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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G594480
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 150975682-150978995 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1718 bp · TkA03G594480|TK1151|cDNA

GTGGCGGAATTGATAGAGACGGATCTTATTTTGATTGGATGCACCGCCATAGAAGACAAGCTTCAAGAAGGTGTGCCGGCATGTATAGAAACTCTTGCTAAAGCTGGAATTAAGATTTGGGTGCTCACAGGTGATAAACTAGAAACAGCGATCAATATAGCTTACGCTTGCAAGTTGATCAACAATGAGATGAAACAATTTGTAATCAGTTCAGAAACCGATGCGATCAGAGATGTTGAAAACAGAGGTGATCCGGTGGA...

CDS

下载 CDS FASTA

1650 bp · TkA03G594480|TK1151|CDS

GTGGCGGAATTGATAGAGACGGATCTTATTTTGATTGGATGCACCGCCATAGAAGACAAGCTTCAAGAAGGTGTGCCGGCATGTATAGAAACTCTTGCTAAAGCTGGAATTAAGATTTGGGTGCTCACAGGTGATAAACTAGAAACAGCGATCAATATAGCTTACGCTTGCAAGTTGATCAACAATGAGATGAAACAATTTGTAATCAGTTCAGAAACCGATGCGATCAGAGATGTTGAAAACAGAGGTGATCCGGTGGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

549 aa · TkA03G594480|TK1151|PROTEIN

VAELIETDLILIGCTAIEDKLQEGVPACIETLAKAGIKIWVLTGDKLETAINIAYACKLINNEMKQFVISSETDAIRDVENRGDPVEIAQFIKEVVSTELQKYHAEALTILKGSSPQKLSLLIDGKCLMYALDPSLRSILLNLSLNCSSVVCCRVSPLQKAQVTRLVRIGANKITLSIGDGANDVGMIQAANIGVGISGLEGMQAVMASDFAIAQFRFLIDLLLVHGRWSYLRLCKVVSYFFYKNLTFTLTQFWYTFHTG...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G594480
TK1151 IDTkA03G594480
OH-1004 IDLXL04_011507
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)80.300
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 50.073
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G594480
位置Chr03:150975682-150978995 (+)
描述Similar to ALA3: Phospholipid-transporting ATPase 3
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g59820 参与磷脂的运输。
The Arabidopsis P4-ATPase ALA3 localizes to the golgi and requires a beta-subunit to function in lipid translocation and secretory vesicle formation.2008 · DOI: 10.1105/tpc.107.054767
IRREGULAR TRICHOME BRANCH 2 (ITB2) encodes a putative aminophospholipid translocase that regulates trichome branch elongation in Arabidopsis.2009 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2009.03954.x
Intracellular targeting signals and lipid specificity determinants of the ALA/ALIS P4-ATPase complex reside in the catalytic ALA alpha-subunit.2010 · DOI: 10.1091/mbc.e09-08-0656
Loss of the Arabidopsis thaliana P₄-ATPase ALA3 reduces adaptability to temperature stresses and impairs vegetative, pollen, and ovule development.2013 · DOI: 10.1371/journal.pone.0062577
An Arabidopsis Lipid Flippase Is Required for Timely Recruitment of Defenses to the Host-Pathogen Interface at the Plant Cell Surface.2017 · DOI: 10.1016/j.molp.2017.04.003
At3g25610 参与磷脂的运输。 暂无已核实直接文献
At1g68710 参与磷脂的运输。 暂无已核实直接文献
At1g13210 参与磷脂的运输。 暂无已核实直接文献
At1g17500 参与磷脂的运输。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_011507 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0002237 response to molecule of bacterial origin 生物过程
GO:0002238 response to molecule of fungal origin 生物过程
GO:0006893 Golgi to plasma membrane transport 生物过程
GO:0008104 intracellular protein localization 生物过程
GO:0009860 pollen tube growth 生物过程
GO:0010183 pollen tube guidance 生物过程
GO:0015031 protein transport 生物过程
GO:0016192 vesicle-mediated transport 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0045332 phospholipid translocation 生物过程
GO:0048194 Golgi vesicle budding 生物过程
GO:0048364 root development 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G17500
ath:AT1G59820
ath:AT1G68710
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.302
排名 1 · TkA03G594480 · TK1151
高尔基体0.267
排名 2 · TkA03G594480 · TK1151
细胞质0.244
排名 3 · TkA03G594480 · TK1151
内质网0.239
排名 4 · TkA03G594480 · TK1151
溶酶体／液泡0.200
排名 5 · TkA03G594480 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00702Hydrolase11-79 aa
PF08282Hydrolase_327-59 aa
PF00702Hydrolase155-192 aa
PF08282Hydrolase_3174-196 aa
PF16212PhoLip_ATPase_C206-452 aa
PF00689Cation_ATPase_C311-443 aa
PF12679ABC2_membrane_2316-407 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G594480PF00702Hydrolase11791.6e-0629.3
TkA03G594480PF08282Hydrolase_327590.002418.3
TkA03G594480PF00702Hydrolase1551921.6e-0629.3
TkA03G594480PF08282Hydrolase_31741960.002418.3
TkA03G594480PF16212PhoLip_ATPase_C2064524.7e-79266.4
TkA03G594480PF00689Cation_ATPase_C3114430.02315.2
TkA03G594480PF12679ABC2_membrane_23164071.09.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9XIE6拟南芥sp|Q9XIE6|ALA3_ARATH Phospholipid-transporting ATPase 370.000%Swiss-Prot高置信
Q9LI83拟南芥sp|Q9LI83|ALA10_ARATH Phospholipid-transporting ATPase 1046.000%Swiss-Prot中等置信
Q9SX33拟南芥sp|Q9SX33|ALA9_ARATH Putative phospholipid-transporting ATPase 945.900%Swiss-Prot中等置信
Q9SAF5拟南芥sp|Q9SAF5|ALA11_ARATH Probable phospholipid-transporting ATPase 1144.700%Swiss-Prot中等置信
Q9LNQ4拟南芥sp|Q9LNQ4|ALA4_ARATH Probable phospholipid-transporting ATPase 444.300%Swiss-Prot中等置信

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