TkA02G486720 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA02G486720

当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 124443589-124446194 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1865 bp · TkA02G486720|TK1151|cDNA

CCACGCGGTCCACGACATTCATTTCAAGGAATATGTGGATCATAATAAGCATTACTGTCTATGAACGATCCGATCCATCTAACGCCTAGATCCGATAAACGTCGTCGCCGGCACTTTCGAATGATATAAAATAGCTGTTCTTTGAGCGGGAAACGGTTACTTACAGTCGAGAAGTAATATAGATACAAGGTCAATTTCCTTCTTTTTCTCGATCCGCAGAGGCAACAGTTCGGTGATAGACGAATTATGGCACTATTTAT...

CDS

下载 CDS FASTA

1341 bp · TkA02G486720|TK1151|CDS

ATGGCACTATTTATCCCGATCATGTTGATTTTGGTTCTATTTAATAATCTGTGGTCGTCTGTGTTTGTGTCTGCCGTTGTCGATGATCCAACTATTCTCCAGCCTTCGCAGGCTGGTATCAATCGTCACACCATGTTTCTACCTCTTTTCCCTTCCCCTCCTAATTCCTCCCGGAGCTCCTCATTCTCCGTCCACGGGAATTCTCGGCGTCACCTCCAGAAATCCGATAGTCGCCGCCCGACCGCGCGGATGGCTCTCCA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

446 aa · TkA02G486720|TK1151|PROTEIN

MALFIPIMLILVLFNNLWSSVFVSAVVDDPTILQPSQAGINRHTMFLPLFPSPPNSSRSSSFSVHGNSRRHLQKSDSRRPTARMALHDDLIIDGYYTTWLWIGSPPKKFALIVDTGSTVTYVPCSTCEQCGNHEDPKFDPKSSSTYKSVKCNKNCTCDKPKKQCVYENLYAEFSTSSGVLGEDIISFGNQSKLSPQRAIFGCENVETGDLYSQHADGIIGLGRGDPSLVDQLVNKGVITDSFSLCYGGLDVVGGAMVLGG...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA02G486720`
TK1151 ID	TkA02G486720
OH-1004 ID	LXL04_013589
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)	78.000
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 98.655 / OH-1004 46.287 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA02G486720

位置 Chr02:124443589-124446194 (-)

描述 Similar to At1g65240: Aspartic proteinase-like protein 2

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g65240`	显示天冬氨酸蛋白水解活性。	暂无已核实直接文献
`At3g12700`	以偶氮酪蛋白为底物的天冬氨酸蛋白酶，通过调控淀粉积累和再动员，调节蔗糖、葡萄糖和果糖等内源糖的水平。	Misexpression of a chloroplast aspartyl protease leads to severe growth defects and alters carbohydrate metabolism in Arabidopsis.2012 · DOI: 10.1104/pp.112.204016
`At4g04460`	参与贮藏蛋白的加工和降解。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_013589 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006508 proteolysis 生物过程

GO:0009555 pollen development 生物过程

GO:0009846 pollen germination 生物过程

GO:0009860 pollen tube growth 生物过程

GO:0010183 pollen tube guidance 生物过程

GO:0030163 protein catabolic process 生物过程

GO:0005576 extracellular region 细胞组分

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0005829 cytosol 细胞组分

GO:0005886 plasma membrane 细胞组分

GO:0016020 membrane 细胞组分

GO:0090406 pollen tube 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G65240

ath:AT5G36260

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.364

排名 1 · TkA02G486720 · TK1151

细胞外0.304

排名 2 · TkA02G486720 · TK1151

内质网0.117

排名 3 · TkA02G486720 · TK1151

细胞质0.108

排名 4 · TkA02G486720 · TK1151

溶酶体／液泡0.092

排名 5 · TkA02G486720 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF14543TAXi_N96-260 aa

PF00026Asp96-432 aa

PF13975gag-asp_proteas108-141 aa

PF14541TAXi_C110-155 aa

PF14541TAXi_C280-432 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA02G486720	`PF14543`	TAXi_N	96	260	4.3e-35	122.2
TkA02G486720	`PF00026`	Asp	96	432	2.5e-30	106.7
TkA02G486720	`PF13975`	gag-asp_proteas	108	141	0.16	13.2
TkA02G486720	`PF14541`	TAXi_C	110	155	6.9e-25	88.4
TkA02G486720	`PF14541`	TAXi_C	280	432	6.9e-25	88.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9S9K4`	拟南芥	sp\|Q9S9K4\|ASP39_ARATH Aspartic proteinase 39	31.400%	Swiss-Prot	中等置信
`Q9LTW4`	拟南芥	sp\|Q9LTW4\|NANA_ARATH Aspartic proteinase NANA, chloroplast	25.000%	Swiss-Prot	低置信
`Q9XEC4`	拟南芥	sp\|Q9XEC4\|APA3_ARATH Aspartic proteinase A3	26.200%	Swiss-Prot	低置信

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