基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
TkA04G007210
当前版本: TK1151
染色体: Chr04
坐标: 1706829-1714907
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA2358 bp · TkA04G007210|TK1151|cDNA
GATTTCACAGACGATCGGGAACCATCTTCGTCAAATAATGACAGCTTGGACATATCAAGGTTTTCAATAGAGAATGAGGTTGCCCGATCGGAGAGGCAAGGGCGTTTCTGAGGTTTAGAAGATGATGTGGGGTTATTATTGTTGGTGTTATCGGATTTATCTAGGGTTTTGTTGAGCGTGGTAGGGAGATAAAAAGGTCTCCAGCTATGGAGCTGGAACGTACATGTATCTATGGCGTGACGCGAACTTCCTATGGTTCT...
CDS
下载 CDS FASTA1563 bp · TkA04G007210|TK1151|CDS
ATGTCGAATGTTGTTCATCTTCTTATTCTCTTTCTTCTTCTGGTGATCGGAAGTTCTAACGATGTACGATTCTTCGTATACGGCGTGGCTGATGAATATCGAAGAGAAGATTTTCCCGCTGAATTCGTGTTTGGTTCAGGAACTTCCGCTTATCAGGTTGAAGGAGCAGTACTGGAAGATGGAAGGACTTTCAGCATTTGGGACACATTCGCTCATACAGGCTACTACAATGGAGCAAATGGAGACATAGCATGTGACGG...
520 aa · TkA04G007210|TK1151|PROTEIN
MSNVVHLLILFLLLVIGSSNDVRFFVYGVADEYRREDFPAEFVFGSGTSAYQVEGAVLEDGRTFSIWDTFAHTGYYNGANGDIACDGYHKYKEDIELMAKTGLEAFRFSISWSRLIPDGRGPVNVKGLQFYNDFINRLIAHGIQPHVTLHHDDLPQILENEYGGWLSRKSVKDYVAYADICFREFGDRVLHWTTFNEANVFTLGGYDMGFSPPGRCSTPFGLINCTVGNSTYEPYLAAHHLLLAHASTVRLYRKKYKAMQ...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | TkA04G007210 |
|---|---|
| TK1151 ID | TkA04G007210 |
| OH-1004 ID | LXL04_037063 |
| 关系 / 置信度 | 序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核 |
| 蛋白一致性 (%) | 99.800 |
| 蛋白覆盖度 (%) | TK1151 98.077 / OH-1004 49.611覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。 |
| 版本 | TK1151 / GWHBCHF00000000 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | TkA04G007210 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr04:1706829-1714907 (+) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 描述 | Similar to LCT: Lactase-phlorizin hydrolase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0001666 response to hypoxia 生物过程 GO:0005990 lactose catabolic process 生物过程 GO:0007584 response to nutrient 生物过程 GO:0009410 response to xenobiotic stimulus 生物过程 GO:0009725 response to hormone 生物过程 GO:0009744 response to sucrose 生物过程 GO:0010040 response to iron(II) ion 生物过程 GO:0010045 response to nickel cation 生物过程 GO:0010288 response to lead ion 生物过程 GO:0042594 response to starvation 生物过程 GO:0043627 response to estrogen 生物过程 GO:0045471 response to ethanol 生物过程 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | hsa:3938 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
溶酶体／液泡0.346
内质网0.266
质体0.106
细胞质0.087
细胞膜0.070
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF00232Glyco_hydro_136-498 aaPF00150Cellulase90-176 aaPF00150Cellulase268-291 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| TkA04G007210 | PF00232 | Glyco_hydro_1 | 36 | 498 | 2.6e-139 | 465.4 |
| TkA04G007210 | PF00150 | Cellulase | 90 | 176 | 0.0015 | 18.8 |
| TkA04G007210 | PF00150 | Cellulase | 268 | 291 | 0.0015 | 18.8 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
B3H5Q1 | 拟南芥 | sp|B3H5Q1|BGL11_ARATH Beta-glucosidase 11 | 59.000% | Swiss-Prot | 高置信 |
Q93ZI4 | 拟南芥 | sp|Q93ZI4|BGL10_ARATH Beta-glucosidase 10 | 54.300% | Swiss-Prot | 高置信 |
Q3ECW8 | 拟南芥 | sp|Q3ECW8|BGL01_ARATH Beta-glucosidase 1 | 69.700% | Swiss-Prot | 高置信 |
O65458 | 拟南芥 | sp|O65458|BGL03_ARATH Beta-glucosidase 3 | 67.500% | Swiss-Prot | 高置信 |
Q9ZUI3 | 拟南芥 | sp|Q9ZUI3|BGL04_ARATH Beta-glucosidase 4 | 58.800% | Swiss-Prot | 高置信 |
Q60DX8 | 水稻 | sp|Q60DX8|BGL22_ORYSJ Beta-glucosidase 22 | 57.100% | Swiss-Prot | 高置信 |
Q0DIT2 | 水稻 | sp|Q0DIT2|BGL19_ORYSJ Beta-glucosidase 19 | 61.400% | Swiss-Prot | 高置信 |
B7F8N7 | 水稻 | sp|B7F8N7|BGL02_ORYSJ Beta-glucosidase 2 | 60.900% | Swiss-Prot | 高置信 |
Q8RZL1 | 水稻 | sp|Q8RZL1|BGL03_ORYSJ Beta-glucosidase 3 | 61.400% | Swiss-Prot | 高置信 |
Q60DY1 | 水稻 | sp|Q60DY1|BGL21_ORYSJ Beta-glucosidase 21 | 58.600% | Swiss-Prot | 高置信 |