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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G516510
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 133099406-133099792 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

387 bp · TkA02G516510|TK1151|cDNA

ATGCAATTCGACGAAGCAGACACCTTATGTAAAAGAACCCTAGAAATCCACAGAGTCCACAGTCCACCAGCATCCCTCGAAGAAGCAGCAGACAGACGTCTAATGGCGCTCATATGCGAAGTAAAAGGATACTACGACTCAGCTCTAGAACACCTCGTACTCGCCAGCATGGCAATGATCGCAAATGGCCAAGACAACGAAGTCGCAGCAATCGATCTCAGCATCGGCAACATCTACCTCTCCCTCTCCCGTTTCGACGA...

CDS

下载 CDS FASTA

387 bp · TkA02G516510|TK1151|CDS

ATGCAATTCGACGAAGCAGACACCTTATGTAAAAGAACCCTAGAAATCCACAGAGTCCACAGTCCACCAGCATCCCTCGAAGAAGCAGCAGACAGACGTCTAATGGCGCTCATATGCGAAGTAAAAGGATACTACGACTCAGCTCTAGAACACCTCGTACTCGCCAGCATGGCAATGATCGCAAATGGCCAAGACAACGAAGTCGCAGCAATCGATCTCAGCATCGGCAACATCTACCTCTCCCTCTCCCGTTTCGACGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

128 aa · TkA02G516510|TK1151|PROTEIN

MQFDEADTLCKRTLEIHRVHSPPASLEEAADRRLMALICEVKGYYDSALEHLVLASMAMIANGQDNEVAAIDLSIGNIYLSLSRFDEAVFSYQKSLTVFKASKSDNHPSAPHPLSGEQVFSIRNNLEK

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G516510
TK1151 IDTkA02G516510
OH-1004 IDLXL04_029813
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)97.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G516510
位置Chr02:133099406-133099792 (-)
描述Similar to KLCR1: Protein KINESIN LIGHT CHAIN-RELATED 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g10840 蛋白质KINESIN LIGHT CHAIN-RELATED 1。 暂无已核实直接文献
At1g27500 蛋白 KINESIN LIGHT CHAIN-RELATED 3。 暂无已核实直接文献
At3g27960 蛋白质 相关动力蛋白轻链 2。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_029813 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009860 pollen tube growth 生物过程
GO:0031347 regulation of defense response 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005874 microtubule 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G27500
ath:AT3G27960
ath:AT4G10840
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.554
排名 1 · TkA02G516510 · TK1151
细胞核0.311
排名 2 · TkA02G516510 · TK1151
细胞膜0.098
排名 3 · TkA02G516510 · TK1151
线粒体0.075
排名 4 · TkA02G516510 · TK1151
高尔基体0.065
排名 5 · TkA02G516510 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13424TPR_122-52 aa
PF00515TPR_12-16 aa
PF07719TPR_22-16 aa
PF13176TPR_72-16 aa
PF13374TPR_102-18 aa
PF12968DUF38562-39 aa
PF09976TPR_2111-103 aa
PF14938SNAP25-104 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G516510PF13424TPR_122522.1e-0731.8
TkA02G516510PF00515TPR_12161.8e-0628.2
TkA02G516510PF07719TPR_22162.7e-0524.7
TkA02G516510PF13176TPR_72160.0004720.7
TkA02G516510PF13374TPR_102180.0006520.3
TkA02G516510PF12968DUF38562390.009216.7
TkA02G516510PF09976TPR_21111030.08113.4
TkA02G516510PF14938SNAP251040.001518.8
TkA02G516510PF07719TPR_234522.7e-0524.7
TkA02G516510PF13176TPR_735520.0004720.7
TkA02G516510PF13181TPR_836520.0005120.7
TkA02G516510PF00515TPR_142511.8e-0628.2
TkA02G516510PF13414TPR_1142510.05913.8
TkA02G516510PF13374TPR_1044520.0006520.3
TkA02G516510PF13374TPR_1053620.0006520.3
TkA02G516510PF13424TPR_12681092.1e-0731.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O81629拟南芥sp|O81629|KLCR1_ARATH Protein KINESIN LIGHT CHAIN-RELATED 178.000%Swiss-Prot高置信
F4HSX9拟南芥sp|F4HSX9|KLCR3_ARATH Protein KINESIN LIGHT CHAIN-RELATED 363.300%Swiss-Prot高置信
Q9LII8拟南芥sp|Q9LII8|KLCR2_ARATH Protein KINESIN LIGHT CHAIN-RELATED 256.800%Swiss-Prot高置信

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