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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G367580
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 93524211-93527538 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1251 bp · TkA02G367580|TK1151|cDNA

ATGACAGAGCATTCAAGTAAGGTACACATAATTGTTGGATCACTTGGTGGTTTTGTCTTCTTCCTTCTTGTTGCTTCTGGGTTATTTTATTGTCGATTGAAGAAGTGTAAGAAGAATAAAGAAGAGTTGAAGGGGGCTGACGCTGTTAACTACAATGATAAATATCTACGGTTGGCAACCAATAATTTCACTGAAGAGAATAGTATAGGGAGAGGTGGATTTGGTGAAGTATTCAAGGCAATACATGATAATAACCAAGT...

CDS

下载 CDS FASTA

1176 bp · TkA02G367580|TK1151|CDS

ATGACAGAGCATTCAAGTAAGGTACACATAATTGTTGGATCACTTGGTGGTTTTGTCTTCTTCCTTCTTGTTGCTTCTGGGTTATTTTATTGTCGATTGAAGAAGTGTAAGAAGAATAAAGAAGAGTTGAAGGGGGCTGACGCTGTTAACTACAATGATAAATATCTACGGTTGGCAACCAATAATTTCACTGAAGAGAATAGTATAGGGAGAGGTGGATTTGGTGAAGTATTCAAGGCAATACATGATAATAACCAAGT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

391 aa · TkA02G367580|TK1151|PROTEIN

MTEHSSKVHIIVGSLGGFVFFLLVASGLFYCRLKKCKKNKEELKGADAVNYNDKYLRLATNNFTEENSIGRGGFGEVFKAIHDNNQVLAVKKLEVGDAKAKLEFENEVLLISQIHHRNLLRLLGWSTEGSNLLLVLEYMPNGSLDSFLWGSKRRSLNWKQRFDIILGIARGLAHLHNECHVKIIHRDIKSSNILLDDHFQPKIADFGLAKFQPEDQTHVVTTFAGTLGYAAPEYAVNGHLSDKVDTYSLGVVMLEIISCR...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G367580
TK1151 IDTkA02G367580
OH-1004 IDLXL04_015108
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)94.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 97.187 / OH-1004 62.871
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G367580
位置Chr02:93524211-93527538 (-)
描述Similar to CRK3: Cysteine-rich receptor-like protein kinase 3
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g56130 可能的 LRR 受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At1g56130。 暂无已核实直接文献
At1g56140 可能的 LRR 受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At1g56140。 暂无已核实直接文献
At1g70520 富半胱氨酸受体样蛋白激酶2。 暂无已核实直接文献
At1g53420 可能的 LRR 受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At1g53420。 暂无已核实直接文献
At5g40380 富含半胱氨酸的受体样蛋白激酶 42。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_015108 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程
GO:0006979 response to oxidative stress 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0009626 plant-type hypersensitive response 生物过程
GO:0010193 response to ozone 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
GO:0052545 callose localization 生物过程
GO:0072593 reactive oxygen species metabolic process 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G19090
ath:AT1G70520
ath:AT1G70530
ath:AT4G23230
ath:AT5G40380
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.768
排名 1 · TkA02G367580 · TK1151
细胞质0.149
排名 2 · TkA02G367580 · TK1151
细胞核0.085
排名 3 · TkA02G367580 · TK1151
内质网0.084
排名 4 · TkA02G367580 · TK1151
高尔基体0.037
排名 5 · TkA02G367580 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF29364TED611-41 aa
PF00069Pkinase63-330 aa
PF03109ABC165-91 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr66-331 aa
PF26433WH_HI_009673-111 aa
PF01636APH78-176 aa
PF14531Kinase-like152-274 aa
PF12330Haspin_kinase156-220 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G367580PF29364TED611410.01715.7
TkA02G367580PF00069Pkinase633301.1e-48166.6
TkA02G367580PF03109ABC165910.1811.6
TkA02G367580PF07714PK_Tyr_Ser-Thr663312.7e-46158.7
TkA02G367580PF26433WH_HI_0096731110.008717.2
TkA02G367580PF01636APH781760.1112.9
TkA02G367580PF14531Kinase-like1522740.01415.3
TkA02G367580PF12330Haspin_kinase1562200.06313.0
TkA02G367580PF01636APH1632100.1112.9
TkA02G367580PF03109ABC11782160.1811.6
TkA02G367580PF17667Pkinase_fungal1802310.04613.2
TkA02G367580PF26433WH_HI_00962593090.008717.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
C0LGH2拟南芥sp|C0LGH2|Y1561_ARATH Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g5613044.500%Swiss-Prot中等置信
C0LGH3拟南芥sp|C0LGH3|Y5614_ARATH Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g5614043.900%Swiss-Prot中等置信
Q9CAL3拟南芥sp|Q9CAL3|CRK2_ARATH Cysteine-rich receptor-like protein kinase 240.900%Swiss-Prot中等置信
C0LGG7拟南芥sp|C0LGG7|Y1534_ARATH Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g5342042.500%Swiss-Prot中等置信
Q9FNE1拟南芥sp|Q9FNE1|CRK42_ARATH Cysteine-rich receptor-like protein kinase 4246.400%Swiss-Prot中等置信

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