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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G555810
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 143457205-143460569 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2067 bp · TkA02G555810|TK1151|cDNA

GGAAGGGGTAGATGTACAAACTCTCGAAAAAAATTCACAAATCTACGACACTTTCTTGTGCTTCTCTCTGTGTTTTCAAGGTCTCAACGGCTACAATGGCTGCAACGAGATCACTACTTCTTTCTTTATCTATTATACTTCTACTTTGCTTCAACTCTTCTTGCAAAGATACCCACGATCTTGATGAAGAAGATCTTAGTTTCCTAGAGGAAGACGAGCACGCCGCCGATTCATCCCATCACGGTTACGAGGACCATGAT...

CDS

下载 CDS FASTA

1797 bp · TkA02G555810|TK1151|CDS

ATGTACAAACTCTCGAAAAAAATTCACAAATCTACGACACTTTCTTGTGCTTCTCTCTGTGTTTTCAAGGTCTCAACGGCTACAATGGCTGCAACGAGATCACTACTTCTTTCTTTATCTATTATACTTCTACTTTGCTTCAACTCTTCTTGCAAAGATACCCACGATCTTGATGAAGAAGATCTTAGTTTCCTAGAGGAAGACGAGCACGCCGCCGATTCATCCCATCACGGTTACGAGGACCATGATTTCGAGAACTA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

598 aa · TkA02G555810|TK1151|PROTEIN

MYKLSKKIHKSTTLSCASLCVFKVSTATMAATRSLLLSLSIILLLCFNSSCKDTHDLDEEDLSFLEEDEHAADSSHHGYEDHDFENYDDLDDFGDGEGEYPDSESAPEAEVDESDVVVVNGSNFSDFLEKNRYAMVEFYVPWCGHCQALKPEYAAAATELKTDQVVLAKIDAGEENELAQLYNVEGYPTVFFFIDGVHKPYNGARNKDSIVTWVKKKIGPGLQNLTTTDEAETILTSESPVVVAFVENLAGQDSEELAAA...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G555810
TK1151 IDTkA02G555810
OH-1004 IDLXL04_012550
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)99.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G555810
位置Chr02:143457205-143460569 (-)
描述Similar to PDIL1-4: Protein disulfide isomerase-like 1-4
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g60640 作为蛋白质折叠催化剂，与新生多肽相互作用，催化二硫键的形成、异构化以及还原或氧化。
Protein disulfide isomerase-2 of Arabidopsis mediates protein folding and localizes to both the secretory pathway and nucleus, where it interacts with maternal effect embryo arrest factor.2011 · DOI: 10.1007/s10059-011-0150-3
At3g54960 作为蛋白质折叠催化剂，与新生多肽相互作用，催化二硫键的形成、异构化以及还原或氧化。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os02g0100100 作为蛋白质折叠催化剂，与新生多肽相互作用，催化二硫键的形成、异构化以及还原或氧化。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_012550 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006457 protein folding 生物过程
GO:0034976 response to endoplasmic reticulum stress 生物过程
GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分
GO:0005788 endoplasmic reticulum lumen 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009536 plastid 细胞组分
GO:0009897 external side of plasma membrane 细胞组分
GO:0099503 secretory vesicle 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G54960
ath:AT5G60640
dosa:Os02g0100100
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

内质网0.813
排名 1 · TkA02G555810 · TK1151
细胞质0.155
排名 2 · TkA02G555810 · TK1151
高尔基体0.097
排名 3 · TkA02G555810 · TK1151
细胞核0.087
排名 4 · TkA02G555810 · TK1151
细胞外0.073
排名 5 · TkA02G555810 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF04756OST3_OST612-49 aa
PF00578AhpC-TSA105-185 aa
PF04756OST3_OST6113-196 aa
PF26959Thioredoxin-like_N114-215 aa
PF00085Thioredoxin116-216 aa
PF18059Csd3_N120-132 aa
PF20207PedC-like122-197 aa
PF13098Thioredoxin_2126-214 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G555810PF04756OST3_OST612492e-0628.2
TkA02G555810PF00578AhpC-TSA1051855.2e-0730.4
TkA02G555810PF04756OST3_OST61131962e-0628.2
TkA02G555810PF26959Thioredoxin-like_N1142150.0006720.3
TkA02G555810PF00085Thioredoxin1162161.5e-51173.4
TkA02G555810PF18059Csd3_N1201321.89.7
TkA02G555810PF20207PedC-like1221970.01416.1
TkA02G555810PF13098Thioredoxin_21262148e-0833.3
TkA02G555810PF13899Thioredoxin_71301934.9e-1143.3
TkA02G555810PF26981Thioredoxin-like_PDI1301490.01815.7
TkA02G555810PF13905Thioredoxin_81321742.7e-0628.4
TkA02G555810PF13848Thioredoxin_61492468.5e-29101.4
TkA02G555810PF07449HyaE1621970.03215.0
TkA02G555810PF13905Thioredoxin_81721912.7e-0628.4
TkA02G555810PF07449HyaE2122660.03215.0
TkA02G555810PF13848Thioredoxin_62574288.5e-29101.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FF55拟南芥sp|Q9FF55|PDI14_ARATH Protein disulfide isomerase-like 1-461.200%Swiss-Prot高置信
Q8VX13拟南芥sp|Q8VX13|PDI13_ARATH Protein disulfide isomerase-like 1-359.900%Swiss-Prot高置信
Q67IX6水稻sp|Q67IX6|PDI14_ORYSJ Protein disulfide isomerase-like 1-462.200%Swiss-Prot高置信

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