TkA02G362390 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA02G362390

当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 92169321-92173652 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

974 bp · TkA02G362390|TK1151|cDNA

AAAAAACAAATTGAAAGAGTACATTAGTCATTGCGACCAACTCACAAAAAATCTAGAATCGCTTCTCAATTTGAAGCCTTTTTGTACCGATCGAATTTTGTTTAGAAGTCACAGTGATTTCTTTACAGTTTCTTTAATGATTATAAAGAGAGAAGCATTGAACCCCACCTCAGCCGCCTCACTCATTACTATATTTTAACGCACACATATCTGAAATCCTAAAGAATGAAACCCATGGATGATGTATGGAAAGACATCAG...

CDS

下载 CDS FASTA

522 bp · TkA02G362390|TK1151|CDS

ATGAAACCCATGGATGATGTATGGAAAGACATCAGCAGCCTTCCATCTCTTCACCACCCTACCGCCACCCATCACTTCCAAGATTTCTTTGCTCCGGCTGCAGCCAGGCCTGGTGGAAGTGGCGGTACTGGACCCACCCTCCACCACCCTTCTCCACCGTCACCGTCACCGCCACCACCACCACCCACCACCATGTTAAGCCTGAGTACTTCTGGTAACTCAGGACACGATCAAGAACCAACACCTAATAATTCATCAAC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

173 aa · TkA02G362390|TK1151|PROTEIN

MKPMDDVWKDISSLPSLHHPTATHHFQDFFAPAAARPGGSGGTGPTLHHPSPPSPSPPPPPPTTMLSLSTSGNSGHDQEPTPNNSSTGATSPVSNQRSPPEYSDKFKRLMKNRESAARSRARKQVRADELEQEVLRLTKENANLKRLQKEFCSASTAQFPKKPKLHRTRSAPF

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA02G362390`
TK1151 ID	TkA02G362390
OH-1004 ID	LXL04_015140
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)	100.000
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA02G362390

位置 Chr02:92169321-92173652 (+)

描述 Similar to FD: Protein FD

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At4g35900`	由FT促进开花所需的转录因子。	暂无已核实直接文献
`At2g17770`	由FT促进开花所需的转录因子。	暂无已核实直接文献
`At3g56850`	结合到胚胎特异性元件和 Dc3 基因启动子的 ABA 响应元件 (ABRE)。	暂无已核实直接文献
`At2g41070`	结合胚胎特异元件和Dc3基因启动子的ABA响应元件（ABRE），以及Em1基因启动子的ABRE。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_015140 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程

GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程

GO:0009414 response to water deprivation 生物过程

GO:0009648 photoperiodism 生物过程

GO:0009651 response to salt stress 生物过程

GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程

GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程

GO:0009909 regulation of flower development 生物过程

GO:0009911 positive regulation of flower development 生物过程

GO:0010115 regulation of abscisic acid biosynthetic process 生物过程

GO:0010255 glucose mediated signaling pathway 生物过程

GO:0045893 positive regulation of DNA-templated transcription 生物过程

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G45249

ath:AT2G17770

ath:AT2G41070

ath:AT3G56850

ath:AT4G35900

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.973

排名 1 · TkA02G362390 · TK1151

细胞质0.092

排名 2 · TkA02G362390 · TK1151

细胞膜0.030

排名 3 · TkA02G362390 · TK1151

内质网0.017

排名 4 · TkA02G362390 · TK1151

质体0.008

排名 5 · TkA02G362390 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07586HXXSHH3-25 aa

PF16101PRIMA149-74 aa

PF07586HXXSHH64-143 aa

PF12325TMF_TATA_bd103-153 aa

PF07716bZIP_2105-146 aa

PF14197Cep57_CLD_2105-143 aa

PF00170bZIP_1106-146 aa

PF03131bZIP_Maf107-157 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA02G362390	`PF07586`	HXXSHH	3	25	0.16	12.2
TkA02G362390	`PF16101`	PRIMA1	49	74	2.1	8.8
TkA02G362390	`PF07586`	HXXSHH	64	143	0.16	12.2
TkA02G362390	`PF12325`	TMF_TATA_bd	103	153	0.036	14.9
TkA02G362390	`PF07716`	bZIP_2	105	146	1.3e-09	38.6
TkA02G362390	`PF14197`	Cep57_CLD_2	105	143	0.085	13.7
TkA02G362390	`PF00170`	bZIP_1	106	146	2.9e-10	40.8
TkA02G362390	`PF03131`	bZIP_Maf	107	157	0.04	15.2
TkA02G362390	`PF28121`	VPA1267	109	149	0.064	14.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q84JK2`	拟南芥	sp\|Q84JK2\|FD_ARATH Protein FD	56.500%	Swiss-Prot	低置信
`Q7PCC6`	拟南芥	sp\|Q7PCC6\|FDP_ARATH bZIP transcription factor 27	50.700%	Swiss-Prot	低置信
`Q9LES3`	拟南芥	sp\|Q9LES3\|AI5L2_ARATH ABSCISIC ACID-INSENSITIVE 5-like protein 2	55.100%	Swiss-Prot	低置信
`Q9C5Q2`	拟南芥	sp\|Q9C5Q2\|AI5L3_ARATH ABSCISIC ACID-INSENSITIVE 5-like protein 3	55.200%	Swiss-Prot	低置信

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