TkA02G405870 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA02G405870

当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 103141494-103143340 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1378 bp · TkA02G405870|TK1151|cDNA

CGGAAAGCTACTGATTCAAAATTGCCTTTTGGCTTTTACAATTCGATTTACTTGGACATCTACTTGCAACCTCATTCAAAGTTTTACTACATCGGAAGTATTTCTTGTAATTGATTTCAACGCATTAGGGTTTCAGTTTTGAAGTCGAAGCAACAGTCAGCTGCTTCTATCGTTAAGTCGGTGATATCGCGTTACTTTCGCCTTGGGGATTTCTGTAAATGGAGAACGATAAGTCTCCAAACCATGCGACGAGTGGTGAT...

CDS

下载 CDS FASTA

573 bp · TkA02G405870|TK1151|CDS

ATGGAGAACGATAAGTCTCCAAACCATGCGACGAGTGGTGATTCTGGTCGATTCAGTCACGACGTTAACAAAATGCCTGATAAACCACCTAAAACTACAGGCCATCGACACGCACACTCAGAAATTCTAACTCTACCCGATGATATCAACTTCGATAGTGATCTTGGCGTCGTGGGTGGCTTTGAAGGACCTTCCTTCTCTGACGACACCGAAGAAGATTTGTCCTCTATGTACCTTGACATGGATAAGTTCAATTCTTC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

190 aa · TkA02G405870|TK1151|PROTEIN

MENDKSPNHATSGDSGRFSHDVNKMPDKPPKTTGHRHAHSEILTLPDDINFDSDLGVVGGFEGPSFSDDTEEDLSSMYLDMDKFNSSSATSTFQASETLTPQTSSERPKVQKHHRHLMLKKPCLLPIFLRLLLLIQREQKGYWPIGSLLQGQRKERLDTLQNLKGKSKHLKQKQPLCLLNSPFYREIQIA

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA02G405870`
TK1151 ID	TkA02G405870
OH-1004 ID	LXL04_014666
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	94.900
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 62.105 / OH-1004 39.865 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA02G405870

位置 Chr02:103141494-103143340 (-)

描述 Similar to POSF21: Probable transcription factor PosF21

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At2g31370`	推测具有激活作用的转录因子。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os09g0516200`	转录因子可能参与维管发育和芽组织组织。	Transcription factor RF2a alters expression of the rice tungro bacilliform virus promoter in transgenic tobacco plants.2001 · DOI: 10.1073/pnas.121186398 Functional analysis of RF2a, a rice transcription factor.2003 · DOI: 10.1074/jbc.m304862200 RF2b, a rice bZIP transcription activator, interacts with RF2a and is involved in symptom development of rice tungro disease.2004 · DOI: 10.1073/pnas.0307687100 RF2a, a bZIP transcriptional activator of the phloem-specific rice tungro bacilliform virus promoter, functions in vascular development.1997 · DOI: 10.1093/emboj/16.17.5247

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_014666 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程

GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程

GO:0006952 defense response 生物过程

GO:0006970 response to osmotic stress 生物过程

GO:0007231 osmosensory signaling pathway 生物过程

GO:0009294 DNA-mediated transformation 生物过程

GO:0009652 thigmotropism 生物过程

GO:0009970 cellular response to sulfate starvation 生物过程

GO:0045596 negative regulation of cell differentiation 生物过程

GO:0051170 import into nucleus 生物过程

GO:1902358 sulfate transmembrane transport 生物过程

GO:0005634 nucleus 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G43700

ath:AT2G31370

ath:AT2G40620

dosa:Os03g0336200

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.519

排名 1 · TkA02G405870 · TK1151

细胞质0.421

排名 2 · TkA02G405870 · TK1151

线粒体0.098

排名 3 · TkA02G405870 · TK1151

细胞膜0.083

排名 4 · TkA02G405870 · TK1151

内质网0.072

排名 5 · TkA02G405870 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

没有找到该查询的结果。

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q04088`	拟南芥	sp\|Q04088\|POF21_ARATH Probable transcription factor PosF21	70.600%	Swiss-Prot	低置信
`Q69IL4`	水稻	sp\|Q69IL4\|RF2A_ORYSJ Transcription factor RF2a	52.200%	Swiss-Prot	低置信

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