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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G362820
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 89455486-89463211 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

4841 bp · TkA03G362820|TK1151|cDNA

GGCGGCCTGTAGTTGCGCTGTTCTTTCCATTTCCTGTAGCATAGCCGCCTCAAATCCTTTAAAAGAAAATCGATTTCCCCACAAAACATATCTCTATACAAATACAGCTGTATCGTCTTTTATCTCCCATCTCCCATATAAAGATCTGTATCTTTCACACAAAAGCATCTACCGGGATACACTTTCTCTCTCTTCCTCACATTCAGAACAGATCACTGTTCTTCAACTTAAATTTTTTTTACTGTTCTTCAACTTTCAGC...

CDS

下载 CDS FASTA

4305 bp · TkA03G362820|TK1151|CDS

ATGGATGGGAGTGACATATACAAAGCGGCAAATAGTATAAGGTTAGGGAGTTTAAGAGCAGGGAGTACACGAGCTCCAAGTTTAAGATCTGGAAGTACTTCAGTATGGAGAAATTCCGGCATGGATGTTTTCTCAAAATCTTCTCGCGAAGACGACGATGAAGAAGCTCTTAAATGGGCCTCCCTTGAAAAGCTACCAACTTTCGATCGTTTAAAGAAAGGTTTACTTTTCGGATCAACCGGACCATCTAACGAAGTTGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1434 aa · TkA03G362820|TK1151|PROTEIN

MDGSDIYKAANSIRLGSLRAGSTRAPSLRSGSTSVWRNSGMDVFSKSSREDDDEEALKWASLEKLPTFDRLKKGLLFGSTGPSNEVDVDNLGVEDRKHLLDRLVKTADEDNEKFLLKLRARLDRVGIDLPTIEVRYDHVTVEADINTGSRALPSFINFHIDFFEGLLTRLNLLPNSKKHITILNDVSGCIKPSRMTLLLGPPSSGKTTLLLALAGALDKGLKSSGKVTYNGHELHEFVPERTSAYISQNDVHIGEMTVRE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G362820
TK1151 IDTkA03G362820
OH-1004 IDLXL04_008530
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)99.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G362820
位置Chr03:89455486-89463211 (+)
描述Similar to PDR1: Pleiotropic drug resistance protein 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g15520 可能参与脱落酸的跨膜输入及相关信号转导。
PDR-type ABC transporter mediates cellular uptake of the phytohormone abscisic acid.2010 · DOI: 10.1073/pnas.0909222107
ABA transport factors found in Arabidopsis ABC transporters.2010 · DOI: 10.4161/psb.5.9.12566
Arabidopsis Lectin Receptor Kinases LecRK-IX.1 and LecRK-IX.2 Are Functional Analogs in Regulating Phytophthora Resistance and Plant Cell Death.2015 · DOI: 10.1094/mpmi-02-15-0025-r
Abscisic acid transporters cooperate to control seed germination.2015 · DOI: 10.1038/ncomms9113

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_008530 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0002229 defense response to oomycetes 生物过程
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0009408 response to heat 生物过程
GO:0009409 response to cold 生物过程
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009723 response to ethylene 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009751 response to salicylic acid 生物过程
GO:0009753 response to jasmonic acid 生物过程
GO:0009914 hormone transport 生物过程
GO:0010193 response to ozone 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G15520
nta:107799533
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.700
排名 1 · TkA03G362820 · TK1151
内质网0.158
排名 2 · TkA03G362820 · TK1151
细胞质0.105
排名 3 · TkA03G362820 · TK1151
溶酶体／液泡0.088
排名 4 · TkA03G362820 · TK1151
高尔基体0.065
排名 5 · TkA03G362820 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13304AAA_2154-125 aa
PF13207AAA_1787-134 aa
PF14510ABC_trans_N107-158 aa
PF02367TsaE179-218 aa
PF03193RsgA_GTPase181-218 aa
PF00005ABC_tran183-365 aa
PF09818ABC_ATPase184-220 aa
PF13086AAA_11185-217 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G362820PF13304AAA_21541254.5e-1040.7
TkA03G362820PF13207AAA_17871341.310.0
TkA03G362820PF14510ABC_trans_N1071585.5e-0627.4
TkA03G362820PF02367TsaE1792180.04614.4
TkA03G362820PF03193RsgA_GTPase1812180.02715.0
TkA03G362820PF00005ABC_tran1833656.1e-42144.2
TkA03G362820PF09818ABC_ATPase1842202.27.9
TkA03G362820PF13086AAA_111852170.4511.0
TkA03G362820PF13481AAA_251862220.0001422.3
TkA03G362820PF20720nSTAND31892150.02215.1
TkA03G362820PF13555AAA_291902161.9e-0525.0
TkA03G362820PF03215Rad171912170.07213.7
TkA03G362820PF13604AAA_301922190.003417.9
TkA03G362820PF13476AAA_231932370.0001223.5
TkA03G362820PF25199nSTAND_NTPase51932180.610.6
TkA03G362820PF13191AAA_161942252.4e-0525.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9M9E1拟南芥sp|Q9M9E1|AB40G_ARATH ABC transporter G family member 4068.500%Swiss-Prot高置信

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