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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G151330
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 38427211-38429624 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1116 bp · TkA03G151330|TK1151|cDNA

ATTTTACTTTCTCTCTCTATCTCTATCTCTCTCACTCTCTCTCTCTCTCTCACACTTCCCACAAATGTTATCTGATGGTGGTGGTTGTGGTGGTGATGATGTTAACAAGAATCTAAACACAAGTCACCATAATCTTGGTAGGGTTTCAACAAGATCTACAACACTATCATCATCTTCTTCTTCCAACACCTCTTCCAACCACTCGCCATTTTCGGTTTCTTTAACTGTTAACCAGATCAAGAGCACTCCAACCGCCACCA...

CDS

下载 CDS FASTA

807 bp · TkA03G151330|TK1151|CDS

ATGTTATCTGATGGTGGTGGTTGTGGTGGTGATGATGTTAACAAGAATCTAAACACAAGTCACCATAATCTTGGTAGGGTTTCAACAAGATCTACAACACTATCATCATCTTCTTCTTCCAACACCTCTTCCAACCACTCGCCATTTTCGGTTTCTTTAACTGTTAACCAGATCAAGAGCACTCCAACCGCCACCAGAACAATGGAGGAGGTTTGGAAAGATATCAACCTTTGCTCCACCACCAACCACCCTGCTGCCGG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

268 aa · TkA03G151330|TK1151|PROTEIN

MLSDGGGCGGDDVNKNLNTSHHNLGRVSTRSTTLSSSSSSNTSSNHSPFSVSLTVNQIKSTPTATRTMEEVWKDINLCSTTNHPAAGTKGYRGFILQDFLAKPFSNNETPTSLSSPGYGSPSPPPPAPPTSQPSMLINLNSGPDQLNFLADDPTRNVSPLDGPFDHVLGSSNSSSGLLGQSIGGMRMLPATDRVGGGERRHKRMIKNRESAARSRARKQAYMNELENEVERLKEENAKLKRQQQELQVAPAAQMTKKGGL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G151330
TK1151 IDTkA03G151330
OH-1004 IDLXL04_007308
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 74.238
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G151330
位置Chr03:38427211-38429624 (+)
描述Similar to FD: Protein FD
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g35900 由FT促进开花所需的转录因子。 暂无已核实直接文献
At2g17770 由FT促进开花所需的转录因子。 暂无已核实直接文献
At3g56850 结合到胚胎特异性元件和 Dc3 基因启动子的 ABA 响应元件 (ABRE)。 暂无已核实直接文献
At3g44460 可能参与种子发育过程中脱落酸调控的基因表达。 暂无已核实直接文献
At1g45249 参与 ABA 和应激反应，并作为葡萄糖信号转导的积极成分。
Arabidopsis basic leucine zipper transcription factors involved in an abscisic acid-dependent signal transduction pathway under drought and high-salinity conditions.2000 · DOI: 10.1073/pnas.190309197
AREB1 is a transcription activator of novel ABRE-dependent ABA signaling that enhances drought stress tolerance in Arabidopsis.2005 · DOI: 10.1105/tpc.105.035659
Transcriptional regulation of ABI3- and ABA-responsive genes including RD29B and RD29A in seeds, germinating embryos, and seedlings of Arabidopsis.2006 · DOI: 10.1007/s11103-005-2418-5

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_007308 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009648 photoperiodism 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009909 regulation of flower development 生物过程
GO:0009911 positive regulation of flower development 生物过程
GO:0010255 glucose mediated signaling pathway 生物过程
GO:0045893 positive regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:2000028 regulation of photoperiodism, flowering 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G45249
ath:AT2G17770
ath:AT3G56850
ath:AT4G35900
dosa:Os02g0766700
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.972
排名 1 · TkA03G151330 · TK1151
细胞质0.096
排名 2 · TkA03G151330 · TK1151
细胞膜0.027
排名 3 · TkA03G151330 · TK1151
内质网0.016
排名 4 · TkA03G151330 · TK1151
质体0.011
排名 5 · TkA03G151330 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08286Spc2414-40 aa
PF04637Herpes_pp8526-64 aa
PF24590DUF761531-73 aa
PF25966Myo5a33-61 aa
PF28362NcaA_C35-44 aa
PF14197Cep57_CLD_2192-240 aa
PF07716bZIP_2198-247 aa
PF28121VPA1267198-247 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G151330PF08286Spc2414400.4611.5
TkA03G151330PF04637Herpes_pp8526642.76.9
TkA03G151330PF24590DUF761531730.4111.9
TkA03G151330PF25966Myo5a33610.3211.8
TkA03G151330PF28362NcaA_C35449.36.9
TkA03G151330PF14197Cep57_CLD_21922400.007417.1
TkA03G151330PF07716bZIP_21982472.1e-1144.4
TkA03G151330PF28121VPA12671982470.4611.4
TkA03G151330PF00170bZIP_11992472.6e-1350.6
TkA03G151330PF03131bZIP_Maf1992570.0117.0
TkA03G151330PF10224DUF22051992470.5811.0
TkA03G151330PF13863DUF42001992470.9910.5
TkA03G151330PF11559ADIP2002560.1512.8
TkA03G151330PF06785UPF02422012470.212.4
TkA03G151330PF25966Myo5a2012580.3211.8
TkA03G151330PF24590DUF76152092410.4111.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q84JK2拟南芥sp|Q84JK2|FD_ARATH Protein FD42.200%Swiss-Prot中等置信
Q7PCC6拟南芥sp|Q7PCC6|FDP_ARATH bZIP transcription factor 2738.000%Swiss-Prot中等置信
Q9LES3拟南芥sp|Q9LES3|AI5L2_ARATH ABSCISIC ACID-INSENSITIVE 5-like protein 235.100%Swiss-Prot中等置信
Q8RYD6拟南芥sp|Q8RYD6|AI5L1_ARATH ABSCISIC ACID-INSENSITIVE 5-like protein 134.000%Swiss-Prot中等置信
Q9M7Q4拟南芥sp|Q9M7Q4|AI5L5_ARATH ABSCISIC ACID-INSENSITIVE 5-like protein 544.000%Swiss-Prot低置信

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