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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G617640
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 156944965-156948583 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2271 bp · TkA03G617640|TK1151|cDNA

GGGTATGCAAGTGCATACCCTTGTTACATGCTAGATCCGCCCCTGTCCGTAACTCCGAGTAATTAAACTAAACCACTTTCAGAAACATAAATTTGTGGATGTTAAACAAATTATACTTTTAGTAAGCTTGAGAAATTAGTTTGACTTTCGATGATCAAGAGATACAAAACCGAATTATAGTGTATATGTTTCATCGCAATGTTACAAGATAAAGAAAAACGCAACTATATTTGTTGATTAATTTAGGGGTTGAATGTTCA...

CDS

下载 CDS FASTA

1311 bp · TkA03G617640|TK1151|CDS

ATGCCGTCTGAACTAATGGAGTCACATGGTTTATCGTTCTTATCGGAAGAGGTGGAGCATCCGAATGAGAAACGAATTGGGTTCATGAAGACAGATGGTGTGCCTGACAACTATGGTGTAAAAGACGGGAAAGTATATGCAGTTGGCGACAGTTCGGTTGTGGAGAAACAGATGTCATCTGATTCTCGTCAGATGTTGAACCACTTTGATGTTTACCGGAGCCAAGACCATAGAGTTCATATTAGCTTAGAGAATAACGC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

436 aa · TkA03G617640|TK1151|PROTEIN

MPSELMESHGLSFLSEEVEHPNEKRIGFMKTDGVPDNYGVKDGKVYAVGDSSVVEKQMSSDSRQMLNHFDVYRSQDHRVHISLENNAVGAGSHSLRRGVDNSDKGNRSNLNNNNIIAGTRFNAMGDHYENGLFSSSLSDLFSRKLRLSSGNSGMYGHSVGAAGSQSQSQSQYEEEEPFESLEEIEAQTIGNLLPDDDDLLSGVTDGVEYCKVQADDVEELDFFSSVGGMELGEDGGQPPQSQSHGENPNPPSRTLFVRNI...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G617640
TK1151 IDTkA03G617640
OH-1004 IDLXL04_011764
关系 / 置信度序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)98.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.312 / OH-1004 48.652
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G617640
位置Chr03:156944965-156948583 (-)
描述Similar to ML1: Protein MEI2-like 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g29400 可能的RNA结合蛋白，在减数分裂和营养生长中发挥作用。 暂无已核实直接文献
At5g61960 可能的RNA结合转录激活因子，在减数分裂和营养生长中起作用。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os02g0517531 可能的RNA结合蛋白，可能在生长调节中发挥作用。 暂无已核实直接文献
Os02g0719800 可能的RNA结合蛋白，可能在生长调节中发挥作用。 暂无已核实直接文献
Os05g0102800 可能的RNA结合蛋白，可能在生长调节中发挥作用。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_011764 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0045836 positive regulation of meiotic nuclear division 生物过程
GO:0045927 positive regulation of growth 生物过程
GO:0051321 meiotic cell cycle 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0003723 RNA binding 分子功能
GO:0003729 mRNA binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT5G07290
ath:AT5G61960
dosa:Os02g0719800
dosa:Os05g0102800
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.799
排名 1 · TkA03G617640 · TK1151
细胞质0.260
排名 2 · TkA03G617640 · TK1151
细胞膜0.038
排名 3 · TkA03G617640 · TK1151
内质网0.027
排名 4 · TkA03G617640 · TK1151
溶酶体／液泡0.021
排名 5 · TkA03G617640 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08080zf-RNPHF138-168 aa
PF13893RRM_5237-324 aa
PF16842RRM_occluded253-320 aa
PF00076RRM_1255-319 aa
PF15513DUF4651268-284 aa
PF26953DUF8301296-331 aa
PF13893RRM_5337-368 aa
PF16842RRM_occluded339-381 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G617640PF08080zf-RNPHF1381680.2811.7
TkA03G617640PF13893RRM_52373248.6e-0832.6
TkA03G617640PF16842RRM_occluded2533201.3e-0628.9
TkA03G617640PF00076RRM_12553191.2e-1764.2
TkA03G617640PF15513DUF46512682840.1512.3
TkA03G617640PF26953DUF83012963310.1213.6
TkA03G617640PF13893RRM_53373688.6e-0832.6
TkA03G617640PF16842RRM_occluded3393811.3e-0628.9
TkA03G617640PF00076RRM_13403931.2e-1764.2
TkA03G617640PF15513DUF46513523650.1512.3
TkA03G617640PF26953DUF83013733920.1213.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8VWF5拟南芥sp|Q8VWF5|AML5_ARATH Protein MEI2-like 551.200%Swiss-Prot中等置信
Q8W4I9拟南芥sp|Q8W4I9|AML1_ARATH Protein MEI2-like 144.600%Swiss-Prot中等置信
Q64M78水稻sp|Q64M78|OML4_ORYSJ Protein MEI2-like 446.600%Swiss-Prot中等置信
Q6ZI17水稻sp|Q6ZI17|OML2_ORYSJ Protein MEI2-like 255.900%Swiss-Prot中等置信
Q75M35水稻sp|Q75M35|OML3_ORYSJ Protein MEI2-like 349.500%Swiss-Prot中等置信

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