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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G186500
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 46974263-46975846 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1014 bp · TkA03G186500|TK1151|cDNA

ATGCTTAGTCATCATGGGCGTTTCTGGTTTCTTGTACAGTTCGGGATCCGTTGTGCGGTTTGCGTGATTTCCCCAAAATGCCCTTTTGGATACGATTCTCAGACTTTCAAGATCGGCCCTTTTAGTTGCATAATATGCCAAGCCCTCCTCTTCGAGTGTAACAGATGTGTCCCTTGTACTCACGTCTTTTGCAAAGCATGTATATCAAGATTCAGTGATTGTCCACTATGTGGTGCTGACATTGAGAAGATAGAAGCTGA...

CDS

下载 CDS FASTA

1014 bp · TkA03G186500|TK1151|CDS

ATGCTTAGTCATCATGGGCGTTTCTGGTTTCTTGTACAGTTCGGGATCCGTTGTGCGGTTTGCGTGATTTCCCCAAAATGCCCTTTTGGATACGATTCTCAGACTTTCAAGATCGGCCCTTTTAGTTGCATAATATGCCAAGCCCTCCTCTTCGAGTGTAACAGATGTGTCCCTTGTACTCACGTCTTTTGCAAAGCATGTATATCAAGATTCAGTGATTGTCCACTATGTGGTGCTGACATTGAGAAGATAGAAGCTGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

337 aa · TkA03G186500|TK1151|PROTEIN

MLSHHGRFWFLVQFGIRCAVCVISPKCPFGYDSQTFKIGPFSCIICQALLFECNRCVPCTHVFCKACISRFSDCPLCGADIEKIEADTNLQSVVDRFIDGHARIKRSPVDTDEKEVIGEKKTVIYEDVSLERGAFLVQQAMRAFRANNVESAKSRLSLCAQDIREQLEIAGNTSELCSQLGAVLGMLGDCCRAMGDGTSAVGYFDESVTFLSKVETDDLEVTHTLSVSLNKIGDLKYYEGDLKAARDHYFRALDVRRNAI...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G186500
TK1151 IDTkA03G186500
OH-1004 IDLXL04_007521
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G186500
位置Chr03:46974263-46975846 (+)
描述Similar to NCA1: Protein NCA1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g54360 具有防聚集型分子伴侣（holdase）活性，可能帮助过氧化氢酶形成具有功能的结构。
Catalase and NO CATALASE ACTIVITY1 promote autophagy-dependent cell death in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1105/tpc.113.117192
A chaperone function of NO CATALASE ACTIVITY1 is required to maintain catalase activity and for multiple stress responses in Arabidopsis.2015 · DOI: 10.1105/tpc.114.135095

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_007521 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000209 protein polyubiquitination 生物过程
GO:0000278 mitotic cell cycle 生物过程
GO:0006511 ubiquitin-dependent protein catabolic process 生物过程
GO:0016567 protein ubiquitination 生物过程
GO:0031398 positive regulation of protein ubiquitination 生物过程
GO:0031648 protein destabilization 生物过程
GO:0032436 positive regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process 生物过程
GO:0043069 negative regulation of programmed cell death 生物过程
GO:0044779 meiotic spindle checkpoint signaling 生物过程
GO:0044818 mitotic G2/M transition checkpoint 生物过程
GO:0051301 cell division 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G54360
dre:564271
mmu:231600
xla:734287
xtr:395009
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.620
排名 1 · TkA03G186500 · TK1151
细胞核0.340
排名 2 · TkA03G186500 · TK1151
线粒体0.096
排名 3 · TkA03G186500 · TK1151
高尔基体0.078
排名 4 · TkA03G186500 · TK1151
过氧化物酶体0.076
排名 5 · TkA03G186500 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13920zf-C3HC4_318-25 aa
PF13923zf-C3HC4_218-22 aa
PF13639zf-RING_218-28 aa
PF13920zf-C3HC4_342-83 aa
PF13639zf-RING_242-77 aa
PF13923zf-C3HC4_243-77 aa
PF13445zf-RING_UBOX43-68 aa
PF14447Prok-RING_456-83 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G186500PF13920zf-C3HC4_318250.000221.8
TkA03G186500PF13923zf-C3HC4_218220.005517.2
TkA03G186500PF13639zf-RING_218282.29.3
TkA03G186500PF13920zf-C3HC4_342830.000221.8
TkA03G186500PF13639zf-RING_242772.29.3
TkA03G186500PF13923zf-C3HC4_243770.005517.2
TkA03G186500PF13445zf-RING_UBOX43681.010.2
TkA03G186500PF14447Prok-RING_456831.39.7
TkA03G186500PF07719TPR_21371520.01815.8
TkA03G186500PF04652Vta11371750.1712.5
TkA03G186500PF29407CFAP70_TPR_C1802140.1112.7
TkA03G186500PF13424TPR_121812093.4e-0627.9
TkA03G186500PF17874TPR_MalT1813070.07113.1
TkA03G186500PF13424TPR_121822573.4e-0627.9
TkA03G186500PF07719TPR_21832080.01815.8
TkA03G186500PF00515TPR_11842070.001618.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9M2V1拟南芥sp|Q9M2V1|NCA1_ARATH Protein NCA170.300%Swiss-Prot高置信

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