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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G566480
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 143745988-143748741 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1914 bp · TkA03G566480|TK1151|cDNA

TACTATGTGTGCTTTAGTGTGTGTATTAATCTCTCACTTGATTCCACTGTTTCAAGCTTTATATAGAAGACTTAGCTCAACCTTACCTGCTCAAGGTGCGGGGGTCAATGAGAGAAAAGCAAAGAAAGTTCATCGAAAAAGCTAAAAGTTCTTAAAGCTTAAAAGAAAGAAAGCTGATTTTTCTCAGCAAACTGCTTTTAATTTCCTTCCATCTATCCTCATATCTCCTCTCTTCTTATTTCCCTCAAGAACTAAATAAA...

CDS

下载 CDS FASTA

1170 bp · TkA03G566480|TK1151|CDS

ATGTTAGACAACAGCGACCACCACCACCTCCACCACCATCTCACTGCTGCGCCTGCACCTGGTCCATCTTCTTCTTCTGATCCTTTTCTTTCCCCAGATAATGGTCTTTCCAACAAACGAAAAAGGCGTCCTGCTGGTACTCCAGATCCGGATGCGGAGGTGGTATCTTTATCGCCGAAGACATTGTTGGAGTCGGATAGATACGTATGTGAGATCTGTAATCAAGGGTTTCAACGGGATCAGAATTTGCAGATGCACCG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

389 aa · TkA03G566480|TK1151|PROTEIN

MLDNSDHHHLHHHLTAAPAPGPSSSSDPFLSPDNGLSNKRKRRPAGTPDPDAEVVSLSPKTLLESDRYVCEICNQGFQRDQNLQMHRRRHKVPWKLLKRETPEVKKKVFVCPEPSCLHHDPCHALGDLVGIKKHFRRKHSNDKQWVCDKCSKGYAVQSDYKAHLKTCGTRGHSCDCGRVFSRVESFIEHQDACTVRRVHPDLPAFQQACSSRTASSTSPSSDTNPSLQRLQQIPPSESTFFPDPRNKLELQLLPSSSLYE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G566480
TK1151 IDTkA03G566480
OH-1004 IDLXL04_011118
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G566480
位置Chr03:143745988-143748741 (+)
描述Similar to IDD14: Protein indeterminate-domain 14
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g68130 通过直接结合 QQS 启动子来调节淀粉代谢的转录因子。
Two splice variants of the IDD14 transcription factor competitively form nonfunctional heterodimers which may regulate starch metabolism.2011 · DOI: 10.1038/ncomms1303
The arabidopsis IDD14, IDD15, and IDD16 cooperatively regulate lateral organ morphogenesis and gravitropism by promoting auxin biosynthesis and transport.2013 · DOI: 10.1371/journal.pgen.1003759
At2g01940 参与花序茎重力向性反应的转录因子，可能通过调节感重细胞淀粉体中淀粉的积累。
A C2H2-type zinc finger protein, SGR5, is involved in early events of gravitropism in Arabidopsis inflorescence stems.2006 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2006.02807.x
Altered gravitropic response, amyloplast sedimentation and circumnutation in the Arabidopsis shoot gravitropism 5 mutant are associated with reduced starch levels.2008 · DOI: 10.1007/s11103-008-9301-0
The arabidopsis IDD14, IDD15, and IDD16 cooperatively regulate lateral organ morphogenesis and gravitropism by promoting auxin biosynthesis and transport.2013 · DOI: 10.1371/journal.pgen.1003759
Mutations in the SGR4, SGR5 and SGR6 loci of Arabidopsis thaliana alter the shoot gravitropism.1997 · DOI: 10.1093/oxfordjournals.pcp.a029201
At1g25250 调控侧生器官形态发生和向地性反应的转录因子。
The arabidopsis IDD14, IDD15, and IDD16 cooperatively regulate lateral organ morphogenesis and gravitropism by promoting auxin biosynthesis and transport.2013 · DOI: 10.1371/journal.pgen.1003759
At3g50700 转录因子，作为赤霉素 作用、稳态和信号传导的正调节因子。 暂无已核实直接文献
At5g66730 转录因子通过调节种子成熟过程中的光和激素信号来促进发芽过渡。
The Arabidopsis C2H2 zinc finger INDETERMINATE DOMAIN1/ENHYDROUS promotes the transition to germination by regulating light and hormonal signaling during seed maturation.2011 · DOI: 10.1105/tpc.111.085134
DELLAs function as coactivators of GAI-ASSOCIATED FACTOR1 in regulation of gibberellin homeostasis and signaling in Arabidopsis.2014 · DOI: 10.1105/tpc.114.125690

