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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G371410
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 94542338-94545484 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2702 bp · TkA02G371410|TK1151|cDNA

GTTTTAGTGTGGAAATAAAAAAAAGCTGGTTGGTGAGGTTTTGGATCTTGCTCGCGACTTCACAGTTGAAACACCAGTCTACCATTCTTCCATATCCGCTGTAGGGTTTTGAGGTTTTCTCCCAAACCTGAACAAAAATTCATCATCTGTAACCAAAATTTGTTCAGTTGATCGATTCGCAGGTTTACTTATCAACCATGGTTGGGAAAGTAGACGCCGCGAAGGGCGGTGCGAAGTCTTTGCAGTCGCCGGCGTCCAAT...

CDS

下载 CDS FASTA

2241 bp · TkA02G371410|TK1151|CDS

ATGGTTGGGAAAGTAGACGCCGCGAAGGGCGGTGCGAAGTCTTTGCAGTCGCCGGCGTCCAATCAAGCTACCTCCAAGCCCGATCTGTCATCCATTTCCACAACATTCTCATTCAAAACCCTGAAATTGAAAACGAAGCAACAAGAGTTGTTGATCCGAGTCACAATCCTCGGCCTCGTCTACATTTTAGCTTTCATCACTCGTCTCTTCAGCGTTCTCCGCTACGAGAGTATGATTCATGAATTCGATCCATATTTCAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

746 aa · TkA02G371410|TK1151|PROTEIN

MVGKVDAAKGGAKSLQSPASNQATSKPDLSSISTTFSFKTLKLKTKQQELLIRVTILGLVYILAFITRLFSVLRYESMIHEFDPYFNYRTTLYLTEKGFYEFWNWFDSESWYPLGRIIGGTLYPGLMVTAAIIYWTLKFLRFAVHIREVCVLTAPFFASNTTIVAYFFGKELWDSGAGLVAAALIAICPGYISRSVAGSYDNEGVAIFALLLTFYLFVKAVNTGSLAWSLASAFGYFYMVSAWGGYVFIINLIPLYVLVL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G371410
TK1151 IDTkA02G371410
OH-1004 IDLXL04_015056
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)98.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G371410
位置Chr02:94542338-94545484 (-)
描述Similar to STT3B: Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit STT3B
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g34130 寡糖转移酶（OST）复合物的催化亚基，该复合物催化将特定糖链（在真核生物中为Glc(3)Man(9)GlcNAc(2)）从脂质载体多烯二磷酸转移到新生多肽链中Asn-X-Ser/Thr共识序列的天冬酰胺残基上，这是蛋白质N-糖基化的第一步。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os04g0675500 寡糖转移酶（OST）复合物的催化亚基，该复合物催化将特定糖链（在真核生物中为Glc(3)Man(9)GlcNAc(2)）从脂质载体多烯二磷酸转移到新生多肽链中Asn-X-Ser/Thr共识序列的天冬酰胺残基上，这是蛋白质N-糖基化的第一步。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_015056 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006487 protein N-linked glycosylation 生物过程
GO:0009101 glycoprotein biosynthetic process 生物过程
GO:0043687 post-translational protein modification 生物过程
GO:0180058 protein co-translational transfer of dolichol-linked oligosaccharide 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分
GO:0005789 endoplasmic reticulum membrane 细胞组分
GO:0008250 oligosaccharyltransferase complex 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0160226 oligosaccharyltransferase complex A 细胞组分
GO:0004579 dolichyl-diphosphooligosaccharide-protein glycotransferase activity 分子功能
GO:0046872 metal ion binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G34130
ddi:DDB_G0285159
dosa:Os04g0675500
hsa:3703
pon:100174363
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

内质网0.869
排名 1 · TkA02G371410 · TK1151
细胞质0.069
排名 2 · TkA02G371410 · TK1151
细胞核0.059
排名 3 · TkA02G371410 · TK1151
线粒体0.053
排名 4 · TkA02G371410 · TK1151
细胞膜0.045
排名 5 · TkA02G371410 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF02516STT354-452 aa
PF22627AglB_core-like85-111 aa
PF26623Psb35213-228 aa
PF26623Psb35267-288 aa
PF19885DUF6358268-321 aa
PF26623Psb35329-348 aa
PF20604DUF6798552-572 aa
PF27869HaoB_nitrify557-603 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G371410PF02516STT3544528.1e-118395.2
TkA02G371410PF22627AglB_core-like851110.00219.2
TkA02G371410PF26623Psb352132289.46.6
TkA02G371410PF26623Psb352672889.46.6
TkA02G371410PF19885DUF63582683210.0813.8
TkA02G371410PF26623Psb353293489.46.6
TkA02G371410PF20604DUF67985525720.0813.4
TkA02G371410PF27869HaoB_nitrify5576030.0003620.7
TkA02G371410PF22627AglB_core-like5636280.00219.2
TkA02G371410PF21436STT3-PglB_core5696273.8e-0524.9
TkA02G371410PF19885DUF63586266400.0813.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FX21拟南芥sp|Q9FX21|STT3B_ARATH Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit STT3B87.100%Swiss-Prot高置信
Q7XQ88水稻sp|Q7XQ88|STT3B_ORYSJ Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit STT3B85.200%Swiss-Prot高置信

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