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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G523860
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 135068102-135080186 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

600 bp · TkA02G523860|TK1151|cDNA

CTGGCTTCTAGCTGGCTTTGGGATTTTTCAATATATGTGTCGTTGTTATTCGGAAAAAGGTGTATGGTATCACTGAATTGACGAACATAAACACTCATTTTGGGTTCCCATGGAATCATTAAAGAGCGAAGAGGAGCTAGAGGTGATCGGAAAAGAGTCAAAGGATGTTGTTTTGTACGTCAATGGAGTCCGCAAAGTGCTCCCTGACGGTTTGGCCCACTTAACTCTCCTCAAGTATCTCAGAGATGTAGGTTTGACAA...

CDS

下载 CDS FASTA

402 bp · TkA02G523860|TK1151|CDS

ATGGAATCATTAAAGAGCGAAGAGGAGCTAGAGGTGATCGGAAAAGAGTCAAAGGATGTTGTTTTGTACGTCAATGGAGTCCGCAAAGTGCTCCCTGACGGTTTGGCCCACTTAACTCTCCTCAAGTATCTCAGAGATGTAGGTTTGACAAGAACGAAACTAGGATGTGGTGAAGGAGGTTGTGGGGCATGCACTGTAATGGTTTCTTACTTCGACCAAAATTCAAAGAAATGCATACACCAGGCAATCAATGCTTGCTT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

133 aa · TkA02G523860|TK1151|PROTEIN

MESLKSEEELEVIGKESKDVVLYVNGVRKVLPDGLAHLTLLKYLRDVGLTRTKLGCGEGGCGACTVMVSYFDQNSKKCIHQAINACLAPLYSVEGMHVITVEGLGNRKFGLHPIQVRAYREARSLWISVASPT

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G523860
TK1151 IDTkA02G523860
OH-1004 IDLXL04_013002
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)87.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 86.466 / OH-1004 6.371
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G523860
位置Chr02:135068102-135080186 (-)
描述Similar to XDH1: Xanthine dehydrogenase 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g34890 参与嘌呤分解代谢的关键酶。
Tandem orientation of duplicated xanthine dehydrogenase genes from Arabidopsis thaliana: differential gene expression and enzyme activities.2004 · DOI: 10.1074/jbc.m312929200
The plant Mo-hydroxylases aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase have distinct reactive oxygen species signatures and are induced by drought and abscisic acid.2005 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2005.02422.x
The RNAi-mediated silencing of xanthine dehydrogenase impairs growth and fertility and accelerates leaf senescence in transgenic Arabidopsis plants.2007 · DOI: 10.1093/pcp/pcm119
A critical role for ureides in dark and senescence-induced purine remobilization is unmasked in the Atxdh1 Arabidopsis mutant.2008 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2008.03440.x
Xanthine dehydrogenase AtXDH1 from Arabidopsis thaliana is a potent producer of superoxide anions via its NADH oxidase activity.2010 · DOI: 10.1007/s11103-009-9570-2
At4g34900 参与嘌呤分解代谢的关键酶。
The RNAi-mediated silencing of xanthine dehydrogenase impairs growth and fertility and accelerates leaf senescence in transgenic Arabidopsis plants.2007 · DOI: 10.1093/pcp/pcm119

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os03g0429800 参与嘌呤分解代谢的关键酶。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_013002 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000302 response to reactive oxygen species 生物过程
GO:0006145 purine nucleobase catabolic process 生物过程
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0042554 superoxide anion generation 生物过程
GO:0046110 xanthine metabolic process 生物过程
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0004854 xanthine dehydrogenase activity 分子功能
GO:0005506 iron ion binding 分子功能
GO:0016491 oxidoreductase activity 分子功能
GO:0051537 2 iron, 2 sulfur cluster binding 分子功能
GO:0071949 FAD binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G34890
ath:AT4G34900
dosa:Os03g0429800
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.323
排名 1 · TkA02G523860 · TK1151
质体0.304
排名 2 · TkA02G523860 · TK1151
细胞质0.241
排名 3 · TkA02G523860 · TK1151
过氧化物酶体0.088
排名 4 · TkA02G523860 · TK1151
细胞核0.079
排名 5 · TkA02G523860 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF27345Y4bG_N9-99 aa
PF00111Fer236-89 aa
PF10418DHODB_Fe-S_bind54-76 aa
PF13085Fer2_354-84 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G523860PF27345Y4bG_N9990.03814.5
TkA02G523860PF00111Fer236892.1e-0834.7
TkA02G523860PF10418DHODB_Fe-S_bind54760.06313.7
TkA02G523860PF13085Fer2_354840.1313.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8GUQ8拟南芥sp|Q8GUQ8|XDH1_ARATH Xanthine dehydrogenase 172.200%Swiss-Prot高置信
F4JLI5拟南芥sp|F4JLI5|XDH2_ARATH Xanthine dehydrogenase 274.000%Swiss-Prot高置信
Q6AUV1水稻sp|Q6AUV1|XDH_ORYSJ Xanthine dehydrogenase73.100%Swiss-Prot高置信

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