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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G061090
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 15934542-15937228 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2147 bp · TkA02G061090|TK1151|cDNA

ATAAAACTATGTCAACTCCCATAAAAAGTCAAACAGTCACGTTCAAGGTCGAGTTCTAGAAGTTCTTGAAAAGCAGGCGTGTGGGGGCCTAACGACAAACACCAGTTCAAAGATGCCACACCATTTCAAATTCAATCAATTGACAGATTCTGTTCAACTAATCCTCCGTATTTCTTCAACCTCCCCACCTCCACCTACTCTGAGCTCTTCAATCAGAGATTTCTTAAGGTCGCTGGGTTCTTAATTAATGGTGGTTGTTT...

CDS

下载 CDS FASTA

1668 bp · TkA02G061090|TK1151|CDS

ATGGTGGTTGTTTCCAGCCGTTTCGTCAATCCCGCCGTTCTTCCTGATTCCGGTTCCAATTCCAACACGATGATGAATCTCCATTGTAATTCAACCGCCTCTTCTTCTTTGACATACGTCGGTTCTCGGCTTCGCGTCAATTTTAAGCCAGTTAGTGTTAGGACATTGAGTCCCAATAGAAGATCAGGATGCGTAAACCTAAAATGCGAGATGGCGTCGGTATCGGATTCAGACTCCAGATCGGTATCCGTATCGAATTC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

555 aa · TkA02G061090|TK1151|PROTEIN

MVVVSSRFVNPAVLPDSGSNSNTMMNLHCNSTASSSLTYVGSRLRVNFKPVSVRTLSPNRRSGCVNLKCEMASVSDSDSRSVSVSNSSSFSAFELLKTSAAERYTKEKSGIMVVGLSFHTAPVEIREKLSIPLAELPQAITELCALNHIEEAAVLSTCNRMEIYAVALSQHRGLKEITEWMSKISGVPISDIRQHQLILHEKEATKHLFEVSSGLDSLILGEGQILSQVKDVVKASQGVPGFDRKISGLFKHAITVGKRV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G061090
TK1151 IDTkA02G061090
OH-1004 IDLXL04_017273
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)96.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G061090
位置Chr02:15934542-15937228 (-)
描述Similar to HEMA1: Glutamyl-tRNA reductase 1, chloroplastic
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g58290 催化 NADPH 依赖性谷氨酰-tRNA 还原为谷氨酸 1-半醛。
Divergent regulation of the HEMA gene family encoding glutamyl-tRNA reductase in Arabidopsis thaliana: expression of HEMA2 is regulated by sugars, but is independent of light and plastid signalling.2002 · DOI: 10.1023/a:1016081114758
Light regulation of chlorophyll biosynthesis at the level of 5-aminolevulinate formation in Arabidopsis.1994 · DOI: 10.1105/tpc.6.2.265
At1g09940 催化 NADPH 依赖性谷氨酰-tRNA 还原为谷氨酸 1-半醛。
Divergent regulation of the HEMA gene family encoding glutamyl-tRNA reductase in Arabidopsis thaliana: expression of HEMA2 is regulated by sugars, but is independent of light and plastid signalling.2002 · DOI: 10.1023/a:1016081114758
Induction of isoforms of tetrapyrrole biosynthetic enzymes, AtHEMA2 and AtFC1, under stress conditions and their physiological functions in Arabidopsis.2007 · DOI: 10.1104/pp.107.100065
A second and differentially expressed glutamyl-tRNA reductase gene from Arabidopsis thaliana.1996 · DOI: 10.1007/bf00049321

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_017273 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006779 porphyrin-containing compound biosynthetic process 生物过程
GO:0006782 protoporphyrinogen IX biosynthetic process 生物过程
GO:0006783 heme biosynthetic process 生物过程
GO:0006979 response to oxidative stress 生物过程
GO:0009416 response to light stimulus 生物过程
GO:0015995 chlorophyll biosynthetic process 生物过程
GO:0033014 tetrapyrrole biosynthetic process 生物过程
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009536 plastid 细胞组分
GO:0031969 chloroplast membrane 细胞组分
GO:0032991 protein-containing complex 细胞组分
GO:0008883 glutamyl-tRNA reductase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ag:CAA63140
ath:AT1G09940
ath:AT1G58290
csv:101208135
csv:101220615
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

质体0.894
排名 1 · TkA02G061090 · TK1151
线粒体0.145
排名 2 · TkA02G061090 · TK1151
细胞质0.045
排名 3 · TkA02G061090 · TK1151
细胞核0.030
排名 4 · TkA02G061090 · TK1151
过氧化物酶体0.017
排名 5 · TkA02G061090 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01177Asp_Glu_race102-221 aa
PF05201GlutR_N114-264 aa
PF16574CEP209_CC5165-220 aa
PF028262-Hacid_dh_C213-235 aa
PF16912Glu_dehyd_C271-372 aa
PF01488Shikimate_DH279-417 aa
PF028262-Hacid_dh_C281-337 aa
PF00899ThiF290-322 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G061090PF01177Asp_Glu_race1022210.03214.8
TkA02G061090PF05201GlutR_N1142642.6e-49167.6
TkA02G061090PF16574CEP209_CC51652200.002818.5
TkA02G061090PF028262-Hacid_dh_C2132350.01215.7
TkA02G061090PF16912Glu_dehyd_C2713720.003817.4
TkA02G061090PF01488Shikimate_DH2794174.3e-41140.9
TkA02G061090PF028262-Hacid_dh_C2813370.01215.7
TkA02G061090PF00899ThiF2903221.8e-0524.8
TkA02G061090PF13241NAD_binding_72933680.0009120.5
TkA02G061090PF01408GFO_IDH_MocA2933670.0914.2
TkA02G061090PF03446NAD_binding_22953899.5e-0523.2
TkA02G061090PF02254TrkA_N2953420.0001622.7
TkA02G061090PF03435Sacchrp_dh_NADP2953450.0003121.8
TkA02G061090PF02558ApbA2953420.002618.1
TkA02G061090PF02719Polysacc_synt_22953370.01115.7
TkA02G061090PF027373HCDH_N2953380.02215.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
P42804拟南芥sp|P42804|HEM11_ARATH Glutamyl-tRNA reductase 1, chloroplastic60.400%Swiss-Prot高置信
P49294拟南芥sp|P49294|HEM12_ARATH Glutamyl-tRNA reductase 2, chloroplastic60.500%Swiss-Prot高置信

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