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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G220440
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 55129153-55131577 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

504 bp · TkA03G220440|TK1151|cDNA

ATGGTGGACGACGAGAAGCTGGTCTTTGAGACCTCGCGTGGAGTGGAGCCCATCATGAGCTTTGACCAGATGGGTATCAAAGACGATCTGCTCCCTGGGATTTACCAACACAGATTCGAGAAACCCTCGGCAATTCAACAGAGAGCTGTTTGGCCTATCGTTGAAGGCCGTGATGTCATTGCTCAGGCTCAATCTGACTTTTTTTTCATCCAGATTCCATGGGAACCACCAAAGGATGGATTAAAAGGTTTCTTTGCATC...

CDS

下载 CDS FASTA

504 bp · TkA03G220440|TK1151|CDS

ATGGTGGACGACGAGAAGCTGGTCTTTGAGACCTCGCGTGGAGTGGAGCCCATCATGAGCTTTGACCAGATGGGTATCAAAGACGATCTGCTCCCTGGGATTTACCAACACAGATTCGAGAAACCCTCGGCAATTCAACAGAGAGCTGTTTGGCCTATCGTTGAAGGCCGTGATGTCATTGCTCAGGCTCAATCTGACTTTTTTTTCATCCAGATTCCATGGGAACCACCAAAGGATGGATTAAAAGGTTTCTTTGCATC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

167 aa · TkA03G220440|TK1151|PROTEIN

MVDDEKLVFETSRGVEPIMSFDQMGIKDDLLPGIYQHRFEKPSAIQQRAVWPIVEGRDVIAQAQSDFFFIQIPWEPPKDGLKGFFASIEEMFFKLWYGMVEFITGRSCSKKCTGLFDFHFHIRYLCMKWLLMFGSVFAIFPTVIVLLWLLHENGVFDPLYEWWEDHF

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G220440
TK1151 IDTkA03G220440
OH-1004 IDLXL04_026479
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)97.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 57.485 / OH-1004 13.714
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G220440
位置Chr03:55129153-55131577 (+)
描述Similar to HAP2: Protein HAPLESS 2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g11720 男性生育所需。
Arabidopsis HAP2 (GCS1) is a sperm-specific gene required for pollen tube guidance and fertilization.2006 · DOI: 10.1242/dev.02683
HAP2(GCS1)-dependent gamete fusion requires a positively charged carboxy-terminal domain.2010 · DOI: 10.1371/journal.pgen.1000882
The functional domain of GCS1-based gamete fusion resides in the amino terminus in plant and parasite species.2010 · DOI: 10.1371/journal.pone.0015957
Egg cell-secreted EC1 triggers sperm cell activation during double fertilization.2012 · DOI: 10.1126/science.1223944
Arabidopsis HAP2/GCS1 is a gamete fusion protein homologous to somatic and viral fusogens.2017 · DOI: 10.1083/jcb.201610093
At3g19760 ATP依赖的RNA解旋酶。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os01g0639100 ATP依赖的RNA解旋酶。 暂无已核实直接文献
Os03g0566800 ATP依赖的RNA解旋酶。
Two highly similar DEAD box proteins, OsRH2 and OsRH34, homologous to eukaryotic initiation factor 4AIII, play roles of the exon junction complex in regulating growth and development in rice.2016 · DOI: 10.1186/s12870-016-0769-5
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_026479 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0007338 single fertilization 生物过程
GO:0007342 fusion of sperm to egg plasma membrane involved in single fertilization 生物过程
GO:0009566 fertilization 生物过程
GO:0009567 double fertilization forming a zygote and endosperm 生物过程
GO:0010183 pollen tube guidance 生物过程
GO:0045026 plasma membrane fusion 生物过程
GO:0048235 pollen sperm cell differentiation 生物过程
GO:0051205 protein insertion into membrane 生物过程
GO:0061936 fusion of sperm to egg plasma membrane involved in double fertilization forming a zygote and endosperm 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分
GO:0005789 endoplasmic reticulum membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G11720
dosa:Os09g0525700
nve:5507857
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

内质网0.249
排名 1 · TkA03G220440 · TK1151
细胞质0.164
排名 2 · TkA03G220440 · TK1151
高尔基体0.163
排名 3 · TkA03G220440 · TK1151
细胞外0.157
排名 4 · TkA03G220440 · TK1151
线粒体0.127
排名 5 · TkA03G220440 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

没有找到该查询的结果。

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
F4JP36拟南芥sp|F4JP36|HAP2_ARATH Protein HAPLESS 251.600%Swiss-Prot中等置信
Q94A52拟南芥sp|Q94A52|RH2_ARATH Eukaryotic initiation factor 4A-III homolog71.900%Swiss-Prot低置信
Q5VNM3水稻sp|Q5VNM3|IF43A_ORYSJ Eukaryotic initiation factor 4A-III homolog A78.100%Swiss-Prot低置信
Q10I26水稻sp|Q10I26|IF43B_ORYSJ Eukaryotic initiation factor 4A-III homolog B76.600%Swiss-Prot低置信

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