TkA03G491200 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA03G491200

当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 123118404-123119799 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1138 bp · TkA03G491200|TK1151|cDNA

AAAGAATACCACTCATTTAGGTTGCTTTGATCCACCACCATAAAACCCAAGGACTCCATCCCGTTTCAGTACTCTTCTTTCTCTGACAGCAACATACCAGTGTGTGTTTTGTGTGTTAGAGAAAGATAGAGAGGACATGGAGTTGAAAGAAGAAATGCATAACCTCATTAAGTGGCTTGTTTCCCCATCGATACAACTCAGTACACCAAAGGGTTTTCGAAGCCGGACAAACCTAAGAAAACGTCTTTGTTGACTTATGG...

CDS

下载 CDS FASTA

603 bp · TkA03G491200|TK1151|CDS

ATGATGGCTTGGTGCATCTTCGGGATAATTCTTTACTTTTCGCTCGAGCTCATCGTTGCCTTGAGCTCAACCATAGTTGGGTTGTTTCTTAATGTTGAGCTTGACCAACAATTCGACGAGCCTTATCTGGCAACATCCCTGCAGGACTTCTGGGGTCGGAGGTGGAATGTGATGGTCAACCGTATCCTTCACCCGAGCGTTTACGAACCGACACGTATATTATCGGTCAAGGTCGTTGGTCGGTTGTGGGCCCCGGTGCC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

200 aa · TkA03G491200|TK1151|PROTEIN

MMAWCIFGIILYFSLELIVALSSTIVGLFLNVELDQQFDEPYLATSLQDFWGRRWNVMVNRILHPSVYEPTRILSVKVVGRLWAPVPAILATFLVSGLMHELIFFYFTRAWPTWEVMYFFGLHGVCLVLEVVIKKATRYKWSLPNNLSRLLVVVFVLATSYWLFLPELLRCKLVERAIEEYAVVSDLAMDVVRSPPIFFN

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA03G491200`
TK1151 ID	TkA03G491200
OH-1004 ID	LXL04_010027
关系 / 置信度	序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)	100.000
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 57.143 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA03G491200

位置 Chr03:123118404-123119799 (-)

描述 Similar to ASAT1: Acyl-CoA--sterol O-acyltransferase 1

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At3g51970`	参与环木菠萝烯醇的酯化反应。	Biosynthesis of phytosterol esters: identification of a sterol o-acyltransferase in Arabidopsis.2007 · DOI: 10.1104/pp.107.106278 Involvement of the phospholipid sterol acyltransferase1 in plant sterol homeostasis and leaf senescence.2010 · DOI: 10.1104/pp.109.145672
`At5g55340`	催化长链直链酯（蜡类）合成的最后一步。	暂无已核实直接文献
`At1g34520`	催化长链直链酯（蜡类）合成的最后一步。	暂无已核实直接文献
`At5g55330`	催化长链直链酯（蜡类）合成的最后一步。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_010027 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006629 lipid metabolic process 生物过程

GO:0016127 sterol catabolic process 生物过程

GO:0005739 mitochondrion 细胞组分

GO:0009507 chloroplast 细胞组分

GO:0016020 membrane 细胞组分

GO:0008374 O-acyltransferase activity 分子功能

GO:0047196 long-chain-alcohol O-fatty-acyltransferase activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT3G51970

ath:AT5G55340

ath:AT5G55350

ath:AT5G55360

ath:AT5G55370

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

内质网0.816

排名 1 · TkA03G491200 · TK1151

细胞膜0.055

排名 2 · TkA03G491200 · TK1151

细胞质0.053

排名 3 · TkA03G491200 · TK1151

高尔基体0.051

排名 4 · TkA03G491200 · TK1151

质体0.051

排名 5 · TkA03G491200 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF03062MBOAT3-110 aa

PF04138GtrA_DPMS_TM20-20 aa

PF13813MBOAT_236-120 aa

PF04138GtrA_DPMS_TM79-163 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA03G491200	`PF03062`	MBOAT	3	110	6.8e-05	23.0
TkA03G491200	`PF04138`	GtrA_DPMS_TM	20	20	0.0011	19.8
TkA03G491200	`PF13813`	MBOAT_2	36	120	2.2e-18	67.0
TkA03G491200	`PF04138`	GtrA_DPMS_TM	79	163	0.0011	19.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9SV07`	拟南芥	sp\|Q9SV07\|ASAT1_ARATH Acyl-CoA--sterol O-acyltransferase 1	47.900%	Swiss-Prot	中等置信
`Q9FJ76`	拟南芥	sp\|Q9FJ76\|WAXS5_ARATH Probable long-chain-alcohol O-fatty-acyltransferase 5	49.400%	Swiss-Prot	中等置信
`Q9LNL1`	拟南芥	sp\|Q9LNL1\|WAXS8_ARATH Probable long-chain-alcohol O-fatty-acyltransferase 8	43.400%	Swiss-Prot	中等置信
`Q9FJ77`	拟南芥	sp\|Q9FJ77\|WAXS6_ARATH Probable long-chain-alcohol O-fatty-acyltransferase 6	46.900%	Swiss-Prot	中等置信

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