TkA02G011050 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA02G011050

当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 2428468-2432190 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

2147 bp · TkA02G011050|TK1151|cDNA

ATAGTATCGTTTTTCTGTGACAAATGTTATTTTATTTATTTGAATTATTATTTAATTAAATTATATATTTAATATTATTCTAACTAAATAAGTGTATTGATAAAAGAAGAAAGATTATTTAATTGCTAAAAAATTATGAGCTTTTGGAACAAATTCAATTGTTCCCCAATTTGGGGCAGGGAGTTGTTCGATTTCTAGATTCTGTGATCTGGAGTGGATTAAAGTGTAAATTACAGACTAATTTTTCCAAGATTTTTCGT...

CDS

下载 CDS FASTA

1110 bp · TkA02G011050|TK1151|CDS

ATGGAGGTCACAAATGTCACCGAGTATCAAGCGATTGCCAAAGAGAAGTTGCCAAAGATGGTGTACGACTATTATGCTTCAGGTGCTGAGGATCAGTGGACTTTGGAAGAGAACAGAAATGCTTTCGCAAGAATCCTGTTTAGGCCTCGGATTCTTATTGATGTGAGCAAGATTGACATGACTACCACAATTTTGGGATTCAAGATCTCCATGCCAATAATGATCGCCCCAACTGCCATGCAGAAGATGGCACACCCTGA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

369 aa · TkA02G011050|TK1151|PROTEIN

MEVTNVTEYQAIAKEKLPKMVYDYYASGAEDQWTLEENRNAFARILFRPRILIDVSKIDMTTTILGFKISMPIMIAPTAMQKMAHPDGEYATARAASSAGTIMTLSSWATSSVEEVASTGPGIRFFQLYVYKDRNVVAQLVRRAERAGFKAIALTVDTPRLGRREADIKNRFTLPPFLTLKNFEGLDLGKMDEANDSGLASYVAGQIDRTLSWKDVKWLQTITTMPILVKGVITAEDTRLAIQAGAAGIIVSNHGARQLD...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA02G011050`
TK1151 ID	TkA02G011050
OH-1004 ID	LXL04_017684
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)	100.000
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA02G011050

位置 Chr02:2428468-2432190 (-)

描述 Similar to GLO1: (S)-2-hydroxy-acid oxidase GLO1

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At3g14420`	催化甘醇酸氧化为乙醛酸，同时 O2 被还原为 H2O2。	暂无已核实直接文献
`At3g14415`	催化甘醇酸氧化为乙醛酸，同时 O2 被还原为 H2O2。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`UniProt: B8B7C5`	催化甘醇酸氧化为乙醛酸，同时 O2 被还原为 H2O2。	暂无已核实直接文献
`Os07g0152900`	催化甘醇酸氧化为乙醛酸，同时 O2 被还原为 H2O2。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_017684 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0009853 photorespiration 生物过程

GO:0009854 oxidative photosynthetic carbon pathway 生物过程

GO:0010109 regulation of photosynthesis 生物过程

GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程

GO:0046718 symbiont entry into host cell 生物过程

GO:0050665 hydrogen peroxide biosynthetic process 生物过程

GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0005777 peroxisome 细胞组分

GO:0005829 cytosol 细胞组分

GO:0009506 plasmodesma 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT3G14415

ath:AT3G14420

dosa:Os07g0152900

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

过氧化物酶体0.561

排名 1 · TkA02G011050 · TK1151

线粒体0.244

排名 2 · TkA02G011050 · TK1151

细胞质0.130

排名 3 · TkA02G011050 · TK1151

质体0.070

排名 4 · TkA02G011050 · TK1151

细胞核0.041

排名 5 · TkA02G011050 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01070FMN_dh13-355 aa

PF00478IMPDH56-87 aa

PF01180DHO_dh61-103 aa

PF02225PA138-160 aa

PF04481DUF561168-253 aa

PF02581TMP-TENI210-252 aa

PF01180DHO_dh216-248 aa

PF05690ThiG217-261 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA02G011050	`PF01070`	FMN_dh	13	355	2.9e-138	461.4
TkA02G011050	`PF00478`	IMPDH	56	87	7e-06	26.0
TkA02G011050	`PF01180`	DHO_dh	61	103	0.0047	16.9
TkA02G011050	`PF02225`	PA	138	160	0.028	15.3
TkA02G011050	`PF04481`	DUF561	168	253	0.0031	17.5
TkA02G011050	`PF02581`	TMP-TENI	210	252	0.0069	16.5
TkA02G011050	`PF01180`	DHO_dh	216	248	0.0047	16.9
TkA02G011050	`PF05690`	ThiG	217	261	0.0009	19.4
TkA02G011050	`PF00977`	His_biosynth	222	262	0.0076	16.4
TkA02G011050	`PF03060`	NMO	228	342	1.3e-05	25.5
TkA02G011050	`PF02225`	PA	235	257	0.028	15.3
TkA02G011050	`PF04481`	DUF561	258	311	0.0031	17.5
TkA02G011050	`PF00478`	IMPDH	264	311	7e-06	26.0
TkA02G011050	`PF01180`	DHO_dh	265	313	0.0047	16.9
TkA02G011050	`PF02581`	TMP-TENI	266	307	0.0069	16.5
TkA02G011050	`PF00977`	His_biosynth	268	312	0.0076	16.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9LRR9`	拟南芥	sp\|Q9LRR9\|GLO1_ARATH Glycolate oxidase 1	91.100%	Swiss-Prot	高置信
`Q9LRS0`	拟南芥	sp\|Q9LRS0\|GLO2_ARATH Glycolate oxidase 2	90.400%	Swiss-Prot	高置信
`B8B7C5`	水稻	sp\|B8B7C5\|GLO5_ORYSI Glycolate oxidase 5	89.900%	Swiss-Prot	高置信
`Q6YT73`	水稻	sp\|Q6YT73\|GLO5_ORYSJ Glycolate oxidase 5	89.900%	Swiss-Prot	高置信

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