TkA02G507960 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA02G507960

当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 130357357-130362684 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

2916 bp · TkA02G507960|TK1151|cDNA

TAGTCAAATTTCAGTTCTTGTCGCGAGTTGTCTCGTACGGAACGGGCCTTTCCTCTGTCTTCAAATCCCTAGGTTCGTACCATCTATCATTTTCCCTGCGTCTTTCTCTTCCTCATAGATTTTTTTTCGATCTTCTTCAGTTCATATATCTGAATCAAGTGAAAGGTTTGTGGTATCAGCTTTCGATTCCTGGTGCTTTGGAATCATAAGTCCCAGTCAGTTACTAAAGCTGATATGCTGTAGATATAAGCTATATTCAG...

CDS

下载 CDS FASTA

2022 bp · TkA02G507960|TK1151|CDS

ATGGAAGTCCCGAAAAAGAAGTTTCCCCTTGATGCAAAGGATTACAAGCTATATGAAGAAGTTGGTGAAGGAGTCAGTGCCTCTGTGTATAGGGCACTTTGTGTTCCATTGAATGAAATTGTCGCGATCAAGGTTCTTGATTTGGAAAAGTGTAATAATGACCTGGATGGAATTCGTCGGGAAGTACAAACAATGAGCTTGATCAATCACCCAAATTTATTAAAGGGATATTGCTCATTCACAACAGGCCATAATCTATG...

蛋白

下载蛋白 FASTA

673 aa · TkA02G507960|TK1151|PROTEIN

MEVPKKKFPLDAKDYKLYEEVGEGVSASVYRALCVPLNEIVAIKVLDLEKCNNDLDGIRREVQTMSLINHPNLLKGYCSFTTGHNLWVVMPYMAGGSCLHIMKSSFPDGFEEPVIATLLREVLKALIYLHAHGHIHRDVKAGNILVDYNGSIKLADFGVSACMFDAGDRQRSRNTFVGTPCWMAPEVMQQLHGYDFKADIWSFGITALELAHGHAPFSKYPPMKVLLMTLQNAPPGLDYERDKKFSKSFKEMVAACLVKD...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA02G507960`
TK1151 ID	TkA02G507960
OH-1004 ID	LXL04_031992
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	72.000
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 52.452 / OH-1004 59.628 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA02G507960

位置 Chr02:130357357-130362684 (+)

描述 Similar to fray2: Serine/threonine-protein kinase fray2

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At4g14480`	Ser/Thr蛋白激酶，在保卫细胞光受体信号传导的初步步骤中起作用。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_031992 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程

GO:0006611 protein export from nucleus 生物过程

GO:0006884 cell volume homeostasis 生物过程

GO:0006979 response to oxidative stress 生物过程

GO:0007165 signal transduction 生物过程

GO:0007231 osmosensory signaling pathway 生物过程

GO:0009410 response to xenobiotic stimulus 生物过程

GO:0035556 intracellular signal transduction 生物过程

GO:0038116 chemokine (C-C motif) ligand 21 signaling pathway 生物过程

GO:0038146 chemokine (C-X-C motif) ligand 12 signaling pathway 生物过程

GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程

GO:0070294 renal sodium ion absorption 生物过程

KEGG 基因交叉引用

ddi:DDB_G0276577

hsa:9943

mmu:108737

pon:100174028

ssc:397618

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.683

排名 1 · TkA02G507960 · TK1151

细胞核0.239

排名 2 · TkA02G507960 · TK1151

细胞膜0.201

排名 3 · TkA02G507960 · TK1151

高尔基体0.093

排名 4 · TkA02G507960 · TK1151

溶酶体／液泡0.051

排名 5 · TkA02G507960 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069Pkinase15-276 aa

PF07714PK_Tyr_Ser-Thr16-272 aa

PF03109ABC188-162 aa

PF01636APH110-150 aa

PF17667Pkinase_fungal118-199 aa

PF09969DUF2203118-149 aa

PF14531Kinase-like125-219 aa

PF26095CC_Bre1298-327 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA02G507960	`PF00069`	Pkinase	15	276	1.1e-60	206.0
TkA02G507960	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	16	272	3.7e-44	151.7
TkA02G507960	`PF03109`	ABC1	88	162	5.5e-05	23.2
TkA02G507960	`PF01636`	APH	110	150	0.2	12.1
TkA02G507960	`PF17667`	Pkinase_fungal	118	199	0.0014	18.1
TkA02G507960	`PF09969`	DUF2203	118	149	0.057	14.8
TkA02G507960	`PF14531`	Kinase-like	125	219	0.004	17.2
TkA02G507960	`PF26095`	CC_Bre1	298	327	1.0	10.3
TkA02G507960	`PF14531`	Kinase-like	301	361	0.004	17.2
TkA02G507960	`PF06005`	ZapB	301	326	6.7	8.0
TkA02G507960	`PF04899`	MbeD_MobD	326	345	0.0075	17.1
TkA02G507960	`PF07989`	Cnn_1N	448	469	6.1	7.8
TkA02G507960	`PF09969`	DUF2203	568	663	0.057	14.8
TkA02G507960	`PF26095`	CC_Bre1	570	660	1.0	10.3
TkA02G507960	`PF05130`	FlgN	574	665	0.36	12.0
TkA02G507960	`PF00069`	Pkinase	585	633	1.1e-60	206.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`O23304`	拟南芥	sp\|O23304\|BLUS1_ARATH Serine/threonine-protein kinase BLUS1	49.000%	Swiss-Prot	中等置信

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