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_011118 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0009590 detection of gravity 生物过程
GO:0009630 gravitropism 生物过程
GO:0009740 gibberellic acid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0009937 regulation of gibberellic acid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0009959 negative gravitropism 生物过程
GO:0009965 leaf morphogenesis 生物过程
GO:0010029 regulation of seed germination 生物过程
GO:0010031 circumnutation 生物过程
GO:0010336 gibberellic acid homeostasis 生物过程
GO:0010431 seed maturation 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G25250
ath:AT1G68130
ath:AT2G01940
ath:AT3G50700
ath:AT5G66730
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.975
排名 1 · TkA03G566480 · TK1151
细胞质0.082
排名 2 · TkA03G566480 · TK1151
细胞膜0.024
排名 3 · TkA03G566480 · TK1151
内质网0.012
排名 4 · TkA03G566480 · TK1151
质体0.009
排名 5 · TkA03G566480 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF17003Actin_micro61-90 aa
PF23250zf_DPOE_264-80 aa
PF04810zf-Sec23_Sec2465-75 aa
PF24633DUF763065-81 aa
PF13465zf-H2C2_266-77 aa
PF18439zf_UBZ66-80 aa
PF22995C2CH-3rd_BIRD-IDD67-74 aa
PF13912zf-C2H2_667-91 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G566480PF17003Actin_micro61900.1512.0
TkA03G566480PF23250zf_DPOE_264800.003317.8
TkA03G566480PF04810zf-Sec23_Sec2465755.67.8
TkA03G566480PF24633DUF763065815.77.9
TkA03G566480PF13465zf-H2C2_266770.009317.0
TkA03G566480PF18439zf_UBZ66800.3911.1
TkA03G566480PF22995C2CH-3rd_BIRD-IDD67743.8e-1452.8
TkA03G566480PF13912zf-C2H2_667910.0004220.9
TkA03G566480PF00096zf-C2H268906.7e-0523.8
TkA03G566480PF17772zf-MYST68880.006916.8
TkA03G566480PF12874zf-met68860.01816.1
TkA03G566480PF13894zf-C2H2_468900.02316.1
TkA03G566480PF12171zf-C2H2_jaz68883.28.7
TkA03G566480PF13717Zn_ribbon_470770.2711.9
TkA03G566480PF23550zf_Tbcl_Rhp770772.78.3
TkA03G566480PF13465zf-H2C2_2821120.009317.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9C9X7拟南芥sp|Q9C9X7|IDD14_ARATH Protein indeterminate-domain 1458.900%Swiss-Prot高置信
F4IPE3拟南芥sp|F4IPE3|IDD15_ARATH Zinc finger protein SHOOT GRAVITROPISM 583.200%Swiss-Prot低置信
Q9FRH4拟南芥sp|Q9FRH4|IDD16_ARATH Protein indeterminate-domain 1687.000%Swiss-Prot低置信
Q9SCQ6拟南芥sp|Q9SCQ6|IDD2_ARATH Zinc finger protein GAI-ASSOCIATED FACTOR 166.500%Swiss-Prot低置信
Q9LVQ7拟南芥sp|Q9LVQ7|IDD1_ARATH Zinc finger protein ENHYDROUS65.800%Swiss-Prot低置信

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