TkA02G522160 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA02G522160

当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 134660829-134663991 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1725 bp · TkA02G522160|TK1151|cDNA

TGTCTTCTTGCTTTACTGGTTGGTACGCCTCTTTCTCCGAGCTTTATCCCTCCCGCTCATTAAACACATGGCAATCACACCCGAAACGACAGCTCCTTTTGTTTTGATGGAGGTACTCTTATAGGGCCCACTTGCTGTTATGTCATGCGATTCTATTTAATCCCTTGATTCGACCACCATTGCACTTTATTTCCAAGATGATGCACAGACTTGTGAGATCAAGGTCTATAGCGGCCGTAGTATCAGCATCAAAACCTTCC...

CDS

下载 CDS FASTA

1251 bp · TkA02G522160|TK1151|CDS

ATGATGCACAGACTTGTGAGATCAAGGTCTATAGCGGCCGTAGTATCAGCATCAAAACCTTCCTCCCAACATCGAGGCGGGGTTGCGGCGTTGTTTTCAACTTCTATGCTGTTCGATGATACCCAGATACAGTTCAAAGAAAGCGTTGCTCAATTTGCCCAAGAACATATTGCTCCTCATGCCTCAAAAATAGACACTGCAAATAATTTCCCACAGGAAGTCAACTTATGGAAACTAATGGGAGACTTCAATCTCCACGG...

蛋白

下载蛋白 FASTA

416 aa · TkA02G522160|TK1151|PROTEIN

MMHRLVRSRSIAAVVSASKPSSQHRGGVAALFSTSMLFDDTQIQFKESVAQFAQEHIAPHASKIDTANNFPQEVNLWKLMGDFNLHGITAPVEYGGLGLGYLYHCIAMEEVSRASGSVGLSFGAHSNLCINQLVRNGNAAQKEKYLPKLISGEHVGALAMSEPNAGSDVVGMKCKAERVQGGYVLNGNKMWCTNGPIAQTLVVYAKTDIAARSKGITAFIIEKGMAGFSTAQKLDKLGMRGSDTCELVFDNCFVPNESVL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA02G522160`
TK1151 ID	TkA02G522160
OH-1004 ID	LXL04_013020
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	99.000
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA02G522160

位置 Chr02:134660829-134663991 (-)

描述 Similar to 2MBCD: 2-methylacyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At3g45300`	在黑暗诱导的糖饥饿期间，参与支链氨基酸、植醇和赖氨酸降解，为ETF/ETFQO复合物提供碳和电子。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os05g0125500`	线粒体异戊酰辅酶A脱氢酶。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_013020 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006552 L-leucine catabolic process 生物过程

GO:0009083 branched-chain amino acid catabolic process 生物过程

GO:0010230 alternative respiration 生物过程

GO:0033539 fatty acid beta-oxidation using acyl-CoA dehydrogenase 生物过程

GO:1902190 2-methylbutanoyl-CoA(4-) catabolic process 生物过程

GO:1902192 2-methylbut-2-enoyl-CoA(4-) metabolic process 生物过程

GO:1902196 isovaleryl-CoA(4-) catabolic process 生物过程

GO:1902198 3-methylbut-2-enoyl-CoA(4-) metabolic process 生物过程

GO:0005654 nucleoplasm 细胞组分

GO:0005739 mitochondrion 细胞组分

GO:0005759 mitochondrial matrix 细胞组分

GO:0005829 cytosol 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT3G45300

dosa:Os05g0125500

mmu:56357

sot:102589539

sot:102601763

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.898

排名 1 · TkA02G522160 · TK1151

细胞质0.056

排名 2 · TkA02G522160 · TK1151

细胞核0.029

排名 3 · TkA02G522160 · TK1151

质体0.027

排名 4 · TkA02G522160 · TK1151

过氧化物酶体0.018

排名 5 · TkA02G522160 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF02771Acyl-CoA_dh_N40-153 aa

PF08028Acyl-CoA_dh_250-70 aa

PF02770Acyl-CoA_dh_M157-252 aa

PF11794HpaB_N177-260 aa

PF00441Acyl-CoA_dh_1264-412 aa

PF08028Acyl-CoA_dh_2285-395 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA02G522160	`PF02771`	Acyl-CoA_dh_N	40	153	2.5e-37	128.4
TkA02G522160	`PF08028`	Acyl-CoA_dh_2	50	70	3.9e-11	44.1
TkA02G522160	`PF02770`	Acyl-CoA_dh_M	157	252	1.2e-25	90.2
TkA02G522160	`PF11794`	HpaB_N	177	260	0.0022	18.4
TkA02G522160	`PF00441`	Acyl-CoA_dh_1	264	412	3.2e-42	144.9
TkA02G522160	`PF08028`	Acyl-CoA_dh_2	285	395	3.9e-11	44.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9SWG0`	拟南芥	sp\|Q9SWG0\|IVD_ARATH Isovaleryl-CoA dehydrogenase, mitochondrial	84.600%	Swiss-Prot	高置信
`Q75IM9`	水稻	sp\|Q75IM9\|IVD_ORYSJ Isovaleryl-CoA dehydrogenase, mitochondrial	84.900%	Swiss-Prot	高置信

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