUA2-LIKE 333.100%Swiss-Prot中等置信
F4IN78拟南芥sp|F4IN78|HUAL2_ARATH Protein HUA2-LIKE 232.200%Swiss-Prot中等置信
Q9XER9拟南芥sp|Q9XER9|HUA2_ARATH ENHANCER OF AG-4 protein 229.900%Swiss-Prot低置信
Q9LEY4拟南芥sp|Q9LEY4|HUAL1_ARATH Protein HUA2-LIKE 150.500%Swiss-Prot低置信

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