RubberDandelionOmics 橡胶草多组学网站
更多
转录组数据查询 注释 橡胶合成 转录因子预测 靶基因 蛋白关联网络 重测序 工具 下载
ZH EN

本页使用教程

基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G064630
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 16779163-16781061 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1413 bp · TkA02G064630|TK1151|cDNA

ATGGTCAGCTCCGCATACTTCCTTCTGTTCTTCATCCCTTATGCAGCTTCATTAACTTTTAATTTCACAAATATTGGTCCACAAAACCAGTTCAAGGAAATAATAATTACAGGCGGTGGATATATAGCCGGTGACGGAATCCAAGTAACCCCTGTTACGGAAGGTCCTTGGAGTGATAGGGTAGGACGGGCAACATACATAAAACCGCTTCATCTCTGGGATAACACGTCAGGTGAGCTAATAAGCTTCACTAGTGATTT...

CDS

下载 CDS FASTA

1413 bp · TkA02G064630|TK1151|CDS

ATGGTCAGCTCCGCATACTTCCTTCTGTTCTTCATCCCTTATGCAGCTTCATTAACTTTTAATTTCACAAATATTGGTCCACAAAACCAGTTCAAGGAAATAATAATTACAGGCGGTGGATATATAGCCGGTGACGGAATCCAAGTAACCCCTGTTACGGAAGGTCCTTGGAGTGATAGGGTAGGACGGGCAACATACATAAAACCGCTTCATCTCTGGGATAACACGTCAGGTGAGCTAATAAGCTTCACTAGTGATTT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

470 aa · TkA02G064630|TK1151|PROTEIN

MVSSAYFLLFFIPYAASLTFNFTNIGPQNQFKEIIITGGGYIAGDGIQVTPVTEGPWSDRVGRATYIKPLHLWDNTSGELISFTSDFSFVIDSTSNSYYGDGLTFFLAENNSVIFNSDVMKHQFVAVEFDTFANPEWDPRNSSNDLIGDHVGISINSLTSVASQKWFSNITGGKVCHASITYDSISKGLSPDQVKGKNQKLLVVSLVVGLSVLITCIAVIAFCILRKKESMQEEQGFNVGMSNDFEMGRGPRKFSYQELA...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G064630
TK1151 IDTkA02G064630
OH-1004 IDLXL04_017231
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)54.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 91.702 / OH-1004 82.019
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G064630
位置Chr02:16779163-16781061 (+)
描述Similar to LECRK91: L-type lectin-domain containing receptor kinase IX.1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g65600 促进过氧化氢H(2)O(2)的生成和细胞死亡。 暂无已核实直接文献
At5g10530 促进过氧化氢H(2)O(2)的生成和细胞死亡。 暂无已核实直接文献
At5g55830 参与对病原卵菌马铃薯晚疫病菌和辣椒晚疫病菌的抗性反应。 暂无已核实直接文献
At4g02420 参与对病原性卵菌 Phytophthora infestans 和 Phytophthora capsici 以及病原性细菌 Pseudomonas syringae 的抗性反应。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os04g0531400 含凝集素结构域的受体激酶，参与盐胁迫反应。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_017231 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0002229 defense response to oomycetes 生物过程
GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程
GO:0009626 plant-type hypersensitive response 生物过程
GO:0009862 systemic acquired resistance, salicylic acid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0140426 pathogen-associated molecular pattern receptor signaling pathway 生物过程
GO:1900426 positive regulation of defense response to bacterium 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G55550
ath:AT5G06740
ath:AT5G10530
ath:AT5G55830
ath:AT5G65600
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.783
排名 1 · TkA02G064630 · TK1151
内质网0.116
排名 2 · TkA02G064630 · TK1151
细胞质0.082
排名 3 · TkA02G064630 · TK1151
溶酶体／液泡0.062
排名 4 · TkA02G064630 · TK1151
细胞核0.044
排名 5 · TkA02G064630 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00139Lectin_legB18-194 aa
PF06165GH94_b-supersand37-85 aa
PF03388Lectin_leg-like72-134 aa
PF22812CR_prot_dom_plant196-228 aa
PF00069Pkinase267-288 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr269-284 aa
PF00069Pkinase285-450 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr285-450 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G064630PF00139Lectin_legB181943.1e-35122.6
TkA02G064630PF06165GH94_b-supersand37850.3510.7
TkA02G064630PF03388Lectin_leg-like721340.03214.3
TkA02G064630PF22812CR_prot_dom_plant1962280.2612.5
TkA02G064630PF00069Pkinase2672883.3e-30106.1
TkA02G064630PF07714PK_Tyr_Ser-Thr2692841.3e-2384.3
TkA02G064630PF00069Pkinase2854503.3e-30106.1
TkA02G064630PF07714PK_Tyr_Ser-Thr2854501.3e-2384.3
TkA02G064630PF01636APH2933240.3711.2
TkA02G064630PF17667Pkinase_fungal3043710.007315.8
TkA02G064630PF14531Kinase-like3043910.3310.9
TkA02G064630PF25861PglZ_2nd3304030.1713.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LSL5拟南芥sp|Q9LSL5|LRK92_ARATH L-type lectin-domain containing receptor kinase IX.234.100%Swiss-Prot中等置信
Q9LXA5拟南芥sp|Q9LXA5|LRK91_ARATH L-type lectin-domain containing receptor kinase IX.135.600%Swiss-Prot中等置信
Q9FHG4拟南芥sp|Q9FHG4|LRKS7_ARATH Probable L-type lectin-domain containing receptor kinase S.751.100%Swiss-Prot低置信
O81291拟南芥sp|O81291|LRK44_ARATH L-type lectin-domain containing receptor kinase IV.448.600%Swiss-Prot低置信
Q7XUN6水稻sp|Q7XUN6|SIT2_ORYSJ L-type lectin-domain containing receptor kinase SIT250.800%Swiss-Prot低置信

JBrowse

在基因组浏览器中查看