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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G408870
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 104003769-104005344 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1397 bp · TkA02G408870|TK1151|cDNA

TTTTTACTTCAAGAATATAAAAAAAAAAAAAACAAATCACTTTTCCAACATCCACCTCTCAATGCCCATCAAATCTCTCCCAAATTCGCCCACACACATGAGGAGTTAATCCATCCAAAAACCATCTCAGATATGCATTCCCACTTACCCATACCACCCTTCTCCCTCTTCTTCTTGTTCCTCATCATCATCCCAGTGGTCAAATCCGCACCAGATAACACCAATTTAGTATACAAAGGATGTGCAAAGCAATCTTTACA...

CDS

下载 CDS FASTA

1116 bp · TkA02G408870|TK1151|CDS

TTTTTACTTCAAGAATATAAAAAAAAAAAAAACAAATCACTTTTCCAACATCCACCTCTCAATGCCCATCAAATCTCTCCCAAATTCGCCCACACACATGAGGAGTTAATCCATCCAAAAACCATCTCAGATATGCATTCCCACTTACCCATACCACCCTTCTCCCTCTTCTTCTTGTTCCTCATCATCATCCCAGTGGTCAAATCCGCACCAGATAACACCAATTTAGTATACAAAGGATGTGCAAAGCAATCTTTACA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

371 aa · TkA02G408870|TK1151|PROTEIN

FLLQEYKKKKNKSLFQHPPLNAHQISPKFAHTHEELIHPKTISDMHSHLPIPPFSLFFLFLIIIPVVKSAPDNTNLVYKGCAKQSLQDPNGVYSSALSAIFGTLIQQSSKAKFFKTTSGSGQASITGLFQCRGDLTNLDCYNCVSRLPILMDKLCGKTVAARLQLLGCYMLYEVAGFSQISGMELLYKTCGGTSGGGNGFEERRDSAFGTLESGIGSGNGGFFTSNYESIYLLGQCEGDLGSSDCQNCVKSAVQRAEVEC...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G408870
TK1151 IDTkA02G408870
OH-1004 IDLXL04_014607
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)98.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 87.601 / OH-1004 99.387
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G408870
位置Chr02:104003769-104005344 (+)
描述Similar to PDLP2: Plasmodesmata-located protein 2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g04520 调节细胞间的运输。 暂无已核实直接文献
At2g33330 调节细胞间的运输。 暂无已核实直接文献
At5g43980 调节细胞间的运输。
The plasmodesmal protein PDLP1 localises to haustoria-associated membranes during downy mildew infection and regulates callose deposition.2014 · DOI: 10.1371/journal.ppat.1004496
At3g45860 富半胱氨酸受体样蛋白激酶4。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_014607 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0009615 response to virus 生物过程
GO:0010497 plasmodesmata-mediated intercellular transport 生物过程
GO:0046739 transport of virus in multicellular host 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009505 plant-type cell wall 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
GO:0001872 (1->3)-beta-D-glucan binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G04520
ath:AT2G33330
ath:AT3G04370
ath:AT5G37660
ath:AT5G43980
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.717
排名 1 · TkA02G408870 · TK1151
细胞外0.140
排名 2 · TkA02G408870 · TK1151
内质网0.096
排名 3 · TkA02G408870 · TK1151
细胞质0.077
排名 4 · TkA02G408870 · TK1151
细胞核0.039
排名 5 · TkA02G408870 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01657Stress-antifung81-173 aa
PF28789CPG3_C131-181 aa
PF01657Stress-antifung197-279 aa
PF28789CPG3_C234-287 aa
PF16046FAM76244-334 aa
PF17371DUF5393272-337 aa
PF04484QWRF289-345 aa
PF29052PGA28-like_dom290-356 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G408870PF01657Stress-antifung811731.2e-2487.5
TkA02G408870PF28789CPG3_C1311810.02615.8
TkA02G408870PF01657Stress-antifung1972791.2e-2487.5
TkA02G408870PF28789CPG3_C2342870.02615.8
TkA02G408870PF16046FAM762443340.003917.4
TkA02G408870PF17371DUF53932723373.66.7
TkA02G408870PF04484QWRF2893456.87.0
TkA02G408870PF29052PGA28-like_dom2903560.005617.1
TkA02G408870PF01657Stress-antifung3073141.2e-2487.5
TkA02G408870PF02439Adeno_E3_CR23403593.88.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q6NM73拟南芥sp|Q6NM73|PDLP2_ARATH Plasmodesmata-located protein 262.500%Swiss-Prot高置信
O22784拟南芥sp|O22784|PDLP3_ARATH Plasmodesmata-located protein 355.700%Swiss-Prot高置信
Q8GXV7拟南芥sp|Q8GXV7|PDLP1_ARATH Plasmodesmata-located protein 137.300%Swiss-Prot中等置信
Q9LZU4拟南芥sp|Q9LZU4|CRK4_ARATH Cysteine-rich receptor-like protein kinase 425.400%Swiss-Prot低置信

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