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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G080100
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 20434602-20437223 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1657 bp · TkA03G080100|TK1151|cDNA

GAAACAAACAAACACAGTCGTCTTTCTTATTTTCAAAATTGACCCCACCCACTTGCTTCCACACTTAGTTTTTCGGTTTTTCCAAACCTTTCTAGAACACCCCCTCCCCCCTCCCTCATCCGTGTTCTATAAAGCATCTTTCCAGTGTTTTCGTGCACGAATCCTTCAAATTCTTATAAATCAAACACGTTATTCGTTATCATCAGCATAGTCATCATTGTAAATTTGTAATCTGTTCGTGTTCTTGATTTCGCATAGTT...

CDS

下载 CDS FASTA

879 bp · TkA03G080100|TK1151|CDS

ATGACGCATCGATCCGTTCCGGCGCCGTTTCTGACGAAGACGTATCTGTTGGTTGATGATCCGGCGACGAATGATGTTATTTCGTGGAACGAAACCGGCTCAACTTTCATAGTCTGGAAAACTGCTGATTTCGCTAGGGATTTGCTTCCAAATTCCTTCAAACACAATAATTTCTCCAGCTTCGTTCGTCAGCTTAATACTTATGGATTTCGTAAAACTGTTCCAGACAAATGGGAGTTCGCTAATGAGAACTTCAAGCG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

292 aa · TkA03G080100|TK1151|PROTEIN

MTHRSVPAPFLTKTYLLVDDPATNDVISWNETGSTFIVWKTADFARDLLPNSFKHNNFSSFVRQLNTYGFRKTVPDKWEFANENFKRGQRELLIEIRRRKTAPSSQAKPAGDGTPAPSPSSSGDDLGSSSTSSPDSKNPGSVDTPTVEKLENLSDENEKLKKEKQILTSELAQVKKQCDDLVAFLTQNVKVAPDYINRIMNINAVVGETATSTATVKVMDRDDSNDEERGECFKLFGVVLKEEKKKRVRDEVNISPGGKM...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G080100
TK1151 IDTkA03G080100
OH-1004 IDLXL04_006847
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 96.575 / OH-1004 98.947
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G080100
位置Chr03:20434602-20437223 (+)
描述Similar to HSF24: Heat shock factor protein HSF24
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g36990 转录调控因子，特异性结合 DNA 序列 5'-AGAAnnTTCT-3'，该序列称为热休克启动子元件（HSE）。 暂无已核实直接文献
At1g46264 转录调控因子，特异性结合 DNA 序列 5'-AGAAnnTTCT-3'，该序列称为热休克启动子元件（HSE）。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os08g0546800 转录调控因子，特异性结合热休克启动子元素（HSE）的DNA。 暂无已核实直接文献
Os09g0526600 转录调控因子，特异性结合热休克启动子元素（HSE）的DNA。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_006847 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006357 regulation of transcription by RNA polymerase II 生物过程
GO:0008356 asymmetric cell division 生物过程
GO:0009408 response to heat 生物过程
GO:0045892 negative regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0080136 priming of cellular response to stress 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0000976 transcription cis-regulatory region binding 分子功能
GO:0000978 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding 分子功能
GO:0003700 DNA-binding transcription factor activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G46264
ath:AT4G36990
ath:AT5G62020
dosa:Os09g0456800
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.940
排名 1 · TkA03G080100 · TK1151
细胞质0.165
排名 2 · TkA03G080100 · TK1151
线粒体0.020
排名 3 · TkA03G080100 · TK1151
细胞膜0.018
排名 4 · TkA03G080100 · TK1151
内质网0.009
排名 5 · TkA03G080100 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00447HSF_DNA-bind10-99 aa
PF04778LMP54-67 aa
PF16331TolA_bind_tri80-108 aa
PF02183HALZ82-97 aa
PF27978ZNF318_helical86-100 aa
PF29357B0252_5_C145-224 aa
PF06005ZapB146-181 aa
PF21924XRCC4_CC147-182 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G080100PF00447HSF_DNA-bind10993e-29102.2
TkA03G080100PF04778LMP54670.01316.2
TkA03G080100PF16331TolA_bind_tri801080.1712.7
TkA03G080100PF02183HALZ82970.5611.1
TkA03G080100PF27978ZNF318_helical861000.009617.0
TkA03G080100PF29357B0252_5_C1452240.1513.1
TkA03G080100PF06005ZapB1461810.02615.7
TkA03G080100PF21924XRCC4_CC1471820.03215.1
TkA03G080100PF16331TolA_bind_tri1471810.1712.7
TkA03G080100PF27978ZNF318_helical1481820.009617.0
TkA03G080100PF04849HAP1_N1481980.01315.5
TkA03G080100PF04778LMP1482100.01316.2
TkA03G080100PF00170bZIP_11491815.18.0
TkA03G080100PF02183HALZ1511760.5611.1
TkA03G080100PF17253DUF53201521800.2713.1
TkA03G080100PF07412Geminin1542030.06113.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q96320拟南芥sp|Q96320|HSFB1_ARATH Heat stress transcription factor B-151.200%Swiss-Prot高置信
Q9C635拟南芥sp|Q9C635|HSFB4_ARATH Heat stress transcription factor B-449.100%Swiss-Prot中等置信
Q6Z9C8水稻sp|Q6Z9C8|HFB2B_ORYSJ Heat stress transcription factor B-2b49.300%Swiss-Prot中等置信
Q652B0水稻sp|Q652B0|HFB2C_ORYSJ Heat stress transcription factor B-2c75.300%Swiss-Prot低置信

